国家自然科学基金(30371583) 作品数:7 被引量:35 H指数:3 相关作者: 唐建武 王波 崔晓楠 宋波 侯力 更多>> 相关机构: 大连医科大学 大连医科大学附属第一医院 大连市中心医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 辽宁省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
基因芯片筛选小鼠肝癌淋巴道转移相关基因 被引量:23 2005年 背景与目的肿瘤转移是一个多基因参与的复杂过程。由肿瘤转移所导致的恶性肿瘤患者死亡率高、预后差和其发生机制不清,长期以来一直是肿瘤学领域的突出问题。本研究利用基因芯片技术比较高低淋巴道转移能力小鼠肝癌细胞系Hca-F(高转移)和Hca-P(低转移)的基因表达谱,并筛选出与肿瘤淋巴道转移相关的基因。方法分别提取Hca-F和Hca-P细胞的总RNA,反转录合成双链cDNA,通过体外反转录合成生物素标记的cRNA探针,cRNA探针经片段化处理后分别与AffymetrixGeneChip誖MOE430A(包括22690个转录本对应于约14500个小鼠已知基因和4371个EST)杂交,杂交信号经扫描等处理并用生物信息学对检测结果进行分析。结果与Hca-P细胞相比较,Hca-F细胞中有901个(6.2%)基因表达上调幅度≥2倍,有129个(3%)EST上调幅度≥2倍。在公布的差异最显著的33个包括endoglin(EDG;CD105)、Mcam(Muc18;Mel-CAM;CD146)、Cdc42ep5(CEP5;Borg3)、Ptprr(proteintyrosinephosphatase,receptortype,R)、F2r[coagulationfactorⅡ(thrombin)receptor;Par1;ThrR]、D7Ertd458e(necl-5)、NR1D1、Serpinh1(HSP47)、AXL、Mak和Areg(AR)等基因表达中,上调幅度在29.86~13.93倍之间。根据GO(GeneOntology)分类和Treeview分析,这33个基因的功能主要为促血管生成、细胞粘附、信号转导、细胞运动、转录、分子伴侣活性、蛋白激酶活性和受体结合等。结论高通量的基因芯片技术筛选出大量淋巴道转移相关基因,对这些转移相关基因功能的验证有助于找到淋巴道转移的关键(代表)基因/通路,它们可作为肿瘤淋巴道转移诊断的指标和治疗的靶点。 宋波 唐建武 王波 崔晓楠 周春辉 侯力关键词:细胞株 基因芯片 淋巴转移 小鼠 泛素C-末端水解酶-L3在小鼠腹水型肝癌高、低淋巴道转移株中的表达 2009年 肿瘤转移机制及防治已成为当今肿瘤研究领域的热点。高淋巴道转移力小鼠腹水型肝癌细胞(Hca-F)、低淋巴道转移力小鼠腹水型肝癌细胞(Hca-P)是由大连医科大学病理教研室自行建立的肿瘤转移机制实验模型。 张竹青 唐建武 孙成荣关键词:C-末端 水解酶 转移株 肿瘤转移机制 泛素 pCDNA3.1-Annexin A7载体的构建及在Hca-p细胞中的表达 被引量:6 2008年 [目的]构建pCDNA3.1-Annexin A7载体并稳定转染Hca-p细胞。[方法]提取小鼠总RNA,逆转录成cD-NA,PCR扩增,获取Annexin A7 CDS,将PcDNA3.1(+)质粒和Annexin A7 CDS片段行BamH I和EcoR I双酶切,构建并抽提pCDNA3.1-Annexin A7质粒,测序鉴定后转染Hca-p细胞,经400μg/mL G418完全培养基筛选获得pCDNA3.1-Annexin A7载体稳定转染的Hca-p细胞,在蛋白质水平检验Annexin A7的表达并行基因组DNA鉴定。[结果]成功构建pCDNA3.1-Annexin A7载体,经测序鉴定,所得到的载体中的CDS经比对与库中序列一致。pCDNA3.1-Annexin A7载体转染Hca-p细胞后,获得稳定上调表达Annexin A7的Hca-p细胞株;行基因组DNA鉴定,证实pCDNA3.1-Annexin A7已转入Hca-P细胞中,western-b lotting结果显示转染前后蛋白的表达相对值Annexin A7/GAPDH分别为0.43544±0.0112和0.45957±0.0065(P<0.05)。[结论]pCDNA3.1-An-nexin A7的构建并稳定转染Hca-p细胞成功,为通过上调Annexin A7在Hca-P的表达以证实Annexin A7与恶性肿瘤淋巴道转移潜能关系的相关研究打下了基础。 王志强 唐建武 王绍青 孙成荣 王波关键词:PCR 转染 肿瘤 淋巴道转移 高淋巴系统转移能力小鼠肝癌细胞株差异表达基因的筛选 被引量:2 2005年 目的 筛选高淋巴系统转移能力小鼠肝癌细胞株差异性表达基因。方法 应用抑制性消减杂交 (SSH)技术 ,构建高淋巴系统转移能力小鼠肝癌细胞株Hca F及其同源低转移细胞系Hca P的cDNA消减杂交文库 ,筛选阳性克隆进行测序 ,并在GenBank数据库中进行同源性比较。结果 成功克隆 10个差异基因片段 ,其中 2个为新基因。结论 SSH技术是克隆差异表达基因及发现新基因的有效方法。 