博士科研启动基金(EA200506141)
- 作品数:1 被引量:7H指数:1
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- 基于序列结构信息的多序列比对算法被引量:7
- 2007年
- 在介绍生物信息学中多序列比对定义和原理的基础上,给出了序列结构信息集的表示形式和基于序列结构信息的度量函数,该函数只与参加比对序列自身信息有关,不受主观因素的影响,能更客观、有效地反映生物序列之间的进化距离。通过利用该函数计算序列间的进化距离,在渐进比对的基础上,采用迭代策略,不断修正指导树,进而提高比对的准确性,避免了局部最优问题。最后,通过实验模拟,本算法在保证不提高计算时间复杂度的基础上,提高了序列比对的准确性,同时也很好地反映了生物学意义。
- 张永李其申江泽涛蔡虹
- 关键词:生物信息学多序列比对