国家科技重大专项(2012ZX10004201-003)
- 作品数：4 被引量：25H指数：3
- 相关作者：许文波崔爱利祝双利檀晓娟李静更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心海南省疾病预防控制中心泰山医学院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- F基因型腮腺炎病毒全基因组基因特征分析被引量：12
- 2013年
- 为了解我国现流行的F基因型腮腺炎病毒全基因组的基因特征，本研究选择对腮腺炎病毒F基因型参考株Muvi／shand。ng．CHN／4．05IF]进行全基因组测序，结合其它来自于GenBank的腮腺炎病毒全基因组序列，共同分析我国流行的F基因型腮腺炎病毒的全基因组特征及其与现有疫苗株的遗传差异及抗原位点变异情况。通过研究发现，和腮腺炎病毒其它基因型相比，腮腺炎毒株MuVi／shandong．CHN／4．05Er]全基因组核苷酸差异在3．8％～6．5％之间，其中与A基因型（疫苗株）差异最大，与B和N基因型差异最小。腮腺炎毒株MuVi／Shan—dong．CHN／4．os[F]和疫苗株在全基因组序列上分别存在26个和25个N糖基化位点，和疫苗株相比，腮腺炎毒株MuVi／Shandong．CHN／4．05[x]在HN蛋白上第464~466氨基酸位点上增加了一个N一糖基化位点，而其它基因型的腮腺炎病毒在这个位点上也均为N_糖基化位点。另外，腮腺炎毒株MuVi／Shandong．CHN／4．os[E]和疫苗株在其它已知的抗原相关位点上也存在着氨基酸变异。我国现流行的腮腺炎流行株与腮腺炎病毒其它基因型及疫苗株之间在全基因组上已存在较大的差异，提示需进一步加强对国内现有腮腺炎流行株与疫苗株之间的遗传变异分析，系统评价当前疫苗的免疫保护效果。
- 崔爱利金俐许文波
- 关键词：腮腺炎病毒全基因组基因特征
- 2010年海南省手足口病流行病学和病原学特征分析被引量：8
- 2013年
- 为了探究2010年海南省手足口病(Hand-foot-and-mouth disease,HFMD)的流行病学及病原学特征,本研究对2010年海南省HFMD病例报告信息进行整理分析,并对2010年海南省18县市1346份HFMD病例临床标本进行肠道病毒(enterovirus,EV)实验室检测。核酸检测阳性标本进行EV分离和鉴定,对分离到的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)的VP1编码区全长基因进行扩增及序列测定,用Sequencher 5.0和MEGA 5.0等生物信息学软件基于VP1编码区进行EV71的分子流行病学分析。流行病学分析表明:全省18个县市均有病例报告,尤其以东北部县市高发,同时以4岁以下的婴儿为高发人群;而与全国大多省份流行规律不同的是其发病高峰期为9和10月份。实验室结果显示:EV71和CA16是引起2010年海南省HFMD流行的主要病原,但EV71感染在重症病例和死亡病例中占绝对优势。除此之外,还存在部分由其它EV感染引起的HFMD病例。分子流行病学分析提示:2010年海南省流行的EV71均属于C4a亚型,该亚型为我国近年来流行的优势基因型,同时进化分析提示至少存在3条传播链。本研究数据对阐明海南HFMD的流行传播规律,以进一步指导HFMD防控具有重要理论价值。
- 郑鹏曾祥洁檀晓娟李静马焱陈海云崔爱利祝双利高允生许文波
- 关键词：手足口病肠道病毒71型流行病学病原学
- 构建一种新型腮腺炎病毒核酸检测阳性对照品被引量：2
- 2013年
- 为快速鉴定腮腺炎病毒核酸检测中由阳性对照引起的交叉污染问题,本研究建立了一种新型腮腺炎病毒核酸检测阳性对照。该阳性对照为合成的RNA转录产物,在使用相同的引物和反应条件下,该阳性对照在RT-PCR和巢式PCR试验中产生的PCR产物和正常腮腺炎病毒核酸阳性标本的PCR产物片段长度不同,通过比较PCR产物的大小可快速鉴定由阳性对照引起实验室交叉污染。这种新型腮腺炎病毒RNA阳性对照可广泛应用于腮腺炎病毒实验室诊断和基因定型中,对腮腺炎病毒核酸检测可进行良好的实验室质量控制。
- 崔爱利金俐许文波
- 关键词：腮腺炎病毒
- 宁夏2010年柯萨奇病毒A组16型VP1基因特征分析被引量：3
- 2014年
- 目的 分析2010年宁夏回族自治区流行的柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A16,CA16）VP1基因特征.方法 用特异引物通过逆转录聚合酶链反应（reverse transcriptase polymerase chain reaction,RT-PCR）,对2010年分离自宁夏手足口病（hand,foot,and mouth disease,HFMD）病例的CA16毒株,进行VP1编码基因的扩增.扩增阳性产物进行序列测定,采用生物信息学软件进行分析.结果 本研究共获得62株CA16的VP1编码序列,其核苷酸和氨基酸序列同源性分别为90.1％ ～100％（平均94.5％）和98.7％ ～100％（平均99.6％）.在亲缘性关系树上与B1基因亚型毒株位于相同分支,且各个地市流行株又同时存在B1a和B1b分支.结论 与全国流行情况相一致,宁夏2010年存在B1a和B1b分支CA16的共循环,毒株间具有较大的核苷酸序列差异,提示流行中存在多个传播链.
- 檀晓娟马江涛陈慧祝双利詹军许文波
- 关键词：柯萨奇病毒感染手足口病
