国家重点基础研究发展计划(2010CB534905)
- 作品数：16 被引量：16H指数：2
- 相关作者：王改平秦波郝晓霞段丽娟张瑞刚更多>>
- 相关机构：河南师范大学科技部新乡医学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划河南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- JNK信号通路在大鼠肝再生及肝硬化的细胞增殖和凋亡中作用的比较被引量：2
- 2012年
- 目的从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠肝再生(LR)和肝硬化(LC)中的作用异同。方法采用2/3部分肝切除手术制备大鼠肝再生模型,以腹腔注射CCl4中性菜籽油溶液法建立大鼠肝硬化模型,采用大鼠Genome 230 2.0芯片检测不同时间点再生肝和肝硬化组织中JNK信号通路的基因表达谱,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达谱预示的增殖和凋亡活动。结果 JNK信号通路涉及302个基因和42条途径,大鼠Genome 230 2.0芯片含上述基因中的240个基因,其中,79个基因发生有意义表达变化,涉及LR的52个基因,LC的5个基因,有22个基因与两者相关。在大鼠LR启动阶段,途径1和16促进细胞增殖及途径22～33促进细胞凋亡作用强于对照;在进展阶段,途径1～17、34和35促进细胞增殖及途径22～33促进细胞凋亡作用强于对照,途径37～41抑制细胞凋亡作用弱于对照;在终止阶段,途径37、39、41和42诱导细胞凋亡作用弱于对照,同时,尚未发现途径18～21和36参与大鼠LR。而在LC发生中,JNK信号通路中的这些途径与对照相比均无显著差异。结论 JNK信号通路的37条途径调控大鼠肝再生的细胞增殖和凋亡,对大鼠肝硬化的调控作用则不显著。
- 冯利娟段丽娟张瑞刚张新胜徐存拴
- 关键词：肝再生肝硬化JNK信号通路GENOME
- Caspase信号通路调控大鼠再生肝肝细胞的凋亡被引量：5
- 2012年
- 目的从基因转录水平了解Caspase信号通路各途径对大鼠再生肝肝细胞凋亡的调节作用。方法将114只大鼠随机分为19组,包括9个部分肝切除组,9个假手术组和1个正常对照组。于手术后10个不同时间点用常规的两步灌流法和Percoll密度梯度离心法分离大鼠肝细胞,用大鼠Genome 230 2.0芯片检测在大鼠肝再生(LR)中Caspase信号通路相关基因表达变化,用荧光定量PCR确定芯片结果的可靠性,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的Caspase信号通路在调控大鼠再生肝肝细胞凋亡中的作用。结果 Caspase信号通路涉及38条途径和123个基因,大鼠Genome 230 2.0芯片含其中的106个基因,38个基因在大鼠肝再生中与肝细胞相关。Caspase信号通路抑制细胞凋亡的21条途径中,途径1、2和11在大鼠部分肝切除(PH)后的30h,途径27、29和31在72h,途径15和16在2h和30h,途径3和4在30h和72h抑制肝细胞凋亡。促进细胞凋亡的17条途径中,途径14在2h,途径34在6h,途径7在30h,途径13在2h和30h,途径36在6h和30h促进肝细胞凋亡。同时,尚未发现其他途径参与肝细胞增殖和(或)凋亡调控。结论 Caspase信号通路的15条途径和38个基因调控大鼠再生肝的肝细胞凋亡。
- 蒋文文郝晓霞郭雅琼赵卫明徐存拴
- 关键词：大鼠肝再生GENOME荧光定量PCR
- GZMA、GZMB、TSP-1、TLR和IL-15条细胞凋亡通路基因在肝再生中的表达变化
- 2016年
- 目的探讨颗粒酶A(GZMA)、颗粒酶B(GZMB)、血小板反应蛋白-1(TSP-1)、Toll样受体(TLR)和白细胞介素-1(IL-1)5条细胞凋亡通路基因在肝再生(LR)过程中的表达变化。方法大鼠随机分为33组,每组6只,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠部分肝切除(PH)后不同恢复时间点5条细胞凋亡通路基因的表达情况,采用Real-time PCR和Western blotting技术对芯片结果进行验证,并用生物信息学方法对凋亡通路基因在肝再生中的表达变化进行分析。