您的位置: 专家智库 > >

海南省自然科学基金(808122)

作品数:6 被引量:24H指数:3
相关作者:尹绍武齐兴柱张本霍蕊杜民更多>>
相关机构:海南大学中国热带农业科学院更多>>
发文基金:海南省自然科学基金海南省教育厅高等学校科学研究项目国家自然科学基金更多>>
相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>

文献类型

  • 6篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学
  • 1篇医药卫生
  • 1篇农业科学

主题

  • 2篇CO
  • 1篇蛋白
  • 1篇多囊肾
  • 1篇多囊肾病
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇多态性分析
  • 1篇序列对
  • 1篇肾病
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇系统进化
  • 1篇系统树
  • 1篇细胞色素B基...
  • 1篇线粒体
  • 1篇线粒体DNA
  • 1篇相关蛋白
  • 1篇进化
  • 1篇进化关系

机构

  • 6篇海南大学
  • 1篇中国热带农业...

作者

  • 5篇尹绍武
  • 5篇齐兴柱
  • 3篇张本
  • 2篇彭艳辉
  • 2篇朱晓平
  • 2篇陈国华
  • 2篇杜民
  • 2篇霍蕊
  • 2篇骆剑
  • 2篇刘志亮
  • 1篇胡文婷
  • 1篇张俊芳
  • 1篇申屠垠
  • 1篇胡静
  • 1篇黄俊生
  • 1篇黄海
  • 1篇李军

