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天津市应用基础与前沿技术研究计划(10JCYBJC09300)

作品数：10 被引量：80H指数：6
相关作者：张桂华朱珠兰青阔赵新王永更多>>
相关机构：天津科润农业科技股份有限公司天津市农业科学院天津市种子管理站更多>>
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文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 9篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 7篇种子
  • 4篇种子纯度
  • 4篇黄瓜
  • 4篇EST-SS...
  • 4篇纯度鉴定
  • 3篇白菜
  • 3篇SNP标记
  • 3篇EST-SS...
  • 3篇大白菜
  • 2篇种子纯度鉴定
  • 2篇SNP
  • 2篇INDEL标...
  • 2篇纯度
  • 1篇椰菜
  • 1篇杂交
  • 1篇杂交种
  • 1篇杂交种纯度
  • 1篇正交
  • 1篇正交设计
  • 1篇指纹

机构

  • 5篇天津科润农业...
  • 4篇天津市农业科...
  • 2篇天津市种子管...
  • 1篇天津科润蔬菜...

作者

  • 5篇张桂华
  • 4篇程奕
  • 4篇王永
  • 4篇赵新
  • 4篇兰青阔
  • 4篇朱珠
  • 3篇郭永泽
  • 2篇贺长征
  • 1篇李梅
  • 1篇崔兴华
  • 1篇杜胜利
  • 1篇齐志伟
  • 1篇孙玉河
  • 1篇王超楠
  • 1篇刘莉莉
  • 1篇陈锐
  • 1篇余景会
  • 1篇李欧静

