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乙型肝炎病毒耐药突变对病毒表面抗原编码区的影响被引量：7: 2013年; 目的在接受核苷(酸)类似物治疗的慢性乙型肝炎患者中,分析乙肝病毒(HBV)耐药突变对乙肝病毒表面抗原的影响,为深入研究这些突变的生物学意义奠定基础。方法采集用核苷(酸)类似物进行抗病毒治疗的653例慢性乙型肝炎患者的血浆标本,提取HBV基因组DNA,对涉及耐药突变位点并且和表面抗原基因在基因组结构中完全重叠的逆转录酶结构域进行PCR扩增和DNA测序,根据NCBI中的乙型肝炎病毒参考序列分析这些耐药突变位点对表面抗原氨基酸突变的影响。结果 653例标本中,逆转录酶结构域rtV173L、rtA181T、rtA181V、rtT184G、rtS202I、rtM204V和rtM204I的突变分别可以导致表面抗原氨基酸位点改变:E164D、172W突变为终止密码子、L173F、L176V、V194F、I195M和W196L以及W196L/S的突变,rtL180M和rtS202G未造成表面抗原的改变。结论乙型肝炎病毒耐药突变可导致表面抗原多个氨基酸位点的改变。; 俞杨邬兰焦杰颜宁杜同信王自正; 关键词：核苷类似物表面抗原基因突变

乙型肝炎病毒基因组中罕见大片段缺失突变的分析: 2013年; 目的对来源于一例慢性乙型肝炎患者的包含罕见大片段缺失的乙肝病毒(HBV)全基因组进行序列分析。方法提取乙肝病毒基因组DNA,扩增全长基因组,通过单克隆化分析不同准种中大片段缺失的位点和长度;将包含两段缺失突变的片段分别进行扩增,通过扩增产物的序列分析验证准种分析的结果。结果该标本的HBV基因组中的确存在超过1.4kb的大片段缺失突变,其中P基因上存在nt2449～489的1256 bp的缺失突变,C基因上存在大约nt2088～2298的209 bp的缺失突变。结论该患者HBV基因组中存在罕见大片段缺失突变。; 俞杨邬兰焦杰杜同信王自正颜宁; 关键词：乙型肝炎病毒缺失突变慢性乙型肝炎

5′端非翻译区和NS5B区在丙型肝炎病毒基因分型中意义的再评价被引量：1: 2013年; 目的研究丙型肝炎病毒(HCV)的5′端非翻译区(5′-UTR)和NS5B区对中国人群感染的HCV基因分型的确切意义。方法选择NCBI核苷酸数据库中来源于中国人的HCV全基因组,利用NCBI基因分型工具,对同一条HCV序列中5′-UTR区、NS5B区和全长基因组进行基因分型,确定5′-UTR区和NS5B区在HCV基因分型中的全基因组代表性。在此基础上,选择NS5B区对125例临床HCV-RNA大于1.0E3的标本进行了基因分型。结果与全长基因组的分型结果相比,5′-UTR区基因分型在基因型判断上存在差异,仅有45%的符合率,特别是其无法精确判断基因亚型;而NS5B区基因分型结果与全长基因组的分型结果无论在基因型还是在基因亚型的判断上都具有良好的一致性,符合率可达95%;利用NS5B区对临床125例标本成功进行了基因分型,结果显示以1b和2a两种亚型为主。结论 NS5B区在HCV基因分型中具有良好的全基因组序列的代表性,能够有效用于临床常规的HCV基因分型检测。; 俞杨邬兰焦杰杜同信王自正; 关键词：基因分型 NS5B

人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点单核苷酸多态性检测方法的建立: 2013年; 目的建立使用单碱基延伸技术检测人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点单核苷酸多态性的方法。方法制备人全血基因组DNA样本,使用自行设计的引物扩增包含人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点的片段并纯化,通过单碱基延伸反应制备CISH+1320的样本,采用毛细管电泳检测CISH+1320的单核苷酸多态性,并使用DNA测序方法验证单碱基延伸方法的准确性。结果 7例样本的单碱基延伸法检测结果与DNA测序结果完全符合。结论单碱基延伸法可以用于人CISH基因结核杆菌易感相关+1320位点单核苷酸多态性的检测,结果准确可靠。; 焦杰谢玉为邬兰杜同信王自正俞杨; 关键词：结核分枝杆菌

1例卵巢畸胎瘤致血清CA19-9升高的报告被引量：1: 2012年; CA19—9是1种糖脂，在健康成人含黏蛋白的体液中含量极高，常以血液为检测标本且是胰腺癌、胆囊癌及胆管癌的首选肿瘤标志物。现发现1例卵巢畸胎瘤患者，诊治前其血清CA19—9长期维持在较高水平，实施剥除术后下降到正常水平，报道如下。; 张知李远香朱春梅吴荣艳吴芳; 关键词：卵巢畸胎瘤肿瘤标志物健康成人检测标本黏蛋白胆管癌

1例未经恩替卡韦治疗的慢性乙肝患者出现恩替卡韦基因型耐药的分析被引量：1: 2012年; 核苷（酸）类药物是慢性乙肝患者抗病毒治疗的重要药物,其临床使用的主要缺点是乙肝病毒会在其选择压力下产生耐药突变株,从而导致治疗失败[1]。拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦是临床慢性乙肝患者抗病毒治疗的常用核苷（酸）类药物,和拉米夫定与阿德福韦酯相比,使用恩替卡韦进行初始治疗所发生的5年耐药率很低[2-3],而未经恩替卡韦治疗的患者发生恩替卡韦基因型耐药的情况则罕有报道。现发现1例,; 俞杨杜同信王自正邬兰焦杰; 关键词：慢性乙肝患者耐药突变株恩替卡韦阿德福韦酯

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南京市医学科技发展项目(NJH201132)