国家自然科学基金(30471502)
- 作品数:5 被引量:41H指数:3
- 相关作者:贺佳吴骋贺宪民张智坚武建虎更多>>
- 相关机构:第二军医大学复旦大学更多>>
- 发文基金:上海市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学理学更多>>
- 关联规则在医学领域中应用的探索被引量:7
- 2005年
- 通过将医学资料中的多维数据集转化为事务数据库进行了关联规则的挖掘,并利用列联表的X2检验和可信度的提高来进行规则剪除。模拟数据和实际资料的分析表明该方法所得到的关联规则基本揭示了数据所蕴涵的信息,在大样本、多变量医学资料中具有一定的应用价值。
- 武建虎贺佳贺宪民张智坚吴骋马修强
- 关键词:关联规则X^2检验数据库
- SVMs在微阵列表达数据分析中的应用被引量:1
- 2005年
- 微阵列技术允许同时录制成百万的基因表达水平。但由于经费和工艺的限制,目前研究者获得的表达数据集往往包含少量的样本,而基因表达的测量值却有上万条。很多传统的统计方法无法分析这样的数据,本文结合数据挖掘中统计学习理论的相关知识,详细介绍了一种有监督分析方法———支持向量机(SVMs)在微阵列表达数据分析中的应用。
- 吴骋王志勇贺佳贺宪民
- 关键词:微阵列基因表达数据支持向量机
- 关联规则及其在肝癌病人资料分析中的应用被引量:20
- 2006年
- 目的探讨关联规则方法在肝癌病人资料分析中的应用研究。方法采用基于列联表的χ2检验和可信度提高的规则剪除方法,通过设置最小支持度和最小可信度对肝癌资料进行关联规则分析。结果设置最小支持度和最小可信度分别为0·10和0·60,样本例数1457例,所得结果根据列联系数C>0·45获得51条规则,作用度lift>2·4得到19条规则;考虑规则后件为肝癌是否复发得到19条规则。这些规则揭示了影响肝癌复发的变量值及变量值的组合,并且反映了数据中高度相关的变量值间的关系。结论在肝癌病人资料中应用关联规则分析可以揭示多因素间潜在的、有价值的关系。
- 武建虎贺佳贺宪民张智坚马修强吴骋
- 关键词:肝癌关联规则数据挖掘
- SVMs在基因表达谱数据分析中的应用被引量:2
- 2006年
- 吴骋王志勇贺佳
- 关键词:基因表达谱数据分析基因表达水平基因表达数据微阵列技术
- 基因调控网络模型构建方法被引量:13
- 2006年
- 基因调控网络的研究从基因之间相互作用的角度揭示复杂的生命现象,是功能基因组学研究的重要内容,也是当前生物信息学研究的前沿。基因芯片技术在生物信息学中的应用为基因调控网络的研究提供大量可供研究与分析的基础数据。本文介绍了基因调控网络的起源与近年来的发展情况,详细说明了基因调控网络构建的前提与基本原理,并分析几种经典调控网络模型:布尔网络模型、线性及非线性模型和贝叶斯网络模型,阐述各种模型构建的基本原理和算法,结合基因芯片的数据特点,探讨各种模型的优缺点及其适用情况,对各种网络模型进行分析与总结。
- 虞慧婷吴骋柳伟伟付旭平贺佳
- 关键词:基因调控网络非线性模型贝叶斯模型