结果 Real-time PCR和Western blotting均与Rat Genome 230 2.0芯片的检测结果趋势一致;GZMA、GZMB、TSP-1、TLR和IL-1 5条细胞凋亡通路中9、8、24、31和34个基因与肝再生相关。它们主要在肝再生启动阶段起始表达,在细胞增殖阶段表达的基因数最多。表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,大多数基因表达加强,少数基因表达降低。它们表达的时间相关性分为13组。基因协同作用模型(Et)分析表明,GZMA介导的细胞凋亡通路在肝再生后期促进细胞凋亡;TLR介导的细胞凋亡通路几乎均在整个肝再生中促进细胞凋亡;GZMB、TSP-1和IL-1介导的细胞凋亡通路可能在肝再生中不发挥细胞凋亡作用。结论 GZMA和TLR两条通路调控肝再生中的细胞凋亡。
- 邢雪琨刘振华李梦华徐存拴
- 关键词：部分肝切除肝再生实时定量聚合酶链反应
- AW915115参与大鼠再生肝星形细胞的Notch信号转导
- 2010年
- 为了解新基因AW915115在Notch信号通路中的作用及与大鼠肝再生的相关性,用Percoll密度梯度离心结合免疫磁珠分选方法分离大鼠再生肝的8种细胞,用Rat Genome 230 2.0芯片等检测上述细胞的Notch信号通路基因在大鼠肝再生中的表达变化,用BLAST、Microsoft Excel等软件分别分析新基因与已知基因的序列同源性和共表达关系,用生物信息学和系统生物学等方法分析上述基因参与的生理活动.结果表明,AW915115与活化Notch受体的N-乙酰葡糖基转移酶基因lfng同源,并且在2 h和12 h再生肝星形细胞中表达下调.根据上述基因的同源性和共表达关系推测,新基因AW915115参与大鼠再生肝星形细胞的Notch信号转导.
- 郝晓霞秦波陈晓光张丽君徐存拴
- 关键词：大鼠肝再生RATGENOME
- 豹蛙酶的抗肿瘤作用研究进展被引量：1
- 2012年
- 豹蛙酶(onconase)又称抗瘤酶、P30蛋白等,属核糖核酸酶A超家族成员。豹蛙酶是目前唯一用于临床试验阶段的核糖核酸酶,它的核糖核酸酶活性低,细胞毒性较强,对体内外多种肿瘤有很强的杀伤作用,是当前全球重点研究的100种新药之一。豹蛙酶在北极蛙的早期胚胎中被首次发现,它主要通过破坏RNA从而抑制蛋白质合成,诱导肿瘤细胞凋亡,此外还有其他抗肿瘤机制,如影响特定基因的表达和破坏端粒酶RNA。豹蛙酶和其他抗癌药物联合应用会增强抗癌药物的抗肿瘤细胞毒性。目前,豹蛙酶对小细胞肺癌和其他实体肿瘤的治疗处于Ⅰ期或Ⅱ期临床试验,对恶性间皮瘤的治疗处于Ⅲ期临床试验阶段,是潜在的治疗恶性间皮瘤的药物。
- 鲁艳平杨刚刚张瑞刚徐存拴
- 关键词：核糖核酸酶肿瘤细胞毒性
- 大鼠急性肝衰竭肝脏的基因表达分析
- 2012年
- 目的从基因转录水平了解急性肝衰竭(AHF)发生的基因组学基础。方法 36只SD成年大鼠分为模型组和对照组,模型组采用CCl4(4ml/kg)一次性灌胃法建立大鼠AHF模型,于建模3、6、12、24、48和72h时采集血清,检测谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、碱性磷酸酶(ALP)、总蛋白(TP)、总胆红素(TBIL)等生化指标,并固定肝脏组织制作成石蜡切片,进行HE染色分析。用大鼠Genome 230 2.0芯片检测上述时间点肝脏细胞的基因表达谱,用系统生物学方法分析基因表达谱预示的生理活动。结果发现1 022个基因与大鼠AHF发生相关。其中,建模3、6、12、24、48、72h时有意义表达的基因数分别为131、302、350、539、349、177,有意义表达上调、下调和上下调的基因总数分别为634、382和6。用生物信息学和系统生物学等方法分析肝脏细胞基因表达谱与AHF发生的相关性,结果表明,AHF发生共涉及23种生理活动变化。其中,基因转录、糖类、脂类等代谢、内环境稳定、细胞增殖、生长、建成、迁移等8种生理活动增强。信号转导、核酸、有机酸、毒物等代谢、氧化还原、细胞黏附等6种生理活动减弱。炎症反应、细胞分化、发育等生理活动在AHF发生前期增强,后期减弱。结论 AHF发生与多种基因表达变化和多种生理活动改变密切相关。
- 郝云鹏王撒王改平张文学徐存拴
- 关键词：急性肝衰竭基因表达谱HE染色
- 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路相关基因对大鼠再生肝8种细胞生长过程的调节作用被引量：1
