福建省重大科技项目(2002N009) 作品数:5 被引量:140 H指数:4 相关作者: 苏永全 王军 丁少雄 覃映雪 郭丰 更多>> 相关机构: 厦门大学 集美大学 福建省水产研究所 更多>> 发文基金: 福建省重大科技项目 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
哈维氏弧菌FlaA基因的克隆、序列分析及真核表达质粒的构建 被引量:3 2007年 哈维氏弧菌是水产病害中常见的致病菌.参照基因库上登录的弧菌鞭毛丝蛋白FlaA基因序列设计简并引物,PCR扩增哈维氏弧菌TS-628株的FlaA全基因,并克隆到pMD 18-T载体中测序,经序列分析该基因全长1 140 bp,编码379个氨基酸.与基因库中其他弧菌的同源基因序列比较显示,哈氏弧菌FlaA基因与霍乱弧菌FlaA基因的同源性最高(79.5%),该基因编码的多肽缺乏半胱氨酸,并在N-,C-两端的氨基酸序列较为保守,中间区域的变异较大.对该蛋白的氨基酸组成及空间结构进行了分析和预测,并推测该蛋白质的平均分子量为40.6 kDa.在该基因末端加上一段编码Flag短肽的核苷酸序列后克隆到真核表达载体pcDNA3.1(+),获得带哈氏弧菌鞭毛丝蛋白FlaA基因的真核表达重组质粒pcDNA-FlaA-tag,为其DNA疫苗的进一步研究奠定了基础. 庄轩 覃映雪 苏永全 王军 丁少雄关键词:哈维氏弧菌 基因克隆 真核表达重组质粒 基于细胞色素b基因片段序列研究中国近海石斑鱼类系统进化关系 被引量:29 2006年 石斑鱼的分类一直是鱼类系统分类学中的一个难题.为探讨中国近海石斑鱼类系统进化关系,通过PCR扩增获得了石斑鱼亚科(Epinephelinae)6属28个种类的线粒体细胞色素b基因片段序列.采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2-parameter遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,并结合GenBank上石斑鱼属的同源序列,以东洋鲈(Niphonspinosus)、真鲷(Pagrusmajor)等为外群构建NJ,MP,ML和ME系统树.从分子系统学的角度并结合形态学特征得出了如下结果:(i)鳃棘鲈属(Plectropomus)最先分化,是石斑鱼亚科中原始的类群;(ii)侧牙鲈属(Variola)与九棘鲈属(Cephalopholis)具有较近的亲缘关系;(iii)九棘鲈属是一个单系群,并且较石斑鱼属(Epinephelus)原始;(iv)宽额鲈(Promicropslanceolatus)和驼背鲈(Cromileptesaltivelis)可以归入石斑鱼属;(v)石斑鱼属内部存在两个平行进化的姐妹分支. 庄轩 丁少雄 郭丰 王军 苏永全 张其永 李祺福关键词:石斑鱼亚科 分子系统学 细胞色素B基因 网箱养殖青石斑鱼的溃疡病病原 被引量:78 2004年 2002年夏季厦门同安湾一带气候炎热,降雨量少,海水盐度偏高,同安湾刘五店的网箱养殖石斑鱼大面积暴发溃疡病。本研究调查了石斑鱼溃疡病暴发的特征和症状,主要表现为肌肉溃疡坏死、眼球脱落、鱼骨暴露等。从病鱼体表及内脏分离出优势菌群命名为TS 628,经回归感染证实TS 628就是引发本次石斑鱼溃疡病的病原菌。对病原菌进行鉴定发现,该菌革兰氏染色呈阴性,电镜下观察菌体呈短杆状,极端单鞭毛,综合研究该菌在形态、生理生化、16SrDNA同源性及药物敏感性等方面的特性,基本确认分离到的病原菌为哈维氏弧菌(Vibrioharveyi),该菌对氯霉素、壮观霉素等多种抗生素敏感,对万古霉素、青霉素G等抗生素不敏感。哈维氏弧菌是水产养殖病害常见病原菌,但作为养殖石斑鱼的病原菌在国内属首次报道。 覃映雪 池信才 苏永全 王德祥 陈信忠关键词:哈维氏弧菌 青石斑鱼 溃疡病 病原 斜带石斑鱼仔稚鱼生长和摄食的研究 被引量:27 2007年 于2003-2004年对人工培育的斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)仔鱼、稚鱼和幼鱼的生长和摄食进行了研究.在水温28.5~31.0℃,盐度31.4~34.3条件下.初孵仔鱼经39d培育变态为幼鱼.全长(L/mm)与日龄(D/d)的关系式为L=2.039 8e^0.076 7D;体质量(M/mg)与日龄(D/d)的关系式为M=0.065 8e^0.252 8D;全长(L/mm)和体质量(M/mg)的关系式为M=0.0065L^3.2573.对170尾仔、稚、幼鱼的解剖观察结果表明.摄食率达95.88%,饱食率达77.65%.饱食量(F/mg)与体质量(M/mg)呈直线相关,F=0.0433M—0.0039,大多数仔稚鱼在30min内可以饱食.仔鱼对轮虫的消化时间为1~2h,稚鱼对卤虫无节幼体和桡足类的消化时间分别为1.5~3h和2~4h.斜带石斑鱼仔稚鱼的摄食强度具有明显的昼夜节律性,仔鱼白天摄食、晚上不摄食,前期仔鱼在8:00和18:00摄食量较大,后期仔鱼在8:00和16:00摄食量较大,稚鱼昼夜均摄食,摄食高峰期出现在中午12:00. 谢仰杰 翁朝红 苏永全 王军关键词:斜带石斑鱼 仔鱼 稚鱼 摄食 中国东南近海斜带石斑鱼群体的地理分化和遗传结构研究 被引量:4 2008年 以来自3个地区55尾斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)为研究对象,通过测定和分析长度为492bp 的线粒体细胞色素 b 的部分基因序列,确定了10种单倍型和8个多态位点。结果表明各地理群体多态性均较低,并且单倍型在群体间分布不均,台湾群体多态性最高,海南群体次之,广东群体最低。各群体内 Tajima's D 测验结果不显著(P>0.10),符合中性突变,即群体大小维持稳定并未出现扩张和持续增长。各群体间均呈现显著的遗传分化和较低基因流水平。单倍型网络关系图也表明地区间的地理分化和单起源多分支的格局,分析形成原因可能是偶然事件中个体的长距离迁移和群体的瓶颈效应。 王登玉 丁少雄 郭丰 王军 苏永全 方琼珊 王涵生关键词:斜带石斑鱼 线粒体 细胞色素B 群体遗传结构 地理分化