国家科技重大专项(2008ZX1004-002)
- 作品数:1 被引量:2H指数:1
- 相关作者:陈盛霞曹建平姜旭淦吴亮沈玉娟更多>>
- 相关机构:中国疾病预防控制中心江苏大学更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 采用实时PCR技术比较不同方法提纯隐孢子虫卵囊DNA效果被引量:2
- 2009年
- 目的比较不同方法提纯隐孢子虫卵囊DNA的效果。方法将分离纯化的隐孢子虫卵囊分别加入美国Promega公司(简称Promega)和上海捷瑞公司(简称捷瑞)基因组DNA纯化试剂盒的裂解液、2%TritonX-100和5%异硫氰酸胍,同时联合使用冻融法、蛋白酶K法和声裂法裂解卵囊,用试剂盒法或Chelex-100法提纯卵囊基因组DNA,用实时PCR测定隐孢子虫卵囊囊壁蛋白(COWP)基因拷贝数,以Promega试剂盒为参照比较不同纯化方法的提纯效果。结果Promega试剂盒的裂解液裂解隐孢子虫卵囊的效果最好,纯化所得卵囊COWP基因拷贝数可达(6.45~9.86)×106;其他依次为捷瑞试剂盒的裂解液[(2.38~3.69)×106]、5%异硫氰酸胍[(1.27~21.29)×105]和2%TritonX-100[(2.06~866.70)×103]。冻融法+蛋白酶K法+声裂法提纯隐孢子虫卵囊DNA效果最佳,其次为冻融法+声裂法和蛋白酶K法+声裂法,冻融法+蛋白酶K法效果最差。结论冻融法+蛋白酶K法+声裂法联合使用能使卵囊DNA的提纯效率达到最大,捷瑞基因组DNA纯化试剂盒和5%异硫氰酸胍裂解法提纯隐孢子虫卵囊DNA可获得与Promega试剂盒相近的效果。
- 陈盛霞吴亮沈玉娟章秋霞李婷婷姜旭淦徐馀信曹建平
- 关键词:隐孢子虫卵囊实时PCRDNA提纯
- 不规则毛霉全基因组测序及生物信息学分析
- 近十余年我国已经陆续有18例特殊的原发性皮肤接合菌病报道(其中6例发生于江苏省),均由不规则毛霉(Mucor irregularis)(也称多变根毛霉,Rhizomucor variabilis)所引起,令人感兴趣的是,...
- 鲍炜刘维达