中国博士后科学基金(2011M500535)
- 作品数:2 被引量:5H指数:1
- 相关作者:尚娜周志军刘静石福明常岩林更多>>
- 相关机构:河北大学更多>>
- 发文基金:中国博士后科学基金国家教育部博士点基金国家自然科学基金更多>>
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- 基于线粒体DNA控制区的斑翅草螽不同地理种群遗传分化研究被引量:1
- 2013年
- 采用PCR扩增结合DNA克隆测序技术,分析了斑翅草螽Conocephalus maculates 9个地理种群mtDNA控制区序列的变异及遗传多样性。切除侧翼RNA基因序列后,最终获得的斑翅草螽mtDNA控制区比对后全长为676 bp,平均碱基组成T(37.8%),C(11.7%),A(41.3%)和G(9.1%)。共检测到98个可变位点,占总位点数的14.5%,其中,9处碱基插入/缺失,74处转换(40个T/C,34个A/G),50处颠换(18个A/T,11个T/G,15个A/C,6个C/G)。共定义46个单倍型,其中,4个为种群间共享单倍型(H02、H05、H08和H10),其余42个为各种群独有单倍型,包括6个种群内共享单倍型(H09、H11、H15、H18、H26和H38)。单倍型总数占实验个体总数的69.7%,除四川峨眉山外,其余种群单倍型百分比均﹥50%。通过两两地理种群间的FST值差异显著性检验,将这些群体分为4组,分别为SC+CQ,GX+FLB+HN+YN,XZ和HB。以长瓣草螽C.gladiatus、峨眉草螽C.emeiensis、悦鸣草螽C.melaenus、竹草螽C.bambusanus为外群,构建的斑翅草螽mtDNA控制区单倍型NJ法系统树形成3个自举支持度较高的分支,其中,分支A由28种单倍体组成,包括本研究中除四川峨眉山(SC)和重庆万州(CQ)以外的7个种群;分支B由12种单倍体组成,包含除菲律宾拉乌尼翁(FLB)和江西南昌(JX)以外的7个种群;分支C由6种单倍型组成,全部来自西藏林芝(XZ)的单倍型。聚类结果表明,斑翅草螽不同地理种群间的遗传分化并不明显,即使是两两群体间FST值差异显著的群体,也未能形成完全独立的分支。
- 周志军尚娜刘静常岩林石福明
- 关键词:线粒体DNA控制区系统进化
- 科研成果移植为生命科学专题教学实验——以DNA条形码研究为例被引量:4
- 2013年
- 介绍了一种由DNA条形码科研成果移植而来的生命科学专题教学实验。该实验体系稳定、重复性好、综合性强,具备很好的可操作性。实践证明,此项目可以激发学生创新精神和提高学生知识的综合运用能力。
- 尚娜周志军
- 关键词:实验教学DNA条形码