传媒

  • 2篇热带生物学报
  • 1篇现代渔业信息
  • 1篇中国水产科学
  • 1篇安徽农学通报
  • 1篇水产科学

年份

  • 1篇2011
  • 3篇2010
  • 2篇2009
6 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
人类多囊肾病相关蛋白TMEM130基因的克隆及生物信息学分析
2010年
以递交到GenBank上的TMEM130蛋白基因序列(nm-152913)为模板设计引物,以人大脑cDNA文库为模板进行巢氏PCR扩增,并将PCR产物克隆到pMD18-T载体上,成功获得TMEM130蛋白基因编码序列,测序结果显示,获得的序列为TMEM130蛋白基因转录变异体2,其编码序列长1272bp。该基因定位在人类第7条染色体7q22.1区域,有3个转录变异体。生物信息学分析显示该序列可编码1个含423个氨基酸的蛋白质;Smartmode程序显示该蛋白质是1个跨膜蛋白,在100~250号氨基酸序列之间有1个与多囊肾病(PKD)相关的结构域。因此,鉴定TMEM130蛋白是一个与人类多囊肾病相关的蛋白。
齐兴柱胡文婷张俊芳黄俊生李军
关键词:多囊肾病生物信息学克隆
基于COⅠ序列的DNA条形码在中国南海裸胸鳝属鱼类中的应用被引量:11
2010年
为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用DNA条形码技术测定了6种中国南海裸胸鳝的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因部分序列(504bp)。结合来自GenBank中的分布于日本和3种同样分布于中国南海的裸胸鳝属鱼类的相应同源序列进行比较分析,用邻接法和最大简约法构建分子系统树。结果表明:(1)504个位点中共有187个核苷酸位点存在变异(37.1%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为1.5;(3)细斑裸胸鳝(Gymnothorax fimbriatus)与黑斑裸胸鳝(G.favagineus)之间的同源序列碱基差异只有0.20%,支持二者是同种异名的观点;(4)在NJ树和MP树中,蠕纹裸胸鳝和网纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置。其余8种聚为另外一支,然后又细分为2个较小的分支。
齐兴柱骆剑刘志亮胡静朱晓平彭艳辉尹绍武
关键词:DNA条形码系统树
波纹裸胸鳝线粒体DNA D-loop多态性分析被引量:1
2011年
对分布于我国海南东部海域的波纹裸胸鳝群体(n=21)的mtDNA D-loop区987 bp全序列进行了分析。结果表明:21条波纹裸胸鳝D-loop区序列中,A+T平均含量为62.5%;经比对,共检测到177个核苷酸多态位点,约占核苷酸总数的18.7%;D-loop全序列突变类型有5种,即转换158、颠换18、插入2、缺失1及转换与颠换共存1,它们分别占核苷酸多态位点的89.3%、10.1%、0.3%、0.15%及0.15%。由此构建了中国海南沿海21条波纹裸胸鳝的NJ分子系统树,聚类分析表明:所测波纹裸胸鳝的mtDNA D-loop序列表现为2个单倍型组,从而可以看出这21条波纹裸胸鳝可能有2个母系起源,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异。
刘志亮齐兴柱骆剑朱晓平彭艳辉尹绍武
关键词:线粒体DNAD-LOOP多态性
基于Cyt b基因序列研究6种裸胸鳝属鱼类的进化关系被引量:9
2009年
为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用PCR扩增产物克隆到T载体后进行序列测定,获得黄边裸胸鳝(Gymnothorax flavimarginatus)、斑点裸胸鳝(G.meleagris)、波纹裸胸鳝(G.undulatus)、云纹裸胸鳝(G.chilospilus)、匀斑裸胸鳝(G.reevesi)5种裸胸鳝的线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt b)基因全序列1140bp。结合GenBank中的蠕纹裸胸鳝(G.kidako)Cyt b同源序列进行比较分析,结果表明:(1)1140个位点中共有367个核苷酸位点存在变异(32.2%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为3.223;云纹裸胸鳝和斑点裸胸鳝遗传距离差异最大,为0.226;(3)以花鳗鲡(Anguilla marmorata)为外群,采用NJ法和MP法构建系统发育树,在所分析的6种裸胸鳝属鱼类中,斑点裸胸鳝和波纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置,其余4种聚为另外一支。蠕纹裸胸鳝样本来源于日本海,其余5种裸胸鳝来源于中国南海,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异。
杜民齐兴柱尹绍武霍蕊张本陈国华
关键词:细胞色素B基因
基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究被引量:8
2010年
采用聚合酶链式反应直接测序法,获得细斑裸胸鳝、黄纹裸胸鳝、云纹裸胸鳝、黑点裸胸鳝、褐裸胸膳5种裸胸鳝属鱼类的细胞色素氧化酶Ⅱ(cytochrome oxidaseⅡ,COⅡ)基因序列(691 bp)。结合GenBank上蠕纹裸胸鳝COⅡ同源序列,采用多个生物软件对6种裸胸鳝属鱼类序列变异和碱基组成进行分析,共发现196个核苷酸位点存在变异(28.36%);计算了它们的相对遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,6种裸胸鳝属鱼类的序列差异为0.012~0.199,其中云纹裸胸鳝与褐裸胸鳝的序列差异最大,为0.199,细斑裸胸鳝与黄纹裸胸鳝序列的差异最小,为0.012;总体来说,序列中的转换明显多于颠换,转换和颠换的比值(Ts/Tv)为2.7;以长鳝为外群构建NJ、ME、MP系统树,长鳝分为独立的一支,6种裸胸鳝为另外一支,分为3个平行进化的分支。
齐兴柱尹绍武张本霍蕊杜民
关键词:系统进化
裸胸鳝属鱼类的研究现状与开发利用被引量:2
2009年
裸胸鳝属(Gymnothorax Bloch,1795)鱼类是我国珊瑚礁鱼类资源的重要组成部分。本文对裸胸鳝属鱼类的种类、形态学特征、生活习性、个体发育、繁殖生物学等一些重要的生物学知识和经济价值等进行阐述,并对今后开展裸胸鳝鱼类的研究与开发利用做了展望,为合理、科学地保护与开发利用裸胸鳝鱼类资源提供参考。
申屠垠黄海尹绍武陈国华张本
共1页<1>
聚类工具0