教育部“新世纪优秀人才支持计划”(NCET-08-0177)
- 作品数：5 被引量：19H指数：3
- 相关作者：李肯立周旭乐光学杨志邦郭里更多>>
- 相关机构：湖南大学嘉兴学院湖南城市学院更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金浙江省公益性技术应用研究计划项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 一种最大匹配问题DNA计算算法被引量：10
- 2011年
- DNA计算作为基于生化反应的一种新的计算模式,凭借其巨大的并行性和海量的存储能力已经成为解决NP难题的潜在解决方案之一.把传统计算机中的剪枝技术引入到DNA计算算法的设计中,提出一种基于Adleman模型生物操作与粘贴模型解空间的最大匹配问题DNA计算新算法.算法由图编排器、预解空间生成器、匹配生成器及最大匹配搜索器组成.与已有同类算法的对比分析表明:该算法在保持多项式操作时间的条件下,将求解最大匹配的解空间从O(2m)减少到O(1.618m),将DNA计算机在试管内可求解的最大匹配问题的规模从60(260≈1018)提高到86(1.61886≈1018).同时,与传统的穷举算法相比,该算法具有高效的空间利用率及容错技术的优点.
- 周旭李肯立乐光学杨志邦
- 关键词：DNA计算DNA计算机最大匹配问题剪枝技术NP完全问题
- 一种加群Z_p^+上离散对数问题的DNA计算算法
- 2012年
- 加群Zp+上离散对数问题在公钥密码系统分析中具有非常广泛的应用。研究一种加群Zp+上离散对数问题的DNA计算算法。算法主要由解空间生成器、并行乘法器、并行加法器、解转换器及解搜索器组成。其中解空间生成器借鉴传统计算机中3表算法的思想,将解空间的生成分为3个部分来完成,极大减少了非法解的搜索空间。本算法的生物操作时间复杂度为O(k2),需要O(1)个试管数、O(2k)条DNA链,最长DNA链长为O(k2)(其中k为加群上离散对数问题群阶p的二进制编码位数)。最后,通过DNA计算通用的试验方法对算法进行了仿真,验证了算法的可行性和有效性。
- 周旭李肯立乐光学朱开乐
- 关键词：DNA计算NP完全问题密码分析
- 一种准对角矩阵的混合压缩算法及其与向量相乘在GPU上的实现被引量：4
- 2014年
- 稀疏矩阵与向量乘(SpMV)属于科学计算和工程应用中的一种基本运算,其高性能实现与优化是计算科学的研究热点之一。在微分方程的求解过程中会产生大规模的稀疏矩阵,而且很大一部分是一种准对角矩阵。针对准对角矩阵存在的一些不规则性,提出一种混合对角存储(DIA)和行压缩存储(CSR)格式来进行SpMV计算,对于分割出来的对角线区域之外的离散非零元素采用CSR存储,这样能够克服DIA在不规则情况下存储矩阵的列迅速增加的缺陷,同时对角线采用DIA存储又能充分利用矩阵的对角特征,以减少CSR的行非零元素数目的不均衡现象,并可以通过调整存储对角线的带宽来适应准对角矩阵的不同的离散形式,以获得比DIA和CSR更高的压缩比,减小计算的数据规模。利用CUDA平台在GPU上进行了实验测试,结果表明该方法比DIA和CSR具有更高的加速比。
- 阳王东李肯立石林
- 关键词：图形处理芯片CUDA
- 异构系统中基于可用性的粒子群任务调度算法
- 2012年
- 任务调度技术是并行分布式系统中的关键技术之一,对系统的性能起着重要作用,但通常情况下大型系统的任务调度问题属于NP问题。而现代启发式生物进化算法是找出很多NP问题近似解的有效方法。本文将粒子群算法应用于基于可用性的网格系统调度中,提出了一种调度算法,对算法的性能进行了理论分析和模拟实验。结果表明:和最近文献中的基于可用性的调度算法SSAC相比,所提出的新算法在保证系统资源具有同样的可用性条件下,能够产生更好的调度长度。
- 李大普陈光喜李肯立
- 关键词：异构系统任务调度可用性粒子群算法
- 一种求解Ramsey数的DNA计算机算法被引量：5
- 2011年
- Ramsey理论是组合数学中一个庞大而又丰富的领域,在集合论、逻辑学、分析以及代数学上具有极重要的应用.Ramsey数的求解是非常困难的,迄今为止只求出9个Ramsey数的准确值.探讨了DNA生物分子超级计算在求解这一困难数学问题的可能性.将Adleman-Lipton模型生物操作与粘贴模型解空间相结合的DNA计算模型进行扩展,在许进等人提出来的位序列编码方法的基础上,提出一种用于求解Ramsey数的DNA计算模型与算法.从下界开始,直到上界,每次产生问题的解空间,然后根据Ramsey数的定义,删除满足特定条件的解,最后检测最终的试管以确定当前值是否为所要求的Ramsey数,最终得到具体的Ramsey数值.算法性能理论分析和模拟实验结果表明了本算法在求解Ramsey数的理论可能性.
- 李肯立郭里唐卓江勇李仁发
- 关键词：并行计算DNA计算生物计算DNA计算机算法RAMSEY数
