国家自然科学基金(31070015)
- 作品数：15 被引量：54H指数：5
- 相关作者：庄文颖赵鹏曾昭清罗晶刘超洋更多>>
- 相关机构：中国科学院中国科学院研究生院西南科技大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程湖北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学理学农业科学更多>>
- ITS作为粒毛盘菌属DNA条形码的探索(英文)被引量：6
- 2011年
- 以种内与种间差异以及PCR扩增和测序成功率为评价DNA条形码的重要指标,探索ITS序列作为粒毛盘菌属DNA条形码的可行性。结果表明,ITS成功区分了研究涉及的22个种,其PCR扩增和测序成功率为100%,该片段有望成为该属区分物种的DNA条形码。
- 赵鹏庄文颖
- COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试被引量：4
- 2012年
- 以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。
- 赵鹏罗晶庄文颖
- 基于曲霉属同源性分析的烟曲霉分子标记筛选
- 烟曲霉(Aspergillus fumigatus)是自然界广泛存在的腐生真菌,也是重要的机会致病菌。随着免疫受损人群的增多,在曲霉所引起的系统性感染曲霉病(aspergillosis)中,90％是由烟曲霉引起的,同时烟...
- 程云方余知和
- 关键词：比较基因组同源性
- 核糖体RNA二级结构对拓扑结构准确性的影响(英文)
- 2011年
- 探讨了核糖体小亚基二级结构对真菌系统发育分析的影响。对用不同方法构建的系统发育树进行比较,结果表明结合二级结构信息的分析方法较传统方法产生了更为合理的拓扑结构。二级结构信息除用于优化序列比对外,还需整合到核酸替代模型中;恰当的序列比对方法、进化模型和建树运算法则有助于更加准确地揭示类群之间的亲缘关系。
- 刘超洋庄文颖
- 关键词：系统发育拓扑结构
- 浅谈中国真菌研究被引量：3
- 2011年
- 真菌是真核生物中一个独立的界,它们种类繁多,生活习性多样,与人类息息相关。我国真菌资源丰富,利用真菌的历史悠久。从习性、分类及物种多样性、系统进化、DNA条形码探索、对现代生物学发展的促进作用、价值与利用等方面对我国已开展的研究进行了概述。继续发现新物种,发掘并有效利用我国丰富的真菌资源,保护资源,进而实现资源的可持续利用,任重道远。
- 庄文颖
- 关键词：真菌自然资源习性可持续利用
- 杆孢赤壳属一新组合(英文)被引量：1
- 2013年
- 长期以来,杆孢赤壳属被视为丛赤壳属的异名,最近才恢复其属级分类地位。臧氏丛赤壳在形态特征上与杆孢赤壳属的模式种Allantonectria miltina很相似,在子囊壳解剖结构、近圆柱形至柱棒状子囊、腊肠形子囊孢子等方面均表现出共性。二者间形态相似性得到了6个基因序列分析的支持,因而将臧氏丛赤壳转入杆孢赤壳属,建立新组合臧氏杆孢赤壳。
- 曾昭清庄文颖
- 中国盾盘菌属分类研究(英文)
- 2013年
- 对我国盾盘菌属馆藏标本和近年来采集的材料进行分类学研究表明,中国已知该属31种。描述了3个新种,命名为柯氏盾盘菌、长孢盾盘菌和假小孢盾盘菌,对新种与其相近种的区别进行了讨论;根据前人的形态描述,对S. erinaceus,S.olivascens和S. lusatiae在中国的分布提出了质疑;根据对相关馆藏标本的观察,指出S. barlae、S. superba和S. vitreola在我国的报道系基于错误鉴定,它们应从中国物种名录中排除。文中提供了该属中国已知种的分种检索表。
- 庄文颖
- 关键词：形态学
- 从真菌全基因组中筛选丛赤壳科的DNA条形码被引量：6
- 2012年
- 将粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)的注释基因分别与30种丝状子囊菌基因组比较,根据E值大小预测同源序列,从中选择Hsp90,AAC,CDC48和EF3作为候选基因,以丛赤壳科(Nectriaceae)13个属34个概念清晰的种为材料,对215个序列片段采用不同方法进行分析,筛选适合于该科的DNA条形码.将种内与种间序列差异以及序列获得的难易程度作为评价指标.结果表明,Hsp90和AAC基因虽然具有较高的PCR扩增与测序成功率,但种内、种间距离频率分布存在重叠,可能导致部分种的鉴定错误;CDC48基因可以恰当地区分种内与种间差异,但扩增与测序成功率相对较低;EF3基因不存在种内、种间遗传距离重叠,序列容易获得,适合作为该科真菌的DNA条形码.
- 曾昭清赵鹏罗晶庄文颖余知和
- DNA分子标记技术在真菌系统学研究中的应用及影响被引量：12
- 2013年
- DNA分子标记技术为真菌系统进化研究提供了许多新的方法,真菌分子系统学已成为一门成熟的学科。简述了真菌分子系统学的发展简史和代表性的研究方法以及对真菌系统学的主要贡献,包括将广义的真菌划分为3个类群,粘菌和卵菌不再属于真菌界成员。真菌生命之树项目的研究结果对真菌界高阶分类系统作出重大调整,将先前的4个门(壶菌门、接合菌门、子囊菌门和担子菌门)变为7个门(微孢子虫门、壶菌门、新丽鞭毛菌门、芽枝霉门、球囊菌门、子囊菌门和担子菌门)和4个亚门,并对真菌各类群概念作出修订。此外,DNA分子标记技术对真菌种概念的认识、有性型-无性型关联及分子生态学等研究领域产生了重要影响。
- 余知和曾昭清
- 关键词：分子技术
- 子囊具四个孢子的皱赤壳属一新种(英文)被引量：1
- 2012年
- 描述了分布于中国热带、亚热带地区的丛赤壳科皱赤壳属Rugonectria一新种。对中国材料进行形态学和DNA序列分析相结合的研究表明,它们与日本报道的栗生皱赤壳R.castaneicola较为接近,但存在形态学和DNA序列上的明显差异,代表该属一个新种。
- 曾昭清庄文颖Ho Wellcome H.
