广州市科技计划项目(Z3-E4061)
- 作品数：4 被引量：14H指数：3
- 相关作者：赵彤韩西群朱梅刚齐宗利黄宏宇更多>>
- 相关机构：南方医科大学南方医院南方医科大学中国人民解放军第一军医大学更多>>
- 发文基金：广东省社会发展攻关项目广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- IgH不同区域基因重排引物的分析及在石蜡淋巴瘤诊断中的应用被引量：2
- 2008年
- 目的通过生物信息学方法分析并优化免疫球蛋白重链(IgH)不同框架(FR)区域基因重排的引物,探索其对石蜡包埋的淋巴瘤组织基因重排检测中的应用。方法通过Clustal W软件比较44条有效的IgH可变区和6条J区的基因片段,选取3对(IgHFR1、FR2、FR3区各一对,分别为P1c,P2A,P31)IgH基因重排引物作为B细胞基因重排引物。另选一对TCRγ引物作为T细胞基因重排引物。通过PCR扩增,检测经形态学及免疫组织化学确诊的101例(80例B细胞淋巴瘤、14例T细胞淋巴瘤和7例淋巴结反应性增生组织)石蜡包埋组织标本的基因重排状况。以DG75、Jurkat淋巴瘤细胞系DNA作为B和T细胞淋巴瘤基因重排的阳性对照,以反应性增生组织DNA作为阴性对照。结果IgHFR1、FR2和FR3区域引物对80例B细胞淋巴瘤的阳性检出率分别为37.5%(30/80)、52.5%(42/80)和70.0%(56/80),在14例T细胞淋巴瘤中均为7.1%,三者的检出率两两之间差异有显著性;IgHFR3区和IgHFR2区引物的组合可将其检出率提高到83.9%。以上引物在7例反应性淋巴结中均未检出阳性。结论IgH不同区域引物比较,FR3区引物检出率明显高于FR1区和FR2区。FR3区和FR2区引物联合检测可明显提高石蜡组织中B细胞淋巴瘤基因重排的检出率。
- 齐宗利张宝韩西群朱梅刚赵彤
- 关键词：免疫球蛋白重链基因重排B细胞淋巴瘤石蜡组织
- IgH和IgL引物联合检测对提高石蜡组织淋巴瘤基因重排检出率的价值被引量：3
- 2006年
- 背景与目的:通过聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)扩增免疫球蛋白重链(immunoglobulinheavychain,IgH)基因对其克隆性的检测,可以辅助诊断淋巴瘤。缺点是假阴性率较高,在石蜡包埋组织中尤为明显。本研究拟采用手工显微切割、免疫球蛋白重链和轻链(immunoglobulinlightchain,IgL)联合测定等方式,探讨该方法在石蜡包埋组织中非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin\slymphoma,NHL)诊断中的价值。方法:选用1对IgH引物、1对T细胞受体γ(Tcellreceptorγ,TCRγ)、TCRγ引物、2对新设计的轻链引物,通过PCR、琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)及银染技术,检测经形态学及免疫组织化学确诊的58例石蜡包埋组织标本,包括39例B细胞淋巴瘤、16例T细胞淋巴瘤和3例淋巴结反应性增生组织。以DG75和Jurkat淋巴瘤细胞系DNA作为对照。结果:IgH引物P1在39例B细胞淋巴瘤检出阳性率79.5%(31/39),假阳性率6.25%(1/16),IgL引物在B细胞淋巴瘤检出阳性率71.8%(28/39),假阳性率12.5%(2/16),经统计学分析二者检出率无显著性差异(P>0.05)。二者联合检测,B细胞淋巴瘤阳性检出率可以达到92.3%,假阳性率并无明显提高(12.5%)。以上重排引物在反应性增生淋巴结组织中均未检出。结论:IgH与IgL引物联合检测可明显提高石蜡包埋组织中B细胞淋巴瘤的检出率,并为B-NHL的诊断及鉴别诊断提供了有效的辅助手段。
- 齐宗利韩西群黄宏宇朱梅刚赵彤
- 关键词：石蜡包埋组织淋巴瘤
- 石蜡淋巴瘤组织中IgH FR3区基因重排引物分析被引量：3
- 2008年
- 目的利用生物信息学方法分析免疫球蛋白重链(IgH)框架区(FR3)基因重排引物并探讨其在石蜡包埋非霍奇金淋巴瘤(NHL)组织中应用价值。方法通过ClustalW软件比较44条有效的IgH可变区和6条J区的基因片段,选取IgHFR3区3对(P1,P2,P3)基因重排引物,其中,P2为改进的引物。另选一对TCRγ引物作为T细胞淋巴瘤重排引物,通过PCR扩增,检测经形态学及免疫组织化学确诊的144例石蜡包埋组织标本,包括113例B细胞淋巴瘤、24例T细胞淋巴瘤和7例淋巴结反应性增生组织。以DG75淋巴瘤细胞系DNA作为对照组。结果引物对P1、P2、P3在B细胞淋巴瘤检出阳性率分别为71.7%(81/113),82.3%(93/113)和76.1%(86/113),三者检出率差异无统计学意义;在T细胞淋巴瘤检出率分别12.5%(3/24)、12.5%(3/24)、16.7%(4/24)。将P1和P2引物组合分析,B细胞淋巴瘤阳性检出率可以达到92.3%。以上重排引物在7例反应性淋巴结中均未检出。结论3对IgHFR3区中,新改进的P2引物在B细胞淋巴瘤中的检出率最高(82.3%)。2对IgHFR3区引物联合检测可明显提高石蜡组织中B细胞淋巴瘤的检出率。
- 齐宗利张宝韩西群霍霞朱梅刚赵彤
- 关键词：淋巴瘤B淋巴细胞基因重排聚合酶链反应石蜡包埋
- 石蜡包埋淋巴组织三种微量DNA提取方法的比较被引量：8
- 2006年
- 目的为寻找一种高效、简便、实用的石蜡组织中DNA提取方法，本研究比较了三种不同的DNA提取方法对DNA质量的影响。方法选取淋巴相关组织的蜡块21例。三种DNA提取方法分别是简单消化煮沸法，酚／氯仿提纯法和试剂盒法。通过提取DNA的浓度和纯度、PCR扩增保守序列pglobin等方法，比较三种DNA提取方法的优劣。结果试剂盒法提取样品OD260／OD280平均比值位于1．6～1．8之间；提纯法位于1．3—1．5之间；简单消化煮沸法位于1，2—1．3之间。三种方法中，试剂盒法提取的DNA最为稳定。以3种DNA提取方法所获取DNA为模板，PCR扩增阳性率无统计学差异。结论从实用、快速、经济的角度综合分析，简单消化煮沸法简单快速，需要的组织样品少，是一个值得推荐的石蜡组织DNA提取方法。
- 齐宗利韩西群黄宏宇朱梅刚赵彤
- 关键词：石蜡包埋组织PCRDNA提取
