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寒区典型湿地浮游植物功能群季节变化及其与环境因子关系被引量：23: 2015年; 安邦河湿地是一个典型的寒区湿地,本文运用功能群的方法对其浮游植物季节变化进行研究,并运用多元分析方法分析其与环境因子的关系.安邦河湿地共有浮游植物种8门104种,划分为14个功能群,分别是C、D、E、F、H1、J、Lo、M、MP、N、P、SN、X1和Y.其中重要功能群是C、D、E、J、Lo、N、P和Y.浮游植物的功能群组成季节变化明显,春季以功能群E和Lo生物量所占比例最大,分别为27.45%和20.49%;夏季以功能群D、J、P占优,为28.59%、18.53%和19.47%;秋季以功能群J、P为主,占39.65%和13.34%.可见,安邦河湿地浮游植物功能群的季节变化呈现为E+Lo→D+J+P→J+P的特点,反映了水环境特征:春季低水温低营养盐、夏季高水温高营养盐且水体混浊、秋季水温和营养盐均较高.运用冗余分析(RDA)分析浮游植物功能群与环境因子之间的关系,结果显示水温(WT)、无机氮(DIN)和溶解性磷酸盐(SRP)是安邦河湿地浮游植物功能群季节变化的主要环境因子.; 武安泉郭宁覃雪波; 关键词：浮游植物功能群安邦河湿地寒区

沙蚕生物扰动对河口沉积物中菲释放的影响被引量：7: 2014年; 生物扰动是一个重要沉积物-水界面过程,影响沉积物中污染物的归趋.为了探究生物扰动对沉积物中多环芳烃释放的影响.在室内进行30 d的沙蚕生物扰动对河口沉积物中菲释放的影响实验.结果表明,相对于对照,生物扰动提高水体中颗粒态菲达到2.96~10.35倍,溶解态菲为9.55~17.44倍.由此可见,沙蚕的生物扰动极大的促进了沉积物中菲向水体释放.在生物扰动处理中,两种形态的菲所占比例不同,其中溶解态菲占释放总量的80%以上,表明沙蚕的生物扰动主要是提高水体中溶解态菲.由于溶解态菲能被生物所利用,通过食物链威胁人类健康.因此,沙蚕生物扰动造成的沉积物中的污染物释放具有潜在的生态风险.; 李俐俐武安泉覃雪波; 关键词：生物扰动沙蚕沉积物

基因组尺度代谢网络自动重构及分析工具研究进展被引量：7: 2012年; 高通量数据的产出为基因组尺度代谢网络的构建提供了基础,但同时也对网络构建和分析方法的改进提出了挑战。随着数据量的不断增大,耗时耗力的人工构建及分析已经无法满足模型发展的需要,因而各种自动化的方法应运而生。模型构建和分析的自动化不仅能够大幅度提高模型构建和解析的速度,同时对于模型构建和分析方法的标准化和程序化也有着不可替代的作用。文中结合作者的实际研究经验,对基因组尺度代谢网络构建的自动化进程和主要的代谢网络分析工具进行了较为详细的介绍,总结了代谢网络自动重构的流程,并提出了目前面对的主要问题和未来的研究方向。; 郝彤马红武赵学明; 关键词：代谢网络网络分析

大尺度代谢网络通量平衡分析的进展与应用被引量：1: 2013年; 利用大尺度代谢网络分析生物体内部复杂的生化机制已经研究了很多年,大尺度代谢网络的算法也有很多,在这其中通量平衡分析是一个有效的定量研究基因组尺度代谢网络的方法,并在很多分析中都有应用。总结了通量平衡分析算法的最新进展,包括基本的通量平衡分析以及扩展的通量平衡分析算法,然后介绍了一些应用通量平衡分析算法模拟大型生物网络的单机的和在线的工具,最后还比较了这些工具的优缺点,并讨论了目前代谢网络分析算法与软件存在的难题和未来的研究方向。; 李慧马红武郝彤

生物扰动对沉积物中污染物环境行为的影响研究进展被引量：15: 2014年; 生物扰动由于显著改变沉积物结构和性质,进而影响沉积物中污染物的环境行为。综述生物扰动对沉积物中氮、磷、重金属和疏水性有机污染物环境行为的影响。生物扰动促进这些污染物从沉积物向水体释放。生物扰动还对不同的污染物产生其它不同的影响。对于氮,生物扰动还影响其硝化与反硝化作用;对于磷,生物扰动不仅改变其化学形态,还提高有机磷降解。对于重金属,生物扰动还能改变其在沉积物中的分布及化学形态。对于疏水性有机污染物,生物扰动主要增强生物富集和代谢,以及提高生物降解。; 覃雪波孙红文彭士涛戴明新; 关键词：生物扰动沉积物氮磷重金属疏水性有机污染物环境行为

云计算在生物技术领域的应用被引量：3: 2012年; 随着基因组测序等生物学技术的发展,海量生物学数据不断产生,生物计算对计算能力和存储量的要求也越来越高.云计算所具有的高速的计算能力、高存储量以及使用方便等特点能够很好地满足生物研究的需求,融合云计算成为生物计算发展的趋势.总结了可用于生物技术领域的云平台以及云计算在生物学研究中的应用,并指出了云计算在生物技术领域的发展前景及面临的挑战.; 郝彤马红武赵学明; 关键词：云计算生物技术生物计算

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中国博士后科学基金(2011M500512)