国家自然科学基金(31271608)
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 相关作者：徐海明周佳萍楼向阳蒋蓓蓓余世洲更多>>
- 相关机构：浙江大学学研究院阿拉巴马大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于四交群体的连锁图谱构建(英文)
- 2014年
- 目前,遗传连锁图谱构建主要基于两纯系亲本交配的衍生群体,存在遗传多样性不足等局限,不适合于烟草等基因组多样性较低的物种,因为往往没有足够的多态性标记可用于图谱的构图,稀疏的标记图谱很难有效用于标记辅助选择及基因定位.本研究提出了基于四交群体的遗传图谱构建方法,通过计算机模拟验证了该方法的可行性和有效性,研制了配套的计算机分析程序.该方法的主要步骤及特点如下:1)基于最大似然法估计成对标记间的遗传距离;2)基于标记距离矩阵进行聚类分析,将标记分成不同的类群(连锁群);3)对每一连锁群,先确定连锁群两端的标记,再通过3标记间遗传距离的比较,将其他标记逐步插入到合适的排列位置,最终确定整个连锁群的标记顺序.蒙特卡洛模拟证实了该方法可行、有效,且适用于其他2个自交系亲本交配的衍生群体.
- 蒋蓓蓓余世洲肖炳光楼向阳徐海明
- 关键词：蒙特卡洛模拟
- 烟草核心种质库构建及遗传多样性研究(英文)被引量：1
- 2014年
- 为有效地研究烟草遗传多样性和筛选潜在的繁殖材料,以贵州省烟草科学研究院805份烟草种质为实验材料,分别在贵州省金沙和福泉2个试验点进行多点田间试验,并采用混合线性模型预测12个农艺性状的基因型效应值,以构建烟草的核心种质库并研究其遗传多样性.结果表明,待预测的12个农艺性状中,11个性状有显著的基因型效应,10个性状有显著的基因型与环境互作效应.利用预测的基因型值,比较不同抽样方法、抽样比率和系统聚类方法下核心子集多样性的结果表明,在10%抽样比率下,重心法聚类结合优先取样获得的S1C3_10子集成为烟草种质库的核心子集.通过主成分分析法比较核心种质与原始群体样本分布的空间结构和特征,运用相关系数检验原始群体性状间的遗传关系是否被核心种质很好地保留.结果表明,核心种质库能很好地代表烟草农艺性状的遗传多样性.一些潜在的高产育种材料如Y177和Y178也被包含在内.综上表明,作为种质资源的一个核心子集,烟草核心种质库的构建将有利于烟草育种者对整个资源的了解,促进遗传多样性在今后烟草育种计划中的利用.
- 周佳萍杨春元吴春王仁刚史跃伟谢升东王志红徐海明任学良
- 关键词：烟草核心种质
