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国家自然科学基金(31271678)

作品数:6 被引量:38H指数:3
相关作者:王才林张亚东陈涛于新赵庆勇更多>>
相关机构:江苏省农业科学院南京农业大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金江苏省农业科技自主创新基金江苏省科技支撑计划项目更多>>
相关领域:农业科学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 9篇会议论文
  • 6篇期刊文章

领域

  • 12篇农业科学
  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇医药卫生

主题

  • 13篇水稻
  • 11篇基因
  • 5篇粒型
  • 5篇粒形
  • 3篇性状
  • 2篇性状基因
  • 2篇数量性状
  • 2篇数量性状基因
  • 2篇数量性状基因...
  • 2篇重组自交系
  • 2篇转基因
  • 2篇自交
  • 2篇自交系
  • 2篇粒宽
  • 2篇粒重
  • 2篇克隆
  • 2篇QTL
  • 2篇大粒
  • 2篇RICE
  • 1篇稻穗

机构

  • 13篇江苏省农业科...
  • 6篇南京农业大学

作者

  • 11篇张亚东
  • 11篇王才林
  • 10篇周丽慧
  • 9篇姚姝
  • 9篇朱镇
  • 9篇赵庆勇
  • 9篇于新
  • 9篇陈涛
  • 8篇赵春芳
  • 7篇赵凌
  • 7篇郑佳
  • 5篇梁彦丽
  • 3篇丁丹
  • 2篇董少玲
  • 2篇张颖慧
  • 2篇胡庆峰

传媒

  • 2篇江苏农业学报
  • 2篇中国水稻科学
  • 2篇Rice s...
  • 2篇中国遗传学会...
  • 1篇中国作物学会...

