福建省自然科学基金(B0740012)
- 作品数:2 被引量:7H指数:1
- 相关作者:马英钱鲁闽王永胜郝剑冬汪琳更多>>
- 相关机构:集美大学国家海洋局第三海洋研究所更多>>
- 发文基金:福建省自然科学基金国家公益性行业科研专项福建省科技厅资助项目更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 九孔鲍鲍苗脱板期养殖环境细菌分离及分子鉴定被引量:1
- 2009年
- 为了解九孔鲍鲍鱼脱板期养殖环境中细菌的多样性,分离培养了脱板病发生期养殖环境(包括附着基上和养殖池水中)细菌32株,并用限制性片段长度多态性分析和16S rDNA序列分析法对其进行了分子鉴定,构建了系统进化树.结果表明,所分离的细菌分为3大类群9个属,分别是:γ-变形菌纲(γ-Proterbacteria)的交替假单胞菌属(Pseudoalteromonas)、Cobetia属、盐单胞菌属(Hlomonas)、弧菌属(Vibrio)和海单胞菌属(Marinomonas);厚壁菌门(Firmicutes)的盐水球菌属(Salinicoccus)、动球菌属(Planococcus)和芽孢杆菌属(Bacillus);还有拟杆菌门(Bacteroidetes)的Te-nacibaculum属.这些细菌大多与GenBank库中分离自发病的水产养殖生物的细菌最相似.这说明从该养殖环境中分离培养出的细菌和水产养殖病害间存在着一定的关系.
- 汪琳杨秋明郝剑冬宋振荣马英
- 关键词:九孔鲍限制性片段长度多态性分子鉴定
- 对虾养殖池沉积物细菌的遗传多样性被引量:6
- 2009年
- 为了解对虾养殖池沉积物中细菌的遗传多样性,采用细菌通用引物构建了细菌16S rRNA基因克隆文库,并从文库中随机挑选克隆子测序,得到37条有效序列,进行序列同源性分析和系统进化分析.结果表明:对虾养殖池底泥中细菌的遗传多样性非常丰富.主要分为六大类群:其中γ-变形菌纲细菌占据优势地位,约占所分析克隆子数的41% 其次是α-变形菌纲和δ-变形菌纲细菌,分别占19% 还有少量的酸杆菌纲、放线菌门和厚壁菌门细菌,分别占所分析克隆子数的3%-8%.所得克隆子序列大都与GenBank库中来自土壤环境中的未培养克隆子序列相似,并且大部分序列的相似性值小于95%,说明对虾养殖池中的细菌大都是未培养的未知细菌,特异地存在于土壤环境中.
- 马英钱鲁闽王永胜
- 关键词:细菌16SRRNA基因