- 2012年
- 目的从基因转录水平了解哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路对大鼠再生肝8种细胞的生长调节作用。方法在本实验室建立大鼠2/3肝切除模型,分离和鉴定再生肝8种细胞,采用大鼠Genome230 2.0芯片检测、数据处理及实时荧光定量PCR等方法,构建mTOR的信号通路网络,分析mTOR信号通路的相关基因在以上8种细胞中的表达谱,用系统生物学方法分析基因表达谱预示的细胞生长活动。结果 mTOR信号通路涉及110个基因和25条途径,99个基因含于大鼠Genome 230 2.0芯片,82个基因与大鼠肝再生相关。其中,在启动阶段,mTOR信号通路主要参与激活、促进肝细胞、陷窝细胞、库普弗细胞、树突状细胞、肝星形细胞和窦内皮细胞的生长过程;在进展阶段,mTOR信号通路明显地促进肝细胞、胆管上皮细胞、卵圆细胞、肝星形细胞、库普弗细胞、陷窝细胞和树突状细胞的生长过程;在终止阶段,mTOR信号通路的大多数途径对肝细胞、库普弗细胞和树突状细胞的生长过程的促进作用减弱,而途径25却对肝细胞、窦内皮细胞、肝星形细胞和陷窝细胞的生长过程有明显的抑制作用。结论 mTOR信号通路的25条途径和82个基因参与大鼠再生肝8种细胞的生长调控。
- 段丽娟王改平杨献光李德明徐存拴
- 关键词：肝再生MTOR信号通路GENOME
- 建立同类提取法从基因芯片检测数据中挖掘大鼠肝细胞的肝再生关键基因被引量：1
- 2013年
- 为解析基因芯片检测数据的生物学意义,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中肝细胞的基因表达丰度,用F检验大鼠2/3肝切除组(PH)与假手术组(SO)的基因表达差异性和获得大鼠肝细胞的肝再生相关基因,用同类提取法从过滤法计算的差异基因中筛选特征基因,根据特征基因的关联度、参与的生理活动和他人研究结果确认其中的关键基因.结果表明,Ccne1、Egf、Met等57个特征基因在大鼠肝再生中起关键作用.
- 徐存拴闫春玲江云周运黄荧李钧涛
- 关键词：大鼠肝再生过滤法特征基因关键基因
- AKT、ATM、D4-GDI和p53 4条细胞凋亡通路基因在大鼠肝再生过程中的表达变化被引量：2
- 2016年
- 目的探讨AKT、ATM、D4-GDI和p53 4条细胞凋亡通路基因在肝再生(LR)过程中的表达变化。方法将大鼠随机分为实验组和对照组,每组6只,雌雄各半,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠部分肝切除(PH)后不同恢复时间点4条细胞凋亡通路基因表达情况,并用生物信息学方法对其进行分析。结果 AKT、ATM、D4-GDI和p53 4条细胞凋亡通路中63、8、6和7个基因与肝再生相关。它们主要在肝再生启动阶段起始表达。表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,大多数基因表达加强,少数基因表达降低。它们表达的时间相关性分为11组。基因协同作用模型(Et)分析表明,AKT通路几乎在整个肝再生中抑制细胞凋亡;ATM、D4-GDI和p53 3条细胞凋亡通路几乎在整个肝再生中促进细胞凋亡。结论 AKT、ATM、D4-GDI和p53 4条细胞凋亡通路与再生肝生长、发育和肝量控制密切相关。
- 邢雪琨李梦华徐存拴
- 关键词：部分肝切除芯片检测
- NF-κB信号通路在大鼠肝再生中调节肝细胞增殖的机理研究被引量：1
- 2013年
- 为了解大鼠肝再生中肝细胞NF-κB信号通路对肝细胞增殖的调节作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测大鼠肝再生中NF-κB信号通路相关基因表达变化发现,芯片含138个NF-κB信号通路基因,其中46个基因与大鼠肝再生相关.用Ingenuity Pathway Analysis 9.0(IPA)软件解析上述基因表达变化预示的该信号通路调节肝细胞增殖作用发现,该通路的白细胞介素-1(IL-1)途径在大鼠肝再生起始阶段促进肝细胞增殖,生长因子(GF)途径在进展阶段促进肝细胞增殖,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)途径在起始阶段促进肝细胞增殖,终止阶段抑制肝细胞增殖.
- 王彬彬常翠芳鲁艳平贾艺峰徐存拴
- 关键词：大鼠肝再生肝细胞增殖NF-ΚB信号通路