年份

  • 2篇2016
  • 3篇2015
  • 6篇2014
  • 4篇2013
6 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
特大粒水稻材料粒型性状的QTL检测被引量:25
2013年
利用特大粒粳稻TD70(2011年千粒重达80g)和籼稻品种Kasalath杂交,经单粒传法获得的240个重组自交系(RIL)为作图群体,分别于2010年和2011年对粒长、粒宽、粒厚性状进行鉴定,用完备区间作图法,以均匀分布于12条染色体的141个SSR标记对粒型性状进行QTL检测。共检测到粒型性状的QTL 18个,分布于第2、3、5、7、9和12染色体上。其中,控制粒长的QTL 5个,控制粒宽的QTL 6个,控制粒厚的QTL 7个。两年间均能检测到的QTL有7个,分别为粒长QTL qGL3.1,粒宽QTL qGW2.1、qGW2.2、qGW5.1、qGW5.2,粒厚QTL qGT2.3、qGT3.1;其平均贡献率分别为56.19%、4.42%、29.41%、10.37%、7.61%、21.19%和17.06%。第2染色体RM1347-RM5699区间是粒长、粒宽、粒厚的共同标记区间。第3染色体RM6080-RM6832区间为粒长qGL3.1、粒厚qGT3.1共同标记区间。18个QTL的增效等位基因均来源于大粒亲本TD70,且增效作用显著。定位的大部分位点包含已报道的精细定位和克隆的主要粒型基因;除第2染色体的qGW2.1(qGT2.1)、qGW2.3、qGL2.2和第12染色体的qGT12等位点已有粒型性状相关报道外,定位的qGT2.2,qGW9和qGT9可能是新的QTL。
张亚东张颖慧董少玲陈涛赵庆勇朱镇周丽慧姚姝赵凌于新王才林
关键词:水稻特大粒重组自交系粒型数量性状基因座
利用染色体片段置换系群体检测水稻产量相关性状QTL
高产一直是水稻育种的第一目标。对单株个体而言,单株产量是由单株的有效穗数、每一单穗的颖花数、结实率和千粒重4个因素决定。为了发掘单株产量及其构成因素相关性状QTL,为单株产量相关性状的改良及超高产育种提供新的基因资源,本...
周丽慧张亚东朱镇陈涛赵庆勇姚姝赵凌赵春芳于新王才林
关键词:水稻染色体片段置换系数量性状基因座
文献传递
F2分离群体中粒形基因效应分析
粒型是与水稻产量直接相关的重要农艺性状,主要包括粒长、粒宽和粒厚三个基本性状.利用已知粒型基因定向改良水稻籽粒性状,提高水稻产量及品质,是水稻分子设计育种的最终目标.本研究利用5个粒形基因qGL3、GS3、GW2、GS5...
梁彦丽张亚东赵春芳赵凌朱镇赵庆勇陈涛周丽慧姚姝王才林
关键词:水稻
水稻粒重基因TGW6在大粒材料中的鉴定及效应检测
穗数、每穗粒数、千粒重和结实率是衡量水稻产量的四大因素,与其他三者相比,千粒重具有更好的遗传稳定性,可以通过分子标记进行定向改良。TGW6是已克隆的与水稻千粒重相关的一个重要基因,当Kasalath的TGW6基因导入日本...
梁彦丽张亚东赵春芳郑佳朱镇赵庆勇周丽慧姚姝于新王才林
关键词:水稻基因型粒重粒形
文献传递
水稻粒型QTL的检测及测序分析
水稻粒长、粒宽、粒厚等粒型性状是与产量直接相关的重要性状,也是影响稻米品质的重要性状。这些性状大多属于多基因控制的数量性状。粒型研究方面已克隆了qGL3、GW8、GS5、GS3、GW2、GW5(qSW5)和TGW6等基因...
张亚东郑佳朱镇陈涛赵庆勇周丽慧姚姝赵凌赵春芳于新王才林
关键词:水稻QTL
文献传递
水稻粒长基因GS3和qGL3功能标记的设计及应用被引量:8
2014年
水稻粒型是与其产量直接相关的重要性状。在前期研究证实来源于特大粒水稻TD70和籼稻品种Kasalath的重组自交系(RIL)群体中检测到已克隆的粒长GS3和q GL3基因的基础上,通过TD70和Kasalath的GS3、q GL3基因序列差异分析,设计功能标记,检测240个RILs和不同粒长的6个粳稻、9个籼稻中GS3、q GL3基因类型及其效应。结果显示:TD70和Kasalath中的GS3基因和q GL3基因分别在第2外显子上的编码区+165位置和第10外显子上的编码区+1 092位置存在一个由碱基C到碱基A的单核苷酸替换,据此设计了四引物扩增受阻突变体系(Tetra-primer ARMS-PCR)标记,TD70的GS3和q GL3基因分别扩增为270 bp和145 bp条带及448 bp和288bp条带,Kasalath的GS3、q GL3基因分别扩增为270 bp和175 bp条带及448 bp和216 bp条带;240个RILs中含有GS3-T和q GL3-T基因的株系61个,含GS3-T和q GL3-K的株系48个,含GS3-K和q GL3-T的株系17个;不同粒型基因组合的粒长存在显著差异,表现为GS3-T+q GL3-T>GS3-T+q GL3-K或GS3-K+q GL3-T>GS3-K+q GL3-K;长粒型的1个粳稻和5个籼稻品种的GS3基因表现为TD70带型,短粒型的5个粳稻和4个籼稻品种的GS3基因表现为Kasalath带型;所有水稻品种的q GL3基因均表现为Kasalath带型。表明开发的GS3和q GL3基因功能标记是有效的,可用于水稻分子标记辅助育种。
丁丹张亚东郑佳赵春芳陈涛赵庆勇朱镇周丽慧姚姝赵凌于新王才林
关键词:水稻
极端粒形水稻粒宽基因GW2的序列分析和效应被引量:3
2014年
粒形是影响水稻产量的重要因子,对粒形相关基因的发掘和利用一直倍受重视。在已克隆的粒形基因中,GW2是一个控制粒宽的重要基因。通过同源克隆的方法,获得极端大粒水稻TD70和极端小粒水稻Kasalath的GW2基因cDNA片段,分析序列差异,设计功能标记,检测240个来源于TD70/Kasalath的重组自交系(RILs)和部分籼稻骨干恢复系、江苏省主栽粳稻品种的基因类型及其效应。结果表明,TD70的GW2与大粒粳稻WY3完全一致,与已知序列(GenBank:EF447275)相似性达99.77%,在碱基的第114位,T突变为C,但并不改变氨基酸性质;在第316位缺失碱基A,造成316位以后的所有碱基前移一位,氨基酸均发生变化,在碱基的第346、第347、第348位形成TAA的终止密码子,提前结束了TD70的GW2蛋白的表达。而Kasalath的GW2序列仅在碱基的第114位,由T突变为C,但并不改变氨基酸性质;GW2Kasalath的316位没有突变,表达没有提前终止;设计的dCAPs标记,产物经内切酶ApoI酶切,TD70为21bp和30bp两个片段,而Kasalath条带为51bp;240个RILs中含GW2TD70基因的株系有82个,含GW2Kasalath基因的株系有158个,两者在粒宽和粒重表型上存在显著差异;8个籼稻骨干恢复系和10个江苏省主栽粳稻品种中都不存在GW2TD70基因。GW2TD70基因对籽粒宽度有一定的调控作用,水稻育种中可以利用GW2TD70基因来提高籽粒粒重。
