福建省自然科学基金(2009J01084) 作品数:5 被引量:20 H指数:3 相关作者: 陈伟 蒋际谋 刘浩 陈晓静 申艳红 更多>> 相关机构: 福建省农业科学院 福建农林大学 更多>> 发文基金: 福建省自然科学基金 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
利用cDNA-AFLP技术分析龙眼子叶胚基因表达差异 被引量:1 2009年 分别提取‘红核子’龙眼(Dimdcarpus longan Lour.)谢花后35d(早期)和50d(晚期)子叶胚RNA,建立cDNA-AFLP分析体系,获得指纹图谱。对41个差异片段回收克隆和序列分析,表明其中21个与已知功能基因具有高度同源性,这些基因的功能主要涉及侧生器官的离轴极性、糖酵解、能量代谢、离子转运、细胞壁伸长、细胞周期调控、RNA转录、RNA翻译和调控、蛋白磷酸化调控和降解、信号转导等;其余片段与已知基因的同源性较低或没有。 卢秉国 申艳红 蒋际谋 陈晓静 陈伟 吕柳新关键词:龙眼 RNA提取 CDNA-AFLP 焦核龙眼种子败育的cDNA-AFLP分析 被引量:1 2011年 采用cDNA-AFLP技术对龙眼(Dimocarpus longan Lour.)正常和败育的种子进行了差异表达分析,并对差异明显的片段进行回收、克隆、测序,以及利用NCBI中的BLAST数据库已知序列进行同源性比对。结果表明:在11条重复性较好的差异片段中有3个Transcript-derived fragments(TDFs)分别与Ca2+-ATP酶、纤维素酶、质体ATP/ADP转运蛋白具有较高的相似性,其中TDF2和TDF7下调表达,TDF5上调表达,这可能影响了龙眼种子发育过程中的许多重要代谢途径,从而引起龙眼种子败育;有4个TDFs与一些hypothetical蛋白的序列相似;另有4个TDFs在蛋白数据库中未找到匹配的序列,核酸数据库中比对的结果也显示较高的E-值,说明为非同源基因。 唐晰 谢东丽 刘潇 蒋际谋 梁文裕 陈伟关键词:龙眼 种子败育 CDNA-AFLP ‘白核’龙眼种子败育不同时期差异蛋白分析 被引量:7 2009年 以‘白核’龙眼种子为试验材料,比较两种蛋白质的提取方法,确定了酚抽法提取龙眼种子蛋白。应用蛋白质组学研究技术,分析了龙眼种子败育4个不同时期的蛋白质组变化,共发现21个差异蛋白,其中9个上调表达,12个下调表达。通过MALDI/TOF/TOF-MS/MS质谱分析和蛋白质数据库检索,共鉴定出12个差异蛋白,分别为胞质苹果酸脱氢酶、丙酮酸脱氢酶、磷酸甘油酸变位酶、RuBisCO大亚基结合蛋白α、β亚基、17kDHSP、抗坏血酸过氧化物酶、胞质抗坏血酸过氧化物酶、半胱氨酸蛋白酶、Des-sication-relatedprotein以及两个未知蛋白。这些鉴定出的差异蛋白质与能量和物质代谢、分子伴侣功能、自由基清除和抗氧化作用、细胞凋亡等生理过程密切相关,可能参与了龙眼种子败育过程。 刘浩 柳燕贞 王静 王静 郑少泉 蒋际谋关键词:龙眼 败育 差异蛋白 A Proteomic Approach for Protein Identification and Analysis in Aborted Seed of Longan <正>We optimized the longan seed protein extraction method and the electrophoresis conditions, and obtained the... Hao Liu1, Yan-zhen Liu1, Ji-mou Jiang2, Shao-quan Zheng2, Wei Chen1* 1College of Life Sciences, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China 2Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350013, China关键词:PROTEOMICS 文献传递 龙眼子叶胚3-磷酸甘油醛脱氢酶基因的cDNA克隆及序列分析 被引量:8 2009年 从龙眼子叶胚中分离得到一个大量表达的表达序列标签(EST),该EST编码序列与金鱼草3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)基因的同源性为84%,利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术成功克隆了龙眼GAPDH基因全长序列.序列分析表明,龙眼GAPDH基因的cDNA全长为1395 bp,包括一个长1008 bp、编码336个氨基酸的开放阅读框(ORF),5′端非编码区(UTR)长71 bp,3′-UTR长316 bp.龙眼GAPDH基因编码的氨基酸序列与水稻、葡萄、小果野蕉、拟南芥、银杏等GAPDH基因的氨基酸序列同源性均高达85%以上,该基因在GenBank中的登录号为FJ694011. 卢秉国 何炜毅 申艳红 蒋际谋 陈晓静 陈伟 吕柳新关键词:龙眼 3-磷酸甘油醛脱氢酶 基因克隆 龙眼种子蛋白质组双向电泳技术的优化 被引量:3 2010年 为建立适用于龙眼(Dimdcarpus longanaLour.)种子蛋白质组研究的双向电泳技术,对龙眼种子蛋白质的IEF、平衡时间及染色方法等关键步骤进行了优化。结果显示,龙眼种子蛋白质主要分布在pH4-7范围内,采用酚抽法,在聚焦达到50000 W.h的情况下能充分地聚焦,等电聚焦后经平衡缓冲液Ⅰ还原15 min,再经平衡缓冲液Ⅱ二次平衡20 min,考马斯亮蓝染色,24 cm IPG胶条上样量为1.2 mg时,在龙眼种子双向电泳图谱上检测到1000个多个蛋白点,蛋白点清晰,分辨率较好。本研究所建立的一套适用于龙眼种子蛋白质组分析的双向电泳方法分辨率和重复性较高,重复样品图谱间的相关系数在0.88-0.945之间。 蒋际谋 刘浩 王玲霞 刘潇 陈立涵 陈伟关键词:龙眼 种子 双向电泳 蛋白质组