崔晓楠 唐建武 侯力 宋波 刘基巍关键词:肝癌细胞株 鼠肝 淋巴系统 差异表达基因 阳性克隆 COMPARATIVE ANALYSIS OF LYMPHATIC METASTASIS——ASSOCIATED GENES IN MOUSE HEPATOCELLULAR CARCINOMA CELL LINES WITH DIFFERENT METASTATIC POTENTIAL 2006年 Objective: To investigate the neoplasm lymphatic metastasis-associated genes and its molecular mechanisms. Methods: 22690 mouse genome cDNA microarrays (including 14500 known genes and 4371 ESTs) were used to compare and analyze the gene expression profiles of mouse hepatocellular carcinoma cell lines Hca-F (highly lymphatic metastasis potential) and Hca-P (low potential). Results: 901 genes and 129 ESTs were up-regulated at least 2-fold in Hca-F cell. 33 genes showing significant alterations in expression were presented, including endoglin (EDG), MCAM, Cdc42ep5, F2r, D7Ertd458e, Serpin hl (HSP47), AXL, Areg and so on. These genes have functions of angiogenesis, cell adhesion, signal transduction, cell motility, chaperone activity, protein kinase activity and receptor binding. Conclusion: cDNA microarray combined with lymphatic metastasis models might contribute new methods and clues to the neoplasm lymphatic metastasis research. Some overexpressed genes might provide novel clues to the molecular mechanisms of neoplasm lymphatic metastasis. 宋波 王波 崔晓楠 李晓枫 周春辉 侯力 唐建武高低淋巴道转移力小鼠肝癌细胞间抑制性消减杂交文库的建立 被引量:4 2006年 目的:以抑制性消减杂交技术分离高低淋巴道转移力小鼠肝癌细胞HcaF和HcaP间差异表达的基因。方法:采用抑制性消减杂交技术,以高低转移力小鼠肝癌细胞HcaF为检测子,以低转移力HcaP细胞为驱赶子,分离高转移力癌细胞中高表达的基因的cDNA片段。将差异表达基因的cDNA片段插入T/A克隆载体,并通过热转化的方法转化大肠埃希菌DH5α,建立了高低淋巴道转移力小鼠肝癌细胞间抑制性消减杂交文库。以菌液PCR的方法检测随机挑选的白色菌落中插入片段的出现频率。提取14个重组质粒进行序列分析。结果:在消减文库中共获800个白色菌落,对随机挑选的160个白色菌落进行菌液PCR扩增,发现95%的白色菌落中含有100~700bp的插入片段。对重组质粒的序列分析和同源性比对发现,所获的14个序列中3个为已知基因,分别来自小鼠热休克蛋白、ribosomalproteinS13、ethanolinduced6基因;4个可能来源于新基因;3个与3个不同的EST同源。结论:成功构建了高低淋巴道转移力小鼠肝癌细胞间抑制性消减杂交文库,为今后高通量筛选癌淋巴道转移相关基因,奠定了坚实的基础。 侯力 唐建武 崔晓楠 王波 宋波 孙雷关键词:癌基因 应用表达芯片筛选小鼠肝癌淋巴道转移相关基因 被引量:2 2005年 目的采用表达芯片比较高、低淋巴道转移力小鼠肝癌腹水型细胞株Hca-F和Hca-P的基因表达谱,以筛选出与肿瘤淋巴道转移相关的基因。方法分别提取Hca-F和Hca-P细胞的总RNA,反转录合成生物素标记的cRNA探针,并与A ffy-m etrix GeneCh ip MOE430A(包括22 690个转录本,对应于约14 500个小鼠已知基因和4 371个EST)杂交,检测结果利用生物信息学进行分析。结果Hca-F和Hca-P相比,在14 500个已知基因中,有901个(6.2%)表达上调幅度≥2倍;在4 371个EST中,有129个(3%)上调幅度≥2倍。公布了差异表达≥8倍的37个基因并根据Gene Ontology(GO)分类和TreeV iew分析,按照其参与的生物学过程和具有的分子功能进行了功能分类。其中有19个基因参与了组织发生、细胞黏附、信号转导、细胞生长、分化及代谢等的生物学过程,29个基因分别具有转运、移动、蛋白激酶、蛋白结合及受体活性等分子功能,7个基因的生物学功能尚不清楚。结论表达芯片检测与肿瘤淋巴道转移模型相结合,为肿瘤转移研究提供新方法、新思路,一些过量表达的基因将为肿瘤转移机制的研究提供新线索。 宋波 王波 崔晓楠 侯力 周春辉 郑仁恕 李晓枫 唐建武关键词:肿瘤转移 基因芯片 小鼠