国家自然科学基金(31201263)
- 作品数：4 被引量：14H指数：2
- 相关作者：郝朝运范睿邬华松杨建峰伍宝朵更多>>
- 相关机构：中国热带农业科学院中华人民共和国农业部云南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海南省自然科学基金农业部南亚热作财政专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于EST-SSR标记的胡椒栽培种质遗传多样性研究被引量：2
- 2016年
- 利用13对EST-SSR引物对24份胡椒育成品种和育种品系进行遗传多样性分析。结果表明，13对引物共检测多态性位点60个，PIC值变幅为0．26～0．85。24份供试材料问的遗传相似系数在0．580～0．986之间，参试胡椒栽培种质间具有丰富的遗传差异。在遗传相似系数为0．770水平将材料划分为4个类群。UPGMA聚类和三维散点图都显示，部分参试材料没有严格按照来源地和亲本组成分类，杂交育种可以拓宽种质的遗传变异，为胡椒选育种提供更多材料。本研究阐明了参试胡椒栽培种质的亲缘关系，为胡椒杂交育种利用奠定了分子基础。
- 伍宝朵胡丽松范睿邬华松郝朝运
- 关键词：胡椒EST-SSRUPGMA
- 胡椒EST－SSR标记的开发和应用被引量：9
- 2015年
- 通过分析NCBI数据库中胡椒转录组数据,共得到unigene 23 524条,其中618条unigene中检测到643个EST-SSR位点,SSR发生频率为2.63%,平均分布距离为12.86 kb。在643个EST-SSR中,二、三核苷酸重复是主要重复类型,分别占27.84%和69.36%,其中(AG/CT)n、(AAG/CTT)n出现频率最高,(NNN/NNN)5类型占EST-SSR位点的42.90%。利用PRIMER3.0设计358对引物,随机合成45对引物,并选用其中11对扩增较好的多态性引物,对43份胡椒种质的遗传多样性进行初步检测,构建聚类分析树状图。结果说明,胡椒EST-SSR标记的开发是可行的,并能够有效的用于胡椒遗传分析研究,具有较高的应用价值。
- 伍宝朵郝朝运范睿杨建峰邬华松
- 关键词：胡椒转录组EST-SSR遗传多样性分析
- 胡椒EST-SSR标记的开发和应用
- 通过分析NCBI数据库中的胡椒转录组数据,共得到unigene 23524条,其中618条unigene中检测到643个EST-SSR位点,SSR发生频率为2.63%,平均分布距离为12.86 kb。在643个EST-S...
- 伍宝朵郝朝运范睿杨建峰邬华松
- 关键词：胡椒转录组EST-SSR遗传多样性分析
- 文献传递
- 胡椒属植物DNA条形码初步研究被引量：3
- 2013年
- 为筛选胡椒属DNA条形码最佳片段,研究了ITS、rbcL、psbJ-petA和matK基因片段的有效使用性、种内种间变异和barcoding gap,并评估了序列鉴定效率。结果显示:ITS和matK的barcoding gap图相对较好,matK物种水平鉴定成功率高,ITS种间变异较大,而其他2个候选序列不能进行有效鉴定。为此,推荐matK和ITS作为胡椒属植物潜在的DNA条形码序列,并依此探索建立该属的DNA条形码鉴定方法。
- 郝朝运邬华松范睿杨建峰吴刚马腾飞秦晓威
- 关键词：胡椒属DNA条形码ITSMATKRBCL
- 利用Gateway技术改造原核表达载体pGEX-4T-1、pET-28a
- 2015年
- 质粒载体是基因工程研究中不可或缺的工具。为提高载体构建效率,进一步满足基因工程研究在构建表达载体时的需要,本文提供了一种重组型载体的改造策略。基本流程如下:利用带BglⅡ、XhoⅠ酶切位点以及att B重组序列的引物,从Gateway的入门载体p DONR Zeo中克隆到"BglⅡ-att B1-ccd B-att B2-XhoⅠ"片段。通过酶切连接的方法,将该片段插入到原核表达载体p GEX-4T-1以及p ET-28a的多克隆位点,构建具有重组位点以及ccd B致死基因的原核表达载体。以胡椒High mobility group protein(HMGB)基因的开放读码框为目标片段,通过重组反应将目的基因构建到改造后的原核表达载体上,经检测体外诱导表达出大小正确的HMGB蛋白,验证本研究中改造载体的正确性。该载体的成功构建,为基因工程科研工作提供了一个高效的蛋白表达载体以及载体改造的新策略。
- 胡丽松邬华松郝朝运谭乐和范睿吴刚
- 关键词：GATEWAY技术原核表达
