广东省中医药管理局基金(2008355)
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
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- 相关机构：广东医学院华中科技大学更多>>
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- EB病毒miRNAs在鼻咽癌细胞株C666-1和CNE-2Z中的差异性表达分析被引量：4
- 2010年
- 目的:探讨ebv-miRNA在低分化NPC细胞株C666-1(EBV+)和CNE-2Z(EBV表达水平随传代次数增加而逐渐降低)中的差异性表达进而分析其功能。方法:常规培养NPC细胞株C666-1和CNE-2Z,分别提取总RNA并进行质检;RT-PCR检测LMP-1和LMP-2A mRNA的表达以判断EBV的感染情况;miRNA芯片技术检测EBV miRNAs的表达并对其表达谱进行差异性分析;荧光定量RT-PCR进行验证;复习文献了解ebv-miRNA调控的靶基因以了解其功能。结果:从C666-1和CNE-2Z两株细胞抽提的总RNA纯度高,A260/A280>2.0,A260/A230>2.1,RNA完整性好。C666-1具有比CNE-2Z更高的LMP-1和LMP-2A mRNA表达。ebv-miRNA表达谱的差异分析表明39个ebv-miRNAs中19个在两株细胞显著差异性表达;荧光定量RT-PCR结果证实ebv-miR-BHRF1-1和ebv-miR-BART14*在C666-1中表达升高而ebv-miR-BART8*表达降低,与芯片结果趋势一致;复习文献,EBV miRNAs功能远不清楚,少数已知的靶基因涉及信号转导、转录调控、细胞凋亡、增殖、免疫反应和病毒DNA复制等方面。结论:ebv-miRNA在低分化NPC中具有差异性表达并广泛参与基因调控。不同NPC细胞中EBV miRNA表达差异预示着基于ebv-miRNA的NPC个性化治疗的可能性。
- 揭伟罗泊涛陈锦姜汉国申志华
- 关键词：鼻咽癌EPSTEIN表达谱
- 应用微阵列芯片分析人不同分化鼻咽癌细胞株miRNA的表达被引量：4
- 2010年
- 目的探讨分化角化型鼻咽癌(NPC)细胞系CNE1和未分化非角化型NPC细胞系C666-1中微小RNA(miRNA)的差异性表达,预测异常表达miRNA的靶基因。方法常规培养NPC细胞株CNE1和C666-1,分别提取总RNA并进行质检;miRNA芯片技术检测miRNAs的表达并对其表达谱进行差异性分析;采用荧光定量RT-PCR进行验证;运用MIRanda、TargetScan、PicTar、Diana-microT软件预测可能调控的靶基因。结果通过对NPC中has-miRNA表达谱的差异分析,在CNE1,677个miRNA中上调27个、下调25个。miRNA-323-3p和miRNA-574-5p分别是2个最显著差异表达的miRNA。实时定量PCR证实miRNA-323-3p在CNE1中高表达,而miRNA-574-5p低表达。对上述2个miRNA进行靶基因预测,分别筛选出28和18个靶基因。结论获得了分化角化型和未分化非角化型NPC细胞miRNA的差异表达谱,部分miRNA可能通过调控其靶基因而参与NPC的发病机制。
- 揭伟王晓燕罗泊涛黄培春敖启林申志华
- 关键词：鼻咽癌微小RNA表达谱
