国家自然科学基金(81171878) 作品数:2 被引量:18 H指数:2 相关作者: 缪小平 龚静 娄娇 李娇元 钟荣 更多>> 相关机构: 华中科技大学 浙江大学 北京协和医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 霍英东青年教师基金 湖北省杰出青年人才基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
基于常见遗传变异和传统风险因素的中国南方汉族人群结直肠癌风险预测模型研究 被引量:12 2015年 目的 基于结直肠癌全基因组关联研究(GWAS)发现的易感位点,联合传统风险因素建立中国南方汉族人群结直肠癌风险预测模型.方法 对1 066例结直肠癌患者和3 880例健康对照的21个GWAS候选位点进行基因分型,分析其与结直肠癌易感性之间的关联.通过遗传风险评分(GRS)和加权遗传风险评分(wGRS)计算显著候选位点的联合效应.以不同方式组合遗传风险评分和传统风险因素,构建结直肠癌风险预测模型,并绘制受试者工作特征曲线评价模型优劣性.结果 7个候选位点与结直肠癌易感性显著相关.随着风险评分的升高,人群患结直肠癌的风险也随之升高(GRS:P=0.002 6,wGRS:P<0.000 1),相比于四分位分组中最低一组,GRS和wGRS最高的一组OR值分别为1.33 (95%CI:1.12~1.58,P=0.001 0)和1.76 (95% CI:1.45 ~ 2.14,P<0.000 1).联合传统风险因素和wGRS的模型为最优模型,其曲线下面积为0.593(95%CI:0.573~ 0.613).结论 结直肠癌易感位点间存在显著的联合作用.相比于传统风险因素模型,传统风险因素结合加权遗传风险评分模型能更好预测结直肠癌的患病风险. 李娇元 常江 朱颖 杨洋 龚雅洁 柯俊涛 娄娇 钟荣 龚静 夏肖萍 缪小平关键词:结直肠癌 单核苷酸多态性 后全基因组关联研究时代的机遇与挑战 被引量:6 2012年 自从2005年报道第一项视网膜黄斑变性的全基因组关联性研究(genome-wide association studies,GWAS)以来,利用GWAS策略进行复杂疾病关联分析的研究不断涌现。截止到2011年11月16日,包括国内在食管癌、胃癌和胰腺癌领域的研究[1-3],至今已有1449项GWAS公开发表, 刘丽 缪小平 林东昕关键词:全基因组 视网膜黄斑变性 食管癌 胰腺癌