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基因组育种值估计的贝叶斯方法被引量：14: 2014年; 基因组育种值估计是基因组选择的重要环节,基因组育种值的准确性是基因组选择成功应用的关键,而其准确性在很大程度上取决于估计方法。目前研究和应用最多的基因组育种值估计方法是贝叶斯(Bayes)和最佳线性无偏预测(BLUP)两大类方法。文章系统介绍了目前已提出的各种Bayes方法,并总结了该类方法的估计效果和各方面的改进。模拟数据和实际数据研究结果都表明,Bayes类方法估计基因组育种值的准确性优于BLUP类方法,特别对于存在较大效应QTL的性状其优势更明显。由于Bayes方法的理论和计算过程相对复杂,目前其在实际育种中的运用不如BLUP类方法普遍,但随着快速算法的开发和计算机硬件的改进,计算问题有望得到解决;另外,随着对基因组和性状遗传结构研究的深入开展,能为Bayes方法提供更为准确的先验信息,从而使Bayes方法估计基因组育种值准确性的优势更加突出,应用将会更加广泛。; 王重龙丁向东刘剑锋殷宗俊张勤; 关键词：贝叶斯方法

基于全基因组信息鉴定中国荷斯坦牛产奶性状基因及功能注释被引量：5: 2012年; 前期研究基于中国荷斯坦牛女儿设计资源群体,采用Illumina公司Bovine50K微珠芯片对产奶性状进行了全基因组关联分析(GWAS),利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)2种统计分析方法共同检测到35个显著SNPs位点。本研究旨在基于该GWAS结果进一步对产奶性状基因进行鉴定及功能注释。基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行显著SNPs位置候选基因筛查和功能预测。分析发现,12个SNPs位点位于基因内部,23个位于基因侧翼,最终鉴定到28个位置候选基因,并确定了其物理位置、基因类型及潜在功能。基因功能可归纳为6种类型:调节机体营养成分代谢和平衡、细胞骨架或基质成分、调节细胞增殖和周期及凋亡、参与细胞信号转导和盐离子通道构成、具有激酶活性、参与mRNA转录调控或翻译调控。该研究为进一步鉴定中国荷斯坦牛产奶性状主效基因及功能验证打下了基础。; 齐超谢岩吴晓平姜力刘剑锋孙东晓张勤张沅; 关键词：中国荷斯坦牛全基因组关联分析产奶性状功能注释

畜禽基因组选择研究进展被引量：31: 2011年; 基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择,也是一种标记辅助选择.此方法能够在提高育种值估计准确性的同时,通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展.随着畜禽高密度全基因组SNP芯片的问世,基因组选择方法正在影响着传统的畜禽遗传评估体系.在多数奶业发达国家,基因组选择方法正逐渐取代传统奶牛遗传评估方法,成为奶牛遗传评估的"标准"方法.近年来,针对基因组选择的方法、影响因素、应用策略和育种方案的研究大量涌现.基因组选择已经成为当前动物、植物及水产生物遗传育种领域的研究热点.本文综述了基因组选择的计算方法、准确性的来源及影响因素以及基因组选择在畜禽遗传育种中的应用现状,同时对当前存在的问题进行总结,并对基因组选择的理论发展和应用前景进行展望.; 张哲张勤丁向东; 关键词：标记辅助选择畜禽育种

中国荷斯坦牛凝血因子XI缺陷症遗传分析被引量：2: 2011年; 凝血因子XI缺陷症(Factor XI deficiency)是荷斯坦牛的一种常染色体单基因控制的隐性遗传缺陷。该病的遗传基础是由位于牛第27号染色体的凝血因子XI基因外显子12上发生的一段76bp序列插入。本研究采用PCR方法对我国13个主要公牛站的571头荷斯坦公牛的凝血因子XI基因进行了全面检测,未发现隐性有害基因携带者和纯合个体。; 东天谢岩孙东晓张沅张胜利张毅刘林陈绍祜; 关键词：分子诊断

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引进国际先进农业科技计划(2011-G2A)