中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(SJA0904) 作品数:6 被引量:202 H指数:5 相关作者: 匡猛 杨伟华 冯新爱 许红霞 王延琴 更多>> 相关机构: 中国农业科学院棉花研究所 更多>> 发文基金: 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 转基因生物新品种培育专项 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析 被引量:128 2011年 【目的】采用SSR标记构建2008年中国3大棉区8个棉花主产省份32份棉花主栽品种的DNA指纹图谱并进行遗传多样性分析。【方法】从214对候选引物中筛选出36对多态性高、稳定性好且在染色体上分布均匀的引物作为核心引物,构建棉花主栽品种DNA指纹图谱。【结果】36对SSR引物在32份材料中共扩增出142种多态性基因型,每对引物的基因型从2—11种不等,平均每对引物扩增出3.94种基因型。9对引物在10个品种上具有特征带型。最少采用5对引物进行组合鉴定即可将32个棉花品种完全区分开。NTSYS-pc V 2.10软件分析表明,长江流域棉区品种间遗传差异最大,新疆棉区次之,黄河流域棉区最小。常规品种的遗传基础窄于杂交陆地棉。【结论】核心引物组合法相比特征谱带法更适用于构建中国棉花主栽品种DNA指纹图谱,品种间的亲缘关系与地理来源有一定的相关性。 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱关键词:棉花 主栽品种 DNA指纹图谱 单粒棉花种子DNA快速提取方法 被引量:34 2010年 本研究以棉花干种子为材料,探索一种适用棉花品种SSR分析的DNA快速提取方法。先采用SDS提取液进行一步裂解,并将RNA的去除操作融入抽提过程,从而简单快速的获得高质量棉种基因组DNA。紫外检测与琼脂糖凝胶电泳检测结果均表明,所得DNA纯度高,完整性好。另外,SSR分析结果也显示,扩增带型清晰易辨,重复性与稳定性好。相比常规的以棉花幼苗叶片为材料的DNA提取法,本方法在降低实验成本的同时大大提高了工作效率。 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱关键词:棉花种子 DNA提取 SSR 棉花杂交种纯度的SSR标记检测及其与田间表型鉴定的相关性 被引量:26 2011年 以分布于棉花26条染色体的36对SSR核心引物,在6份成套中棉所系列杂交种间筛选双亲互补型杂合位点作为纯度检测标记,采用单位点平均法与双位点差异法统计SSR标记检测结果;在棉铃期考察棉花株型、铃形、叶形、花及茎等性状,比对田间表型与分子检测结果,分析相关性。结果表明,34对核心引物在6个杂交种上获得101个杂合位点,平均每个杂交种具有16.8个。田间表型鉴定结果高于分子标记检测结果,单位点平均法的相关性高于双位点差异法,校正后的相关性进一步提高,相关系数r=0.7841,呈高度相关。EST-SSR标记的检测结果与田间表型鉴定结果的相关性显著高于Genomic-SSR标记。相同染色体上的不同引物检测结果差异较小。不同的统计方法与标记类型获得的分子标记检测结果差异较大。高度纯合的亲本将会有效提高分子标记鉴定结果与表型鉴定结果的相关性。 匡猛 杨伟华 张玉翠 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅 周红关键词:棉花 杂交种 SSR 形态学 SSR分子标记在棉花研究中的应用 被引量:3 2012年 [目的]分析SSR分子标记在棉花研究中的应用,展望基于SSR的多色荧光标记检测技术的前景。[方法]通过概述SSR标记的原理、特点及其在棉花研究中的应用,展望了SSR的应用前景。[结果]SSR信息量丰富、揭示多态性高、重复性好、结果可靠,是一种快捷简便的分子标记,在棉花研究中已取得广泛应用。随着科技发展,基于SSR的多色荧光标记检测技术也将得到普遍应用。[结论]更好地了解了SSR标记的特点及其在棉花研究中的应用,为棉花育种等相关研究提供了理论依据和技术指导。 张玉翠 杨伟华 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅关键词:棉花 SSR 荧光检测 SSR分子标记研究进展及其在棉花上的应用 SSR标记的信息量丰富,揭示的多态性高,重复性好,结果可靠,在棉花品种真实性和纯度鉴定、遗传多样性分析、遗传图谱构建、QTL定位以及分子辅助育种等研究领域取得了较大进展。现行棉花中SSR检测是基于聚丙烯酰胺结合银染技术,... 张玉翠 杨伟华 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅关键词:棉花 SSR 荧光检测 文献传递 32个棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量:26 2012年 以我国2010年32个主栽品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从95对SSR引物中,挑选出多态性高、稳定性好、均匀分布在棉花26条染色体上的40对引物,共扩增出161种多态性基因型,平均每对引物扩增出4.025种。引物多态信息量(PIC)0.2989~0.7585,平均为0.5407。11对引物在13个品种上有特征带型,最少利用5对引物就可以将32份材料完全区分开。利用NTSYS-pc V2.10软件聚类分析表明:长江流域棉区品种间遗传差异最大,黄河流域棉区次之,新疆棉区最小;常规种遗传基础较杂交种窄。 张玉翠 杨伟华 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅关键词:棉花 SSR 指纹图谱 中国棉花主栽品种DNA指纹数据库初步构建研究 被引量:21 2012年 基于多重PCR(Polymerase chain reaction)与毛细管五色荧光检测系统,利用36对核心引物构建了138份棉花主栽品种DNA指纹数据库,采用棉花DNA指纹数据库软件管理系统进行数据统计与分析。36对引物在138份材料中共扩增出143个多态性等位位点,每对引物的等位位点数为2~8个,平均每对引物扩增出3.97个多态性等位位点。抽查的101个主栽品种仅45.6%的位点完全纯合,中棉所系列品种61.6%的位点完全纯合。存在5种非纯合位点表现形式,以2种基因型混杂所占比例最大,其中以5∶1的混杂类型最多。4种类型的同名品种指纹比对分析表明,品种内的遗传变异度均在0~2个差异位点。初步建立了高通量的棉花DNA指纹检测与数据分析平台,提出了不同品种间的差异判别标准。 匡猛 杨伟华 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 张玉翠 王飞 苏畅关键词:棉花 SSR 荧光检测