张亚东梁彦丽郑佳丁丹赵春芳陈涛赵庆勇朱镇周丽慧姚姝赵凌于新王才林
关键词:水稻粒形
极端粒形水稻品种GS5基因的序列及效应分析被引量:1
2015年
为明确粒型控制基因GS5在2种极端粒型水稻中的序列差异和作用,本研究利用极端大粒型水稻品种TD70和小粒型水稻品种Kasalath对粒宽控制基因GS5进行了克隆和序列分析,根据序列比对结果设计分子标记,用来区分不同来源的GS5基因,并结合重组自交系的粒型信息分析该基因对粒型的调节作用。结果显示,该基因包含10个外显子和9个内含子,与TD70的GS5基因相比,Kasalath的GS5基因第1外显子上编码的第31位氨基酸由甘氨酸变成丙氨酸,同时在第36、37位缺失2个甘氨酸。以这2个氨基酸的缺失为基础,设计简单重复序列(SSR)分子标记并在2个品种及其重组自交系(RIL)中进行了验证。利用该标记可以在含有GS5-T的品种中扩增出216 bp的片段,在含有GS5-K的品种中扩增出210 bp的片段。对重组自交系的检测结果显示,含有GS5-T基因的株系有122个,含有GS5-K基因的株系有118个。含GS5-T基因的株系平均粒宽比含GS5-K基因的株系平均粒宽高出0.47 mm,千粒质量高出2.87 g,说明GS5是水稻粒宽性状的主效调控基因。
郑佳丁丹梁彦丽张亚东王才林
关键词:水稻克隆
TD70/Kasalath RILs群体检测水稻穗部主要性状位点
水稻穗部是贮存光合作用产物的主要场所,是形成经济产量的主要部位。穗部形态也是株型育种的重要研究内容。水稻穗部性状主要包括穗长、枝梗数和每穗总粒数等,它们是构成稻穗的"基本骨架",是影响谷粒产量的重要性...
张亚东于新王才林董少玲张颖慧陈涛赵庆勇朱镇周丽慧姚姝赵凌
关键词:水稻重组自交系穗部性状位点
QTL Mapping for Grain Size Traits Based on Extra-Large Grain Rice Line TD70被引量:4
2013年
Grain size traits, including grain length, grain width and grain thickness, are controlled by quantitative trait loci (QTLs). Many QTLs relating to rice grain size traits had been reported, but their control mechanisms have not yet been elucidated. A recombinant inbred line (RIL) population of 240 lines, deriving from a cross between TD70, an extra-large grain size japonica line with 80 g of 1000-grain weight, and Kasalath, a small grain size indica variety, were constructed and used to map grain size QTLs to a linkage map by using 141 SSR markers in 2010 and 2011. Five QTLs for grain length, six for grain width and seven for grain thickness were detected distributing over chromosomes 2, 3, 5, 7, 9 and 12. Seven QTLs, namely qGL3.1, qGW2, qGW2.2, qGW5.1, qGW5.2, qGT2.3 and qGT3.1, were detected in either of the two years and explained for 56.19%, 4.42%, 29.41%, 10.37%, 7.61%, 21.19% and 17.06% of the observed phenotypic variances on average, respectively. The marker interval RM1347-RM5699 on chromosome 2 was found common for grain length, grain width and grain thickness; qGL3.1 and qGT3.1 were mapped to the same interval RM6080-RM6832 on chromosome 3. All 18 QTL alleles were derived from the large grain parent TD70. Most of the QTLs mapped in the present study were found the same as the genes previously cloned (GW2, GS3 or qGL3, GW5 and GS5), and several were the same as the QTLs (GS7 and qGL-7) previously mapped. Three QTLs, qGL2.2 on chromosome 2, qGW9 and qGT9 on chromosome 9, were first detected. These results laid a foundation for further fine mapping or cloning of these QTLs.
ZHANG Ya-dongZHANG Ying-huiDONG Shao-lingCHEN TaoZHAO Qing-yongZHU ZhenZHOU Li-huiYAO ShuZHAO LingYU XingWANG Cai-lin
关键词:RICE
共2页<12>
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