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平菇DNA不同提取方法比较被引量：6: 2014年; 以野外采集的平菇为样本,经菌丝培养后,用FDEB法、FDEB-CTAB法、改良CTAB法和改良SDS法提取DNA,并进行琼脂糖凝胶电泳检测、紫外分光光度计分析和标准差及标准误分析,结果表明:FDEB法提取的平菇DNA产率最高,但存在较严重RNA的污染,标准差和标准误比较大,稳定性差;改良CTAB法综合效果不错,提取稳定性高;改良SDS法提取的平菇DNA的纯度最好,标准差和标准误最低,提取效果稳定性最好,但产量相对较低;FDEB-CTAB法提取平菇DNA,去多糖的效果很好,标准差和标准误适中,但产量较低。综合以上结果,改良CTAB法提取蘑菇DNA综合效果最好。; 陈国明魏海莲李志强杨丛志何德李翠新; 关键词：平菇菌丝体 DNA提取改良CTAB法

平菇ISSR遗传多样性分析被引量：6: 2014年; 以53个平菇菌种为试材，采用ISSR标记技术，对采自多地的平菇材料进行遗传多样性检测，以期为平菇优良品种选育和亲缘关系的研究提供分子生物学依据。结果表明：从27个ISSR引物中共筛选出14个多态性明显的引物；在53份供试材料中共扩增出189条谱带，其中多态性条带189条，多态性为100％；材料间遗传相似系数范围在0．44～0．99，聚类分析结果显示，在0．62水平上53株菌株分为8组，多数菌株之间遗传相似性较低。这表明供试菌株在DNA水平上存在比较显著的遗传变异和丰富的遗传多样性；同时发现供试材料间的聚类与地域无明显相关性。; 刘志曦李志强魏海莲赵中雷何德李翠新; 关键词：平菇 ISSR

基于COX Ⅲ基因的侧耳属真菌遗传多样性分析: 2015年; 侧耳属真菌是具有重要经济价值的食药用真菌,对该属真菌的准确鉴定对菌种的分离纯化和提高菌株生产潜力有重要意义。其种类繁多,种群复杂,形态差异大,且常会受到环境的影响,分类鉴定不易,常会引起争议。首次将COXⅢ基因用于真菌的遗传多样性分析,侧耳属菌种经PCR扩增和测序后得到13种侧耳属真菌的COXⅢ部分序列,并使用粒子群算法得到DNA序列的二维聚类图,用PHYLIP软件构建其系统演化树,探讨侧耳属真菌的系统亲缘关系。结果表明:金顶侧耳、桃红侧耳和鲍鱼菇彼此之间以及与其他侧耳属菌种的亲缘关系较远;阿魏蘑和白阿魏蘑之间的关系十分密切;糙皮侧耳、阿魏蘑、杏鲍菇关系较近。结合其他学者的研究和形态学证据,说明COXⅢ基因可以很好地对侧耳属进行遗传多样性分析。; 李翠新刘志曦何德; 关键词：侧耳属细胞色素氧化酶 PCR 系统进化树

西南三地区野生香菇ISSR遗传多样性分析被引量：4: 2014年; 采用ISSR分子标记技术对云南省大姚县、瑞丽市和四川省木里县的41株野生香菇(Lentinula edodes)菌株进行DNA聚类分析,利用NTSYS软件对其遗传多样性进行聚类分析。结果表明,利用18个引物对41个野生香菇菌株的DNA进行ISSR-PCR扩增,共扩增出162条清晰的DNA片段。聚类分析结果表明,相似水平在62%左右时,41株野生香菇菌株分为3个类群,各地香菇资源存在较丰富的遗传多样性且与地域无明显相关性。; 张婉洁何德李翠新李季; 关键词：ISSR

云南昭通野生紫丁香蘑群体的遗传多样性分析被引量：3: 2015年; 以采自云南昭通的66株野生紫丁香蘑（Lepista nuda,L.nuda）为研究对象,分析了其ITS序列及其单核苷酸多态性（SNP）。结果表明：经结合形态和分子水平的鉴定,确定所采的野生蘑菇为紫丁香蘑;66个紫丁香蘑的ITS序列长度变化范围为666~671bp,ITS1为241~244bp,5.8S为155bp,ITS2为267~275bp,G＋C含量的变化范围为41.5%~42.4%,所有样本的平均遗传距离为0.003 0;通过序列比对,共筛选出7个SNP位点,单突变位点3个,简约信息位点4个;转换与颠换的比值R为0.672;该群体的核酸多态性指数Pi为0.002 91,每位点核苷酸多态性指数Theta（per site from Eta）为0.002 36。采用邻接法（neighbour joining,NJ）构建的系统发育树分支支持率低,表明群体内各菌株遗传距离小,该群体的遗传多样性丰度较低。综上说明云南昭通野生紫丁香蘑群体的遗传多样性水平很低,需要加强保护。; 魏海莲刘志曦张婉洁何德李翠新马建; 关键词：ITS SNP

昆明野生鲍鱼菇的ITS分子鉴定被引量：5: 2014年; 鲍鱼菇口感特殊,味道鲜美,营养价值高,但产量稀少。传统的形态特征进行的分类鉴定常常带有一定的局限性和主观性,采集的野生鲍鱼菇的真实性需要进一步鉴定。文章采用一对通用引物ITS1和ITS4对野生鲍鱼菇子实体样本及其组织分离菌株的rDNA ITS片段进行PCR扩增,并克隆测序。通过GenBank数据库搜索和系统发育树构建来进行分子鉴定。结合形态特点的分析,结果显示采集的野生菇样本就是鲍鱼菇。ITS序列在鲍鱼菇不同菌株的鉴定上具有重要的价值。; 李翠新张婉洁王兵何德; 关键词：克隆测序 ITS序列

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西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室开放基金(KL200707)