国家社会科学基金(11CTQ016)
- 作品数：9 被引量：42H指数：4
- 相关作者：洪娜方安钱庆王军辉范炜更多>>
- 相关机构：中国医学科学院北京协和医学院四川大学华北水利水电学院更多>>
- 发文基金：国家社会科学基金国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：文化科学自动化与计算机技术更多>>
- 关联数据中关系发现的可视化实践被引量：18
- 2013年
- 基于关联数据开展关系发现的可视化实践研究:对当前的RDF可视化工具进行调研,从多种角度进行对比分析;选取生物医学作为分析领域,利用RelFinder实现基于生物医学关联数据的关系发现系统,并讨论系统存在的不足及未来的研究方向。
- 洪娜钱庆范炜方安王军辉
- 关键词：关联数据RDF可视化
- 一种基于词语相似度计算的本体映射方法被引量：6
- 2013年
- 本体映射是解决本体异构的有效手段。针对本体映射中概念相似度计算存在的不足,提出一种改进方法。将WordNet的同义词、近义词检索和编辑距离算法引入术语中心词之间的相似度判断过程,并借助新的自动权重分配方法对术语中心词和术语修饰词相似度进行集成。通过与同类典型本体映射方法对比实验证明,该方法具有良好的效果。
- 徐健方安洪娜
- 关键词：本体映射词语相似度概念相似度
- 利用RelFinder实现生物医学语义关系发现被引量：7
- 2013年
- 基于Web Data和Linked Data开展语义关系发现的探索和研究,选取生物医学为分析领域,利用RelFinder可视化工具开展了语义关系发现的应用和实现。文章首先对关系发现研究面临的困难和基于Web Data探索的新思路进行分析;然后对RelFinder的工作机制进行分析,从设计原则,ORVI过程和局限性三个方面做了系统阐述;并利用RelFinder和Virtuoso实现了基于生物医学Linked Data的语义关系发现系统。最后,讨论了系统存在的不足及未来的研究方向。
- 洪娜朱凯王军辉方安
- 关键词：DATARDF可视化语义WEB
- 中文非相关文献知识发现系统CmedLBKD构建被引量：5
- 2012年
- 针对现有非相关文献知识发现系统存在的问题,开展主题概念抽取、概念修剪和排序算法等关键技术问题的研究,构建中文非相关文献知识发现系统CmedLBKD,采用Swanson提出的经典假设"偏头痛"和"镁"验证CmedLBKD系统的有效性,同时提出了系统存在的问题及将来发展的方向。
- 钱庆洪娜李勇安新颖
- 关键词：非相关文献知识发现信息系统知识挖掘
- 四种SPARQL查询构建器及其比较研究被引量：3
- 2015年
- SPARQL查询构建器可以辅助用户实现SPARQL查询的半自动化构建。在总结SPARQL查询构建器一般类型的基础上,扼要地介绍Querymed、Viziquer、VQB、Bio SPARQL四种有代表性的构建器,并从所支持的条件输入方式、SPARQL语法、数据源个数等方面对这四种构建器进行比较研究。
- 郭少友魏朋争洪娜李木子
- 关键词：SPARQL数据源RDF本体
- 面向药物研发的大规模数据语义整合与挖掘模式探索被引量：2
- 2014年
- 整合并在语义层面上充分互连药物研发数据，将有利于从全局、系统化的视角开展药物研发工作，同时也有助于预测药物的不良副作用、加快药物研发流程、缩减药物开发成本等。文章试图探索语义技术如何支持药物研发数据的整合和挖掘，通过基于知识组织体系的语义标注，以及多类型实体互连策略构建充分互连的药物关联数据，支持药物研究人员对这些大量复杂实体及其关系的查找、探索和知识发现，从而帮助药物研发人员和，I盘床工作者更好地利用大规模药物数据，解决药物研发面临的实际问题。
- 钱庆洪娜李姣
- 关键词：语义整合RDF可视化药物研发
- 数据驱动的科学工作流及其在生物医学中的应用实践
- 2014年
- E—science关注数字环境下的科研活动，然而随着生物医学大数据的爆发，数据密集型科学研究为e·Science~来了新的挑战。科学工作流通过形式化科学计算的流程，支持在一个专门的程序环境下自动协调多任务多步骤的处理，从而减少科研投入，提高科研效率。文章首先归纳筑总结了科学工作流的相关定义，然后分析了当前主流的科学工作流系统，提出科学工作流处理如何应对密集的生物医学数据，并基于Taverna开展了生物医学领域的科学工作流实验。最后总结了科学工作流当前的研究现状和存在的一些问题。
- 洪娜钱庆方安吴思竹杨林
- 关键词：科学工作流
- 利用Hadoop/HBase的药物基因组数据云存储实践研究被引量：1
- 2015年
- 【目的】探索在导入、保存、检索、批量导出生物医学大数据方面的新思路和新方法,积累第一手经验。【方法】分析生物医学大数据的特点,从理论方面和数据查询对比实验两个方面,对比分析以Oracle为代表的传统关系数据库和以HBase为代表的No SQL数据库在解决大数据问题时各自采用的技术以及各自的优势与不足。以一个药物基因组数据存储系统为例,进行云存储实践和初步的对比实验。【结果】HBase在处理大量数据的实际应用中,比Oracle更具优势。【局限】没有对药物基因组学数据进行深入挖掘分析,同时需要对Hadoop/HBase做深入的技术优化。【结论】HBase在本文实验的应用场景中能够满足生物医学大数据存储的要求。
- 范云满洪娜钱庆方安
- 关键词：生物医学关系数据库NOSQLHADOOPHBASE
- 生物医学关联数据研究进展与比较分析被引量：4
- 2012年
- 首先介绍当前生物医学领域在数据资源集成与共享方面的发展需求,认为当前语义Web的主要技术之一———关联数据为生物医学发展带来重要的机遇,然后对生物医学领域关联数据基础研究、建设以及应用研究情况进行详细分析,进一步对典型生物医学关联数据进行具体特性方面的比较分析,指出当前发展面临的困难和问题,并提出今后发展的方向。
- 洪娜钱庆方安范炜李亚子王军辉
- 关键词：语义WEB关联数据生物医学映射
