“十一五”国家科技支撑计划(2006BAI05A01) 作品数:18 被引量:83 H指数:6 相关作者: 唐常杰 李太勇 吴江 姜玥 陈瑜 更多>> 相关机构: 四川大学 西南财经大学 西南民族大学 更多>> 发文基金: “十一五”国家科技支撑计划 国家自然科学基金 四川省青年软件创新工程基金 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 医药卫生 更多>>
基于通用多核处理器平台的并行基因表达式编程算法 被引量:1 2011年 基因表达式编程(Gene Expression Programming,GEP)是一种计算量大且通用性强的新型进化算法,其传统计算形式不能充分利用目前主流的多核处理器。为提高算法效率,提出了基于通用多核处理器平台的并行基因表达式编程算法(Parallel Gene Expression Programming Based on General Multi-core Processor,PGEP-MP)。主要工作包括:(1)分析通用多核处理器平台下并行基因表达式编程算法的机理;(2)利用MPI和OpenMP混合编程模型设计基于通用多核处理器平台的基因表达式编程算法的粗粒度与细粒度相结合的并行模型;(3)提出改进PGEP-MP算法效率的进化策略;(4)通过对函数挖掘和分类的实验证明,PGEP-MP算法提高了函数挖掘和分类的效率,在并行双核处理器数为4的情况下,PGEP-MP的平均并行加速比分别是传统GEP算法的4.22倍和4.06倍。 吴江 唐常杰 李太勇 姜玥 李自力 刘洋洋关键词:基因表达式编程 多核处理器 进化算法 干预规则挖掘的概念、任务与研究进展 被引量:1 2011年 干预规则挖掘是近年从干预实践中提出的新型数据挖掘任务,旨在利用数据挖掘技术探测干预事件,发现最佳干预时机和力度,提供促进事物向期待状态转化的决策支持.文中以四年的研究实践为背景,介绍干预规则挖掘的研究沿革和现状,给出了干预规则挖掘的任务分类.从三个角度,即干预效果预测、干预方法发现和未知干预探测三方面,介绍干预规则挖掘的研究问题、困难和成果.展望了干预规则挖掘未来研究方向. 段磊 唐常杰 杨宁 左劼 王悦 郑皎凌 徐开阔关键词:数据挖掘 流数据 不确定数据 时间序列 基于基因表达式编程的Hammerstein模型的辨识 被引量:1 2008年 针对辨识Hammerstein模型的传统方法需假定系统结构或阶次,且过程复杂的问题,本文将基因表达式编程技术引入Hammerstein模型辨识,做了下列工作:①证明了Hammer-stein模型的渥尔特拉核,给出了系统稳定的充分必要条件;②形式化描述了结构体和参数体等新概念;③提出基于基因表达式编程的Hammerstein模型辨识的新方法(HMI-GEP),全自动地构造模型结构和决定参数。实验结果表明:该方法简单、有效,改善了辨识性能;模型结构采用不同的形式表达,参数估计的最低准确率约为93%。 姜玥 唐常杰 李川 李生智 叶尚玉 吴江关键词:基因表达式编程 HAMMERSTEIN 系统辨识 非线性系统 关联文本分类的规则修正策略 被引量:6 2009年 通过分析基于关联规则的文本分类,发现在保持分类规则对正例样本正确分类的同时减少对反例样本的错误分类可以提高分类的精确度.基于否定选择算法的思想提出了分类规则修正策略,用反例样本集合对分类规则进行耐受,从分类规则错误判别的反例样本中再产生规则,与原来的规则组成新规则,称为增强关联规则.基于修正策略产生的增强关联规则可以大幅度地减少对反例样本的错误分类,从而提高分类的精确度.通过形式化证明和实验,分类规则修正策略的有效性得到验证. 邱江涛 唐常杰 曾涛 刘胤田关键词:关联规则 文本分类 否定选择算法 国家级妇幼卫生监测数据网络直报系统信息安全现状分析 被引量:8 2013年 通过调查妇幼卫生监测数据网络直报系统的相关资金投入、设备建设和信息安全措施,探讨中国妇幼卫生监测数据网络直报系统的信息安全现状。方法选择2009年1月至2011年12月参与全国妇幼卫生监测数据网络直报工作的546家各级妇幼保健监测机构作为研究对象。采用自填式问卷调查参与直报工作的保健机构信息系统的资金投入、设备建设和采用的信息安全措施情况,分析不同行政级别(省、地市和区县)和地区(东部、中部、西部)间的差异。结果本研究回收有效问卷为503份。2009-2011年间,监测机构信息化资金总额为1.97亿元,直接用于监测的经费仅占16.17%。机构平均投入和单位平均监测专用资金方面,东部地区均高于中部和西部地区,省级机构高于地市级和区县级机构。资金来源为本单位自筹的机构分别占41.16%,来源为上级拨款的机构占7.83%,来源为监测项目的机构分别占29.29%。资金的主要用途为购买计算机硬件和网络设备。无监测专用计算机、服务器、硬件防火墙和不间断电源系统(UPS)设备的监测机构分别占14.51%,26.84%,77.14%和42.94%;无局域网、单机病毒防护措施的机构占9.85%和9.09%。结论现有妇幼卫生监测机构信息安全发展不平衡,中部和西部地区滞后于东部地区,县级机构滞后于地市级和省级机构。妇幼卫生监测机构应增加计算机硬件投入和加强网络设备建设,以满足卫生行业信息化发展的需求。 刘铮 代礼 朱军 李琪 马霞 牟祎关键词:妇幼卫生监测 信息安全 基于GEP基因约简策略的多项式因式分解 被引量:1 2009年 将基于基因表达式编程(GEP)的公式发现技术用于多项式因式分解。