国家自然科学基金(31228022)
- 作品数：3 被引量：1H指数：1
- 相关作者：陈佳刘文阁徐前明朱兴全徐晓佩更多>>
- 相关机构：安徽农业大学中国农业科学院兰州兽医研究所更多>>
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- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- GRA24基因在不同地理位置和宿主来源的刚地弓形虫株间的序列变异(英文)
- 2015年
- 目的检验来自不同地理位置和宿主,且归属于不同基因型的刚地弓形虫的GRA24基因的序列变异情况,评价GRA24基因能否作为研究弓形虫种群遗传学的理想标记。方法对所检刚地弓形虫的GRA24基因进行了序列比对,并使用了最大简约法,最大似然法以及贝叶斯法对所检验的虫株进行了系统进化分析。结果所检的虫株GRA24基因的有两种长度：6 240bp和6 264bp。所检GRA24基因的A＋T含量为40.82%~53.52%。序列比对显示有173个核酸变异位点（0.05%~0.2%）,其中有133变异位点个在9个内含子上,40个变异位点在8个外显子上;使用的3种方法构建的GRA24基因系统进化树的结果一致,GRA24基因不能将3种典型基因型的弓形虫虫株区分开。结论 GRA24基因的序列变异率较低,所以GRA24基因并不是一个研究弓形虫种群遗传学的理想标记。
- 徐晓佩刘文阁陈佳朱兴全徐前明
- 关键词：刚地弓形虫弓形虫病
- Rhoptry protein 47 gene sequence: a potential novel genetic marker for population genetic studies of Toxoplasma gondii
- Toxoplasma gondii, an obligate intracellular parasite, is able to infect many animal species and humans, and c...
- Jin-Lei WangTing-Ting LiSi-Yang HuangZhong-Yuan LiHong-Rui NingXing-Quan Zhu
- 关键词：TOXOPLASMAGONDIIRHOPTRYPROTEINGENOTYPING
- 文献传递
- MIC5基因在13株不同基因型的刚地弓形虫中的序列变异（英文）
- 2015年
- 目的检验13株来自不同宿主和地理位置,且归属于不同型的刚地弓形虫的MIC5基因的序列变异情况,评价MIC5能否作为研究种群遗传学的理想标记。方法对13株刚地弓形虫的MIC5基因进行了序列比对,并使用了最大简约法,最大似然法以及贝叶斯法对所检验的虫株进行了系统进化分析。结果所有的虫株其MIC5基因的长度都为1 975bp。序列比对显示有52个核酸变异位点(0-1.3%),其中有38变异位点个在3个内含子上,14个变异位点在4个外显子上。所检基因的A+T含量为:51.70%-51.95%。结论 MIC5基因的序列变异率较低,所以MIC5基因并不是一个研究种群遗传学的理想标记。
- 刘文阁徐晓佩陈佳朱兴全徐前明
- 关键词：刚地弓形虫系统进化分析
- 刚地弓形虫GRA25基因的克隆及序列分析被引量：1
- 2016年
- 本研究旨在对来源于不同宿主和地理分布的22株弓形虫的GRA25基因进行PCR扩增并测序,对获得的GRA25基因序列进行比对,利用MP和ML两种方法对不同分离株的GRA25基因构建系统进化树。利用生物信息学软件将弓形虫RH株的GRA25基因翻译成氨基酸序列,对其编码蛋白的生物学特征进行分析。结果显示,弓形虫GRA25基因序列有2种长度,分别为939和948bp。序列比对结果显示,GRA25基因在不同虫株间有82个核苷酸变异位点,变异率为0～4.4%。进化分析结果显示,用GRA25基因不能区分弓形虫基因Ⅰ型和Ⅱ型虫株。生物信息学分析预测弓形虫GRA25蛋白含有7个亲水区域,10个α-螺旋,3个β-折叠,8个无规则卷曲和8个潜在的线性B淋巴细胞抗原表位。本研究结果表明,GRA25基因不能作为标记分子区分不同基因型的弓形虫虫株,但可能作为疫苗候选分子研制新型抗弓形虫基因疫苗或表位肽疫苗。
- 徐晓佩刘文阁张念章陈佳周东辉朱兴全徐前明
- 关键词：刚地弓形虫生物信息学分析
