国家自然科学基金(31271774)
- 作品数：3 被引量：15H指数：2
- 相关作者：郜刚龚兴旺郭华春段婷婷薛珍更多>>
- 相关机构：山西师范大学云南农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家马铃薯产业技术体系建设项目山西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程农业科学生物学更多>>
- 受青枯菌诱导表达的马铃薯转录因子类StWRKY8的克隆与表达分析被引量：3
- 2015年
- [目的]从接种青枯菌(Ralstonia solanacearum)的马铃薯中薯3号(Solanum tuberosum)中克隆类St WRKY8部分序列,分析其序列结构特征,研究该基因在感、抗病基因型马铃薯中受诱导的差异表达模式及其不同的组织表达定位。[方法]分别培养抗病基因型马铃薯ED13、感病基因型中薯3号至9—10叶期,以伤根浸菌法接种青枯菌菌株PO41。提取叶片总RNA,反转录为cDNA,使用PCR筛选cDNA差减试剂盒构建消减文库,筛选出384个阳性克隆作为原始SMART cDNA文库,采用5'-RACE法根据SMART-RACE cDNA扩增试剂盒说明克隆全长类St WRKY8。并分别应用生物信息学软件Bio Edit、BLAST、MEGA 5.0分析类St WRKY8的基因序列、序列相似性比对以及建立系统进化树。利用Prot Param、Prot Scale、SWISS-MODEL、Net Phos2.0 Server、WOLF PSORT、Target P1.1Server等在线服务器预测类St WRKY8的理化特性、三级结构、磷酸化位点以及亚细胞定位。提取马铃薯ED13、中薯3号接种青枯菌后的叶片总RNA,采样时间点分别为处理后6 h、12 h、1 d、2 d、3 d、4 d和6 d,运用反转录PCR和荧光定量PCR检测类St WRKY8的表达情况。以类St WRKY特异PCR产物制备地高辛标记探针,取材料茎、叶组织制作石蜡切片,并与标记探针进行原位杂交,定位其组织表达。[结果]获得了类St WRKY8 cDNA部分序列,长563 bp,包括一个完整开放阅读框258 bp,编码85个氨基酸。类St WRKY8属于第二类WRKY,锌指结构类型为C2H2,具有一个典型的WRKY保守结构域。其氨基酸序列与茄科(Solanaceae)其他成员具有高度同源性,与马铃薯转录因子St WRKY8相似性高达98%。预测类St WRKY8等电点约为9.1,半衰期大于5.5 h,为水溶性蛋白,其三维结构为非球状分子,含有3个磷酸化位点,亚细胞定位于细胞内。类St WRKY8受青枯菌诱导后表达上调,且在感、抗病基因型马铃薯中表达有差异。类St WRKY8在感病基因型马铃薯接种青枯菌6 h内表达量较低,
- 薛珍李卉孔超越段婷婷郜刚
- 关键词：马铃薯青枯菌转录因子基因表达
- 马铃薯铁蛋白基因的克隆和生物信息学分析
- 植物铁蛋白(Ferritin)在进化上高度保守,具有贮存铁的功能。本研究从马铃薯栽培品种的‘中薯3号’中获得铁蛋白全长cDNA克隆StFb8。生物信息学分析序列表明:该eDNA含794 bp核苷酸,编码263个氨基酸,分...
- 智艳平李卉张海瑞郜刚
- 关键词：马铃薯铁蛋白生物信息学克隆
- 文献传递
- 青枯菌SRAP-PCR体系的建立与优化
- 2013年
- 本研究以马铃薯青枯菌P046为试验材料,应用单因素试验法优化SRAP-PCR反应体系,得出重复性好、带型清晰、稳定性强的最佳反应体系:总体积为10μL,50 ng/μL模板DNA 0.6μL、10μmol/L引物0.8μL、Tap DNA聚合酶1.0 U、10 mol/L、dNTPs 1.0μL.该反应体系可用于青枯菌遗传多样性、基因定位与克隆等的研究.
- 智艳平武喜艳安瑶瑶郜刚
- 关键词：青枯菌SRAP
- 马铃薯风味的研究进展被引量：12
- 2016年
- 马铃薯在人们的日常生活及健康方面扮演着重要角色。马铃薯风味作为马铃薯品质的一个重要组成部分,主要由香味、味道和质地组成。而马铃薯的香味主要由挥发性风味化合物所决定,如吡嗪、庚醛和己醛等;马铃薯味道主要是由非挥发性化合物所决定,如核苷酸和氨基酸;马铃薯的质地与其中干物质及淀粉含量有关;除此之外,马铃薯风味还与马铃薯的生产环境和贮藏环境有关。本文主要概述国内外在马铃薯的香味、味道及质地三方面的研究进展。
- 龚兴旺郭华春
- 关键词：马铃薯风味挥发性风味化合物
