中国博士后科学基金(20080430853)
- 作品数：3 被引量：13H指数：3
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- 长江白甲鱼ITS2序列结构和群体遗传多样性被引量：5
- 2012年
- 对长江白甲鱼(Onychostoma sima)样本核DNA进行PCR扩增,获得白甲鱼核DNA上编码核糖体5.8SrRNA和28SrRNA基因的部分序列和完整的ITS2序列(876bp)。运用DNA分析软件对白甲鱼2个驯养群体(重庆水产研究所长寿湖珍稀鱼类繁育中心及涪陵鱼种场)进行了遗传多样性分析。结果表明:该序列平均T、C、A和G碱基组成为22%、32.5%、29.6%和15.8%,颠换Tv=40,转换Ts=10,转换和颠换比值为R=Ts/Tv=0.25。40个体都是单倍型,单倍型多样度为H=1.000,平均核苷酸差异系数K=5.978,核苷酸多样性Pi=0.0682。中性检验及聚类分析表明,两个群体没有分化成单一的群体,两个驯养群体遗传多样性高,种质质量良好。
- 马跃岗朱杰袁万安
- 关键词：珍稀鱼类白甲鱼资源保护
- 核糖体转录间隔子2应用于鱼类种属的鉴别被引量：7
- 2010年
- 为了防止珍稀鱼类的非法捕捞和销售,鱼类种属的鉴别就成为非常关键的问题,特别是形态学方法无法区分的样品(如鱼苗、鱼鳞、鱼卵、鱼肉及其加工产品等)。为了帮助珍稀鱼类资源的管理和保护,文章报道了一种利用核糖体基因的转录间隔子2鉴别鱼类种属的分子遗传学方法:(1)利用同一目鱼类5.8SrRNA和28SrRNA基因的保守性,设计出扩增鲤形目鱼类这两个基因间转录间隔子2DNA片段,测序获得它们的碱基排列顺序;(2)再根据不同鱼类转录间隔子2序列的差异,设计出每种鱼的种属特异引物、种属鉴别标准物,构建鱼类分子分类图谱,利用PCR复合扩增技术鉴别鱼类种属。通过对国内不同地方采集的5种鲤形目鱼类的210个单一品种样本和40个混合样本的鉴别检验,该方法能够准确、灵敏和快速鉴别这5种鱼,可用于鱼类资源保护和评估、管理和开发,特别是在渔业管理人员渔业执法、海关打击珍稀鱼类走私、防止商业欺诈和外来有害生物入侵等方面非常有用。
- 袁万安
- 关键词：鱼类种属鉴定资源保护
- 通过核基因ITS2片段研究四种鲇形目鱼类进化被引量：5
- 2008年
- 采用鲇形目鱼鱼类通用引物扩增了鲇形目鱼类4种鱼,长吻(Leiocassi longirostris)、南方南方大口鲇(Si-lurus meridionalis)、黄颡鱼(Pseudobagrus fulvidraco)、斑点叉尾(Ictalurus punctatus)核DNA的ITS2片段,并构建UPMGA,NJ,ME和MP系统树。结果显示:根据遗传距离,斑点叉尾和黄颡鱼的亲缘关系最近(D=0.0661),接下来是黄颡鱼和南方大口鲇(D=0.1100),南方大口鲇和长吻(D=0.1184),斑点叉尾和南方大口鲇(D=0.1266),黄颡鱼和长吻(D=0.1490),斑点叉尾和长吻的亲缘关系是最远的(D=0.1503)。结果表明:长吻最早分化,其次是南方南方大口鲇和黄颡鱼,而斑点叉尾分化最晚。
- 袁万安
- 关键词：鲇形目分子系统进化ITS2系统进化树
