教育部科学技术研究重点项目(104066)
- 作品数：4 被引量：3H指数：1
- 相关作者：李玉林李一雷李群杨新宇张丽红更多>>
- 相关机构：吉林大学吉林大学第二医院吉林大学第一医院更多>>
- 发文基金：教育部科学技术研究重点项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 人高转移性和低转移性前列腺癌细胞株荧光差异凝胶电泳图像分析被引量：1
- 2008年
- 目的:比较人高转移性前列腺癌细胞株(PC-3M)和人低转移性前列腺癌细胞株(PC-3)间差异表达的蛋白质,拟发现早期诊断和逆转前列腺癌转移的分子标志物。方法:应用差异凝胶电泳(DIGE),分离PC-3M和PC-3细胞株的总蛋白,用图像分析软件比较分析并识别细胞间的差异表达蛋白质。结果:应用DIGE进行分离后,成功地获得了蛋白质组分辨率高、重复性好的双向凝胶电泳图谱,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)成功鉴定出11种蛋白质,其中9个蛋白质点仅在PC-3中有表达,2个蛋白质点仅在PC-3M中有表达。结论:人高、低转移前列腺癌细胞株的蛋白质组表达存在明显差异,这些差异蛋白质有可能为进一步发现前列腺癌转移相关分子和阐明前列腺癌侵袭转移的分子机制提供实验证据。
- 李群李一雷常明杨新宇王志新梅红夏阳李玉林
- 关键词：蛋白质组
- 前列腺上皮细胞的膜蛋白成分分析
- 2008年
- 目的分析前列腺上皮细胞的膜蛋白质构成。方法将无前列腺病史的尸检前列腺标本常规制备冰冻组织切片，通过激光捕获显微切割（LCM）从组织冰冻切片中切取前列腺上皮细胞，Shotgun-MS技术分析膜蛋白质组学构成。结果激光捕获显微切割可正确有效地分离前列腺上皮细胞，其同质性〉95％；在严格的过滤参数条件下（当Charge＋1，Xcorr≥1．9；当Charge＋2，Xcorr≥2．2；当Charge＋3，Xeorr≥3．75；其中DelCN≥0．1），正常前列腺上皮细胞中鉴定出1164个蛋白，其中799个蛋白经过基因本体评注（GOA）显示为已知细胞组分，其余为未知细胞组分。在已知细胞组分中377（49．15％）个蛋白为膜蛋白或者膜相关蛋白。除了已知的与膜相关的蛋白，很多新的蛋白也被鉴定，其中包括假设蛋白和一些cDNA序列。结论Shotgun—MS结合LCM技术可以有效分析前列腺的膜蛋白质构成；有助于正常前列腺细胞膜蛋白质表达库的完善。
- 李群李一雷李伟杨新宇王艺昧李玉林
- 关键词：前列腺上皮细胞膜蛋白质类
- 转移潜能不同的人前列腺癌细胞系差异膜蛋白质组学的分析被引量：2
- 2008年
- 目的:通过应用鸟枪法蛋白质组学技术发现早期诊断和逆转前列腺癌转移的分子标志。方法:应用鸟枪法蛋白质组学技术,比较人高转移前列腺癌细胞株(PC-3M)和人低转移前列腺癌细胞株(PC-3)间膜蛋白表达的差异。用SDS-PAGE胶分离膜蛋白,并且进行胰酶消化,用反相液相色谱分离肽混合物后进行ESI-MS/MS鉴定,用数据库查询结合生物信息学技术比较分析并识别细胞间的差异表达膜蛋白。结果:1)利用Gel-1DLC-MS/MS分析,在严格的过滤参数条件下鉴定了PC-3和PC-3M两种细胞中的蛋白,在PC-3细胞中鉴定了2172个蛋白,在PC-3M细胞中鉴定了2023个蛋白。2)用GOA分析软件进行分类,PC-3细胞中1499个蛋白为已知细胞组分,其中564(38.13%)个蛋白为膜蛋白或者膜相关蛋白;PC-3M细胞中1391个蛋白为已知细胞组分,细胞组分中527(38.30%)个为膜蛋白或者膜相关蛋白。几个假设蛋白和cDNA序列也被预测。3)用蛋白名称和IPI数据库号对比分析后发现有161个蛋白质仅在PC-3前列腺癌细胞株中检测到有表达,135个蛋白质仅在PC-3M中检测到有表达。结论:人高、低转移前列腺癌细胞株的膜蛋白表达存在明显差异,为进一步发现前列腺癌转移相关分子和阐明前列腺癌侵袭转移的分子机制提供实验证据。
- 李群李一雷李荣贵张丽红张慕蕊李玉林
- 关键词：鸟枪法
- 双向凝胶电泳结合激光捕获显微切割技术成功构建人正常前列腺细胞的双向电泳图谱
- 2007年
- 目的:建立正常前列腺细胞的蛋白质组学研究的技术体系,全面展示正常前列腺细胞的蛋白质表达谱。方法:用激光捕获显微切割(LCM)技术获取正常前列腺组织中的上皮细胞,提取细胞中的蛋白质,建立固相pH梯度双向凝胶电泳图谱,应用图像扫描仪及ImageMaster 2D Evolution分析软件获得蛋白质点的数字化和匹配性信息,挑选匹配良好的高丰度蛋白点,进行基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定。结果:成功构建出正常前列腺细胞的双向电泳图谱,并用MALDI-TOF-MS成功鉴定出正常前列腺细胞的一个蛋白质点。结论:正常前列腺细胞的蛋白质样品双向电泳图谱重复性良好,初步建立了正常前列腺细胞的蛋白质组学研究技术并验证了该技术的可行性。
- 李群李一雷杨新宇张海英李会敏李玉林
- 关键词：前列腺细胞激光捕获显微切割双向凝胶电泳蛋白质组学
