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23种新的水稻boxC/D snoRNA的鉴定及功能分析被引量：1: 2003年; 构建了一个水稻核内小分子RNA的cDNA文库,经初步筛选获得30种boxC/D snoRNA.与目前已鉴定的水稻snoRNA序列相比较,除了U14等7种snoRNA之外,其余23种均为首次在水稻中发现.在23种新的水稻boxC/D snoRNA中,11种只存在于水稻中,其余12种中,6种为植物特有,6种在酵母、动物和拟南芥中存在同源分子.17种snoRNA指导了水稻5.8S,18S和25S rRNA中24个2＇-O-核糖甲基化修饰核苷,其中19个靶位点的修饰已被证实.6种新的水稻snoRNA不具有与rRNA互补的反义序列,是一类新的snoRNA.研究结果表明,通过构建核内小分子RNA的cDNA文库可以有效地分离和鉴定水稻中新的snoRNA.这些新发现的snoRNA对于阐明植物snoRNA基因组织和表达以及rRNA中2＇-0-核糖甲基化修饰位点的产生机制具有重要意义.; 卓敏周惠黄展鹏梁丹陈春龙陈月琴屈良鹄; 关键词：水稻 SNORNA CDNA文库

果蝇3个新的小分子非编码RNA的鉴定被引量：5: 2006年; 通过比较基因组和分子生物学方法分析了果蝇属中5种果蝇全基因组内含子区域的保守序列，获得了3个新的非编码RNA基因．其中一个为具有典型的box C／D家族保守元件及结构特征的核仁小分子RNA基因，其功能序列可介导28S rRNA的C2673位点的核糖甲基化修饰．另外两个为miRNA基因，其转录序列可形成典型的miRNA前体茎环结构：在果蝇发育的4个时期均可表达产生长度为23个核苷酸的成熟RNA分子．结果还表明，在长度为100—500bp区间的黑腹果蝇基因内含子中存在396个多物种保守序列（MCIS），这些序列除编码小分子RNA外，还可能与影响基因转录或转录后加工的顺式元件有关．; 贺华良周惠肖振东曾献芬陈俊宇郑涛屈良鹄; 关键词：果蝇 BOX SNORNA MIRNA 内含子

Identification of three novel noncoding RNAs from Drosophila melanogaster被引量：2: 2006年; 三新奇小非编码的 RNA 从 D 的保存 intronicregions 被识别。由使用比较基因组学方法和分子的生物学途径的 melanogaster。Oneis 以一个 combinated 方法的新奇 snoRNA，它 snoRNAfamily 显示典型地代表 C/D 盒子的结构的特征并且为在 C2673 指导 D.melanogaster 28S rRNA 的 2''-O-methylation 拥有一个 10-nt-long rRNA 反感觉元素。另外的二是预言先锋采用已知的 miRNA 的 astem 环结构特征的 miRNAs。二 miRNAs 基因看起来有无所不在的表示侧面， ~ 23-nt RNA 抄本由北弄污检测了。我们的学习 revealed396 多种类 intronic 保存了与长度 from100 在 introns 嵌套到 500 bp 的序列(MCIS ) 。除了编码的小 RNA， MCIS 可能作为涉及基因抄写或 post-transcriptional 处理的 c/s-acting 元素工作。; HE Hualiang ZHOU Hui XIAO Zhendong ZENG Xianfen CHEN Junyu ZHENG Tao QU Lianghu; 关键词：果蝇 MIRNA 分子生物学

