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结合主成分与独立成分分析识别胃癌相关差异表达基因的方法研究被引量：2: 2013年; 筛选潜在的差异表达基因能够帮助人们了解基因的功能及基因在疾病发生发展中的作用。由于主成分与独立成分分析的侧重点不同,因此,结合两种方法发展了一种识别胃癌相关差异表达基因新方法,以提高结果的准确度和可信度。从包含7129个基因和29个样本的胃癌基因表达谱数据中,新方法识别了16个与胃癌发生发展显著相关的差异表达基因,这些基因被认为值得进一步开展实验研究。研究结果对揭示胃癌发生与发展机制具有促进作用。; 陈战雷李博宇李益饶妮妮; 关键词：胃癌基因表达数据差异表达基因主成分分析

心电信号多形态T波检测方法研究被引量：4: 2013年; 目的研究一种T波检测新方法,以提高检测形态异常T波的准确率。方法基于小波变换和支持矢量机技术,设计了一种准确性高且适用于检测心电信号多形态T波的新方法,并从QT数据库下载了50组真实心电信号中5000个形态多样的T波数据验证新方法的性能。结果将实验结果与库中专家标注的信息对比,在误差容忍度20 ms内,检测准确率达到96.38%,敏感度达到98.04%,阳性预测率达到100%。与现有其他类似方法比较,新方法的平均检测精确度和敏感度分别高出6.73%和4.48%。结论本文方法对于各种形态的T波均具有高的检测准确率,且具有良好的抗噪性和可扩展性。; 王云鹤钱梦瑶刘定宇饶妮妮; 关键词：小波变换支持矢量机

基于最大信息系数的永久性房颤差异表达基因识别被引量：6: 2015年; 心房颤动是一种常见的、与年龄相关的心律失常,由其所导致的脑卒中具有高致残率和致死率。通过对高通量基因表达谱的分析,可以帮助理解心房颤动的生物学过程和功能紊乱机制,并发现相关致病基因。新型的非参数统计方法——最大信息系数,在探索双变量之间的关联方面具有独特的优点。利用该方法,发现差异与非差异基因表达值与样本表型之间的关联程度不同,构建差异表达基因识别方法。对永久性房颤基因表达谱GSE2240的分析,识别出41个差异表达基因,其中有14基因是已有工作未发现的新差异表达基因。信号通路和富集分析表明,这些差异表达基因与房颤高度相关。同时,对乳腺癌基因表达数据GSE24037的分析,进一步说明该方法在差异表达基因识别方面的有效性。最大信息系数的非参数特性与抗噪能力,使它非常适合于差异表达基因的识别。; 刘汉明饶妮妮李益罗恒荣杨阳杨锋; 关键词：心房颤动差异表达基因

Convergence analysis on Browder-Tikhonov regularization for second-order evolution hemivariational inequality: 2015年; This paper studies the Browder-Tikhonov regularization of a second-order evolution hemivariational inequality(SOEHVI) with non-coercive operators. With duality mapping, the regularized formulations and a derived first-order evolution hemivariational inequality(FOEHVI) for the problem considered are presented. By applying the Browder-Tikhonov regularization method to the derived FOEHVI, a sequence of regularized solutions to the regularized SOEHVI is constructed, and the strong convergence of the whole sequence of regularized solutions to a solution to the problem is proved.; Yibin XIAOGuoji TANGXianjun LONGNanjing HUANG; 关键词：正则化方法对偶映射正则解

蓝藻非编码RNA Yfr7的生物学特征分析: 2014年; Yfr家族是广泛存在于蓝藻基因组中的一类非编码RNA,在细胞代谢和环境适应方面发挥重要作用。文中选取Yfr7作为研究对象,首先根据序列特征确定Yfr7的二级结构,然后结合动态规划和自由能的计算方法预测Yfr7的调控基因,从细胞定位、分子功能和调控路径三方面对这些基因进行分析,以快速发现Yfr7的功能,最后通过构建进化树来揭示Yfr7的遗传特征。结果表明:Yfr7拥有独立的启动子区和操纵子,通过保守片段5'-GTGCTCTGATCTGACT-3'与目标mRNA序列互补来调控特定基因的表达;目标基因包括看家基因和酶基因,这些目标基因的功能说明Yfr7广泛参与细胞的次级代谢;进化树聚类表明Yfr7与菌株光照类型有关,参与蓝藻最重要的光合反应;Yfr7与6S RNA在序列、结构和遗传距离上都高度一致,推测可能来自同一个祖先。这些研究结果可为进一步开展相关实验研究提供理论基础。; 李益饶妮妮杨峰杨阳张莹; 关键词：蓝藻分子功能进化

房颤伴室性早博与房颤伴差异性传导的量化鉴别方法研究被引量：4: 2015年; 对于房颤伴室性早博与房颤伴差异性传导的临床诊断,目前还没有公认的标准,二者的准确鉴别一直是困扰医生的难题。本研究提出一种准确性高的计算方法,用于鉴别上述两类疾病。通过分析房颤伴室性早博与房颤伴差异性传导的临床特征,确定类代偿间期与联律间期的比值为鉴别特征参数。对待检测ECG信号作预处理,然后准确定位待检测ECG的每一个心动周期内QRS-T特征波;在此基础上,识别宽大畸形QRS波群,提取对应于类代偿间期与联律间期的两个相邻R-R间期,计算它们的比值,将其与一个给定的鉴别阈值进行比较后作出判别。算法验证数据来自MIT-BIH心律失常数据库,10个记录中,含4 026心拍房颤伴室性早搏和949心拍房颤伴差异性传导,共计4 975心拍。所提出方法在房颤伴室性早博与房颤伴差异性传导的混合数据中,鉴别房颤伴室性早搏的灵敏度和阳性预测率分别达到了93.15%和98.30%,优于传统方法。类代偿间期与联律间期的比值可以代替目前常用的类代偿间期,作为鉴别房颤伴室性早博与房颤伴差异性传导的特征参数,对提高诊断正确性具有指导作用。; 钱梦瑶饶妮妮刘定宇杨阳张莹万永利; 关键词：联律间期

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国家自然科学基金(81171411)