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黑皮果蔗花叶病病原鉴定被引量：4: 2010年; 在南宁市郊采集到1份表现褪绿条纹、花叶的黑皮果蔗样品(NN-Ba2),经差速离心和PEG二次沉淀法提取病毒粗汁液,在电镜下观察到略弯曲的线状病毒粒子;DAC-ELISA检测显示NN-Ba2与甘蔗花叶病毒多克隆抗体和单克隆抗体呈阳性反应;根据SCMV和SrMV CP基因分别设计合成特异引物,利用RT-PCR对NN-Ba2进行分子鉴定,扩增出大小约900 bp的预期片段,健康对照未扩增到任何片段;NN-Ba2扩增片段经克隆后测序得到719个有效核苷酸,测序结果在DDBJ上用BLAST进行同源性分析,结果显示该序列与已报道的SCMV广东、云南、广西等地分离物对应的核苷酸序列同源性为97.36%～97.77%,根据马铃薯Y病毒科(Potyviridae)病毒种和株系的划分标准,NN-Ba2鉴定为SCMV。田间采集的另外10份表现花叶症状的果蔗样品经ELISA和RT-PCR检测,证明也感染了SCMV。; 秦碧霞蔡健和莫磊兴魏源文刘志明朱桂宁陆秀红; 关键词：黑皮果蔗 PCR鉴定

一种适用于甘蔗SSR-PCR的DNA快速提取方法被引量：6: 2010年; 以不同甘蔗品种幼苗期幼嫩叶片为材料,以改良SDS法和DNA快速提取法对甘蔗基因组DNA进行提取,并以SSR-PCR检测比较两者的扩增效果。结果表明,两种方法提取获得的基因组DNA条带基本一致,条带较为清晰,重复性好且稳定,均可满足SSR-PCR扩增的需要。但DNA快速提取法简化了SDS改良法,具有高通量、操作方便、简单、快速、成本低、DNA存放时间较长等优点,能在较短时间内完成大量样品的DNA提取。; 陈忠良秦翠鲜郭元元杨翠芳罗海斌何海波; 关键词：甘蔗 DNA提取

复合侵染甘蔗的病原病毒RT-PCR检测被引量：1: 2011年; 根据甘蔗花叶病毒(sugarcane mosaic virus,SCMV)、高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus,SrMV)和甘蔗黄叶病毒(sugarcane yellow leaf virus,SCYLV)外壳蛋白(CP)基因序列分别设计合成3对特异引物SCMV-F/R、SrMV-F/R和SCYLV-F/R,以表现花叶和黄叶复合症状的甘蔗叶片总RNA为模板,分别进行3种病毒单一RT-PCR检测,在SrMV和SCYLV特异引物RT-PCR反应体系中分别扩增到约850bp和630bp特异性片段。序列测定及同源性比对结果显示,850bp片段测序所得序列与浙江象山、临平和余杭SrMV分离物(GenBank登录号分别为AJ310194、AJ310195和AJ310198)对应序列同源性95%,630bp片段测序所得序列与广东、广西、福建SCYLV分离物(GenBank登录号分别为GU190165、GU190162、GU190159)对应序列同源性99%,表明该样品同时感染SrMV和SCYLV。在此基础上建立同时检测SrMV和SCYLV的一步双重RT-PCR体系,可检测1×10-6g病叶组织中的病毒,田间样品检测效果良好。; 秦碧霞蔡健和魏源文莫磊兴陆秀红刘志明; 关键词：甘蔗黄叶病毒 RT-PCR

巢式PCR检测甘蔗宿根矮化病病原: 由木质部限制性赖氏细菌木质部变种(Leifsonia xylisub sp.xyli,Lxx)引起的甘蔗宿根矮化病(Ratoon Stunting Disease,RSD)是世界甘蔗产区普遍发生的种苗传播病害,是导致宿根...; 秦碧霞莫磊兴魏源文黄金玲谢玲蔡健和刘志明陆秀红; 关键词：甘蔗宿根矮化病半巢式PCR; 文献传递

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广西壮族自治区科学研究与技术开发计划(0782004-5)