对标准GEP中个体染色体适应度评价算法和遗传算子进行了改进,提出了一种新的基于GEP的基因约简算法及多项式因式发现算法(以下称FactorGEP算法),分析了多项式因式发现的特殊困难,提出了将有效基因个数作为适应度评价因素的解决方案。试验结果表明,FactorGEP算法完全不需要关于分解的多项式的任何先验知识,可以自动对多项式进行因式分解,并找到最佳的分解。 陈瑜 唐常杰 朱明放 代术成 朱锐 姜玥 李川关键词:人工智能 基因表达式编程 进化计算 双亲5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与子代神经管畸形易感性的关系 被引量:8 2011年 目的 定量评价双亲5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T多态性与子代神经管畸形(NTDs)发生的关联性及关联强度,为利用双亲MTHFR 677位点基因型预测和评价子代NTDs的发病风险提供依据.方法 制定原始文献的纳入和排除标准及检索策略.检索中外数据库,收集有关亲代MTHFR基因C677T多态性与NTDs相关性的研究报告,按照MTHFR基因677位点基因型分类,分别整理子代患NTDs的双亲基因型频数数据,应用RevMan5.0软件对各文献进行异质性检验和Meta分析,得出合并后的OR值及其95%CI.结果 共33篇文献符合纳入标准.数据合并结果显示,母亲MTHFR基因677位点TT/CC、CT/CC基因型频率与子代NTDs易感性之间有统计学意义,OR值(95%CI)分别为1.68(1.32~2.14)、1.20(1.07~1.35);父亲MTHFR基因677位点TT/CC、CT/CC基因型频率与子代NTDs易感性有统计学意义,OR值(95%CI)分别为1.38(1.08~1.76)、1.32(1.13~1.55).结论 双亲MTHFR基因C677T多态性均是子代NTDs发病的重要危险因素. 刘铁诚 王志萍 赵仲堂关键词:神经管畸形 基因多态性 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶 妊娠期被动吸烟与出生缺陷关系的Meta分析 被引量:9 2010年 目的探讨孕期被动吸烟与出生缺陷的关系。方法运用计算机检索1980年至2010年4月国内外关于孕期被动吸烟与出生缺陷关系的研究文献,采用Cochrane协作网提供的RevMan5.0分析软件对入选的文献进行异质性检验,经Meta分析计算合并效应OR值及其95%CI。结果国内外25篇文献入选。森林图显示纳入文献是异质的(χ2=243.98,P〈0.000 01),采用随机效应模型计算孕期被动吸烟与出生缺陷关联性的合并效应的OR值为1.70,95%CI:1.34~2.15。其中,国内和国外不同研究人群合并效应的OR值分别为3.62(95%CI:1.71~7.68)和1.28(95%CI:1.04~1.57)。结论孕期被动吸烟可能会增加出生缺陷发生风险。 尚肖肖 王志萍 赵仲堂关键词:被动吸烟 妊娠 META分析 基于多表达式基因编程的复杂函数挖掘算法 被引量:4 2008年 传统的基因表达式编程(Gene Expression Programming)挖掘复杂函数时,存在进化辈数过大、无法跳出局部最优解等问题,提出了基于多表达式基因编程的遗传进化算法,提高GEP的全局寻优能力,提出了一种新的多表达式基因编程的遗传进化算法(Multi Expression Gene Programming,MEGP),建立了同一染色体内基因多层次编码、解码模型,理论上分析并比较了MEGP算法的表达空间复杂性,实现了多表达染色体遗传进化算法和染色体适应度评价算法。实验表明,在解决函数挖掘问题中,MEGP成功率是传统GEP的2~4倍。 代术成 唐常杰 朱明放 陈瑜 乔少杰 向勇 李太勇关键词:基因表达式编程 函数发现 遗传进化 神经管畸形发生与孕产妇相关知识行为的相关性分析 被引量:4 2012年 目的探讨神经管畸形(neural tube defects,NTDs)的发生与孕产妇相关知识行为的关系。方法采用1∶1配比的病例对照研究,对210例神经管缺陷儿的母亲和210例非神经管缺陷儿母亲进行基本情况、NTDs相关知识认知及相关行为情况的问卷调查。结果产妇预防NTDs知识得分与NTDs关系的t检验显示,对照组知识得分(54.42±25.47)分高于病例组(42.17±26.61)分,差异有统计学意义(P<0.001)。进一步对其知识水平调查发现,本次孕前或孕期听说过叶酸、知道食物中含有叶酸在两组间差异有统计学意义(P分别为<0.001和0.001)。对进行婚前医学检查、接受健康教育、进行遗传优生咨询分别进行条件Logistic回归分析,发现3项在两组间差别均有统计学意义(OR分别为0.525、0.247、0.545;P分别为0.017、<0.001、0.039)。多因素分析结果显示,接受健康教育和孕前或孕期听说过叶酸进入模型(P<0.001)。结论对照组产妇预防NTDs知识水平高于病例组,有自主保健行为者和预防NTDs知识水平高者生育NTDs患儿的风险小。应通过多种途径提高育龄期妇女的保健意识,使其主动接受健康教育,提高知识水平,以降低NTDs发生率,提高出生人口质量。 李颖 王金桃 武媛媛 见明智 周芩关键词:神经管畸形 健康知识 病例对照研究