粟酒裂殖酵母中3个新的box H/ACA snoRNA的鉴定及意义被引量：1: 2003年; 真核生物rRNA和snRNA中特定位点的假尿嘧啶化修饰是由box H/ACA snoRNA指导的,这些RNA通常具有保守的H和ACA元件以及“发夹-铰链-发夹-尾”的二级结构。通过筛选cDNA文库,从粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中鉴定了3个新的box H/ACA snoRNA,分别命名为SP12,SP16和SP20。这些小分子RNA 3’末端都具有ACA类元件,其二级结构中包含2或3个较大的类似发夹的结构。尽管SP20的H元件并不典型,但能折叠成典型box H/ACA snoRNA的二级结构,推测其具有指导18S rRNA上U1208和U1053两个位点的假尿嘧啶化修饰的功能。相反,SP12和SP16的二级结构不同于SP20,并且也没有与rRNA或snRNA互补的反义元件,所以被称为“功能未知的向导snoRNA(orphanguide RNA”,其功能尚有待阐明。SP12和SP16的基因都位于2个编码蛋白质基因的间隔区,SP16snoRNA是从一个较大的RNA前体剪切加工而来。有趣的是,SP20基因位于一个预测的蛋白质基因的编码区中,但转录方向相反。Northern杂交和RT-PCR分析都无法检测到该蛋白质基因的mRNA,表明该基因在细胞中的表达是不存在的。这是粟酒裂殖酵母中一个推测编码蛋白质的基因位点反向编码一个小分子RNA的首次报道。; 瞿国胜周惠于传贺陈晓屈良鹄; 关键词：粟酒裂殖酵母基因鉴定基因组测序

两个新的粟酒裂殖酵母boxH/ACAsnoRNA的鉴定、功能分析及进化意义被引量：5: 2005年; 通过构建粟酒裂殖酵母核小分子RNA的CDNA文库,发现并鉴定了两个新的非编码RNA,分别命名为Sp15-70和Sp18-61.生物信息学分析揭示这两个RNA均具有典型的box H／ACA snoRNA二级结构特征和与rRNA互补的配对区,推测Sp15-70具有指导25S rRNA中U2401和U2298假尿嘧啶修饰的功能;Sp18-61具有指导18S rRNA中U208和25S rRNA中U2341假尿嘧啶修饰的功能.采用CMC-引物延伸法证实:在粟酒裂殖酵母rRNA中,这4个预测位点确实为假尿嘧啶修饰核苷酸.Sp15-70和Sp18-61均由单拷贝基因编码,分别位于粟酒裂殖酵母染色体Ⅰ和Ⅲ上蛋白质基因的间隔区,在其5'端上游均发现了典型的TATA box元件,表明它们都是独立转录的基因.比较分析这两个snoRNA在不同生物中的功能性同源分子,发现snoRNA基因在进化的过程中发生了广泛的分子重组和转位.; 李思光周惠张鹏罗玉萍屈良鹄; 关键词：粟酒裂殖酵母 BOX SNORNA 基因进化真核生物

粟酒裂殖酵母SnoRNA snR90基因缺失株的筛选鉴定: 2007年; snR90是在粟酒裂殖酵母中发现的一种单基因编码的box H/ACA类snoRNA.在利用遗传手段在粟酒裂殖酵母基因组中敲除了snR90基因后,通过选择性培养基、PCR、Northern杂交这一系列方法筛选鉴定出snR90基因缺失株.该基因缺失株ΔsnR90的成功构建对snR90功能的分析很有的意义.; 陈燕飞; 关键词：核仁小分子RNA 粟酒裂殖酵母同源重组 NORTHERN杂交

snoSeeker:扫描人类基因组中向导和孤儿snoRNA的计算机程序包被引量：1: 2007年; 杨建华张筱晨黄展鹏周惠黄绵波张澍陈月琴屈良鹄; 关键词：SNORNA SNRNA 人类基因组计算机孤儿

Identification and functional analysis of 23 novel box C/D snoRNAs from Oryza sativa被引量：2: 2003年; ZHUO Min, ZHOU Hui, HUANG Zhanpeng, LIANG Dan, CHEN Chunlong, CHEN Yueqin & QU Lianghu Key Laboratory of Gene Engineering of the Ministry of Education, Biotechnology Research Center, Zhongshan University, Guangzhou 510275, China; 关键词：功能分析 CDNA SNORNAS

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