传媒

  • 3篇种子
  • 2篇中国蔬菜
  • 2篇天津农业科学
  • 1篇生物技术通报
  • 1篇湖南农业科学
  • 1篇分子植物育种

年份

  • 1篇2014
  • 3篇2013
  • 4篇2012
  • 2篇2011
共 10 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基于SNP标记的黄瓜杂交种纯度鉴定方法被引量：25
2012年
根据国际葫芦科基因组数据库CuGenDB中序列信息,应用高分辨率熔解曲线技术筛选出用于黄瓜杂交种纯度鉴定的SNP位点CLA6(A/G),该位点在33个市售黄瓜品种中的多态信息量为0.401,处于中度多态;结合焦磷酸测序技术,建立基于CLA6位点的SNP-Pyrosequencing黄瓜杂交种纯度鉴定方法。利用该鉴定方法检测黄瓜杂交种优一90粒种子,结果其种子纯度为96.7%,该结果与CLA0位点及SSR鉴定结果相符,表明该鉴定技术适于黄瓜杂交种纯度鉴定,具有用于DUS测试分析的潜力。
兰青阔张桂华王永赵新朱珠崔兴华郭永泽程奕
关键词：黄瓜种子纯度SNP标记焦磷酸测序
基于高分辨率熔解曲线技术快速筛选黄瓜SNP_1被引量：6
2011年
为筛选用以黄瓜纯度检验和品种鉴定的SNP位点,以17个黄瓜杂交品种及其34份亲本为SNP筛选群体,利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术筛选SNP位点。本研究通过HRM分析和焦磷酸测序确认,获得CLA0(TT/--)、CLA1(C/T)和CLA6(A/G)三个SNP位点,群体中多态信息量(PIC)分别为0.549、0.366和0.477;并对市售12个杂交黄瓜种分型鉴定,结果表明,三个SNP位点适用于其中11个市售品种的纯度鉴定,具备用于品种鉴定的潜能。
兰青阔张桂华王永赵新朱珠孙玉河郭永泽程奕
关键词：黄瓜SNP标记高分辨率熔解曲线
利用DNA池技术提高基于InDel标记的种子纯度鉴定效率
2012年
为提高基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测通量,降低检测成本,本研究模拟10种DNA Pooling进行PCR、Pyrosequencing及等位基因频率分析。通过TTest分析不同Pooling间等位基因频率的差异性,确定3 Pooling为种子纯度检测最适Pooling数;建立3 Pooling-InDel-Pyrosequencing标准曲线,其R2达0.999 1;根据该标准曲线,检测黄瓜杂交品种"园中王"30粒杂交种种子纯度,结果为96.67%。本研究丰富了基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测技术体系。
兰青阔余景会赵新王永张桂华朱珠陈锐李欧静郭永泽程奕
关键词：INDEL标记黄瓜种子纯度鉴定
复合EST-SSR标记在大白菜品种鉴定中的应用被引量：5
2013年
利用EST-SSR分子标记技术,对12份大白菜品种鉴定方法进行了研究。通过对GenBank数据库中公布的大白菜EST序列的分析,合成了30对核心EST-SSR引物,其中21对均可得到有效扩增,10对具有较高的多态性。为了更加高效的对大白菜品种进行鉴定,根据这10对多态性较高的引物对12份市售大白菜品种鉴定的结果及扩增条带的相互位置差异,研制了由多个引物对组成的2套复合EST-SSR标记,建立了多重SSR的反应体系及反应条件。筛选得到的2套标记组合,多态率分别为88.9%和97.0%,多态信息量均为0.910%,数据表明这2套复合标记技术可以表达大白菜品种间的多态性,高效准确的对12份大白菜品种进行鉴定。
赵新王永兰青阔陈锐李欧静余景会朱珠郭永泽
关键词：大白菜种子
津南芹菜EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析被引量：8
2012年
以天津市津南11个芹菜育种材料为研究对象,利用EST-SSR分子标记技术构建津南芹菜分子指纹图谱,并用于遗传多样性分析。从GenBank数据库查询芹菜EST序列1122条,使用BatchPrimer3在线软件扫描分析获得194个候选EST-SSR位点,并设计141对SSR-PCR引物。选择其中47对引物进行多态性分析,确认8对引物具有多态性。构建基于Excel格式的津南芹菜EST-SSR指纹图谱,包括8对引物在供试材料中扩增到的44条多态性条带信息。遗传多样性分析显示,供试材料间遗传相似系数介于0.409～0.864之间,平均为0.664。本研究建立的津南芹菜EST-SSR指纹图谱稳定有效,可用于芹菜种质资源鉴定和品种真实性检测。
兰青阔李欧静张继波赵新朱珠陈锐徐石勇王永郭永泽
关键词：芹菜SSR标记指纹图谱
基于复合EST-SSR标记的大白菜种子纯度鉴定及SNP位点获取被引量：9
2013年
以10份大白菜杂交种及其亲本为研究对象,基于NCBI基因组数据库中EST序列信息,应用SSR标记及高分辨率溶解曲线技术筛选出用于大白菜杂交种纯度鉴定的SNP位点及复合SSR位点,并根据高通量分子检测技术种子纯度鉴定的需要,对单粒种子育苗条件、单株植株提取状态、快速DNA提取方法、复合PCR体系的建立等关键技术进行了摸索及优化。结果显示:经过48h破壳状态的单粒种子,采用改良CTAB法可于3h内得到较高质量的DNA;同时经7d达到苗期状态的单株叶片,采用chexe-100法亦可于40min内完成DNA提取;筛选得到的SNP位点可对6份大白菜杂交种进行纯度鉴定,复合SSR位点可对10份大白菜杂交种进行纯度鉴定。
赵新王永兰青阔贺长征陈锐李欧静刘娜朱珠郭永泽
关键词：大白菜种子纯度鉴定SNP
基于SNP标记的种子纯度高效检测分析模型的建立被引量：7
2012年
单核苷酸多态性(SNP)标记具有二态性等优点,可用于种子纯度鉴定。应用焦磷酸测序技术对黄瓜SNP位点CLA13(C/G)进行了分析。结果表明,该位点在16个黄瓜杂交种中多态信息量达0.556,处于高度多态,适于其中7个品种的纯度检测;为提高种子纯度鉴定效率,引入DNA Pooling技术,建立高效率的3Pooling SNP Pyrosequencing检测分析模型,并验证了分析模型的可行性。
李欧静张桂华兰青阔王永赵新朱珠陈锐郭永泽
关键词：SNP标记种子纯度鉴定
基于InDel标记快速检测黄瓜津优38种子纯度被引量：28
2011年
以黄瓜品种津优38中插入缺失(InDel)标记为研究对象,筛选获得能够区分津优38父本、母本及其杂交种的[TT]缺失位点;应用焦磷酸测序技术检测该位点,初步建立基于InDel标记的津优38种子纯度鉴定方法并检测8批种子样品。结果表明,应用焦磷酸测序技术检测[TT]缺失位点能明显区分出津优38父本、母本及杂交种;基于InDel标记的津优38种子纯度鉴定方法具有高准确性、高通量、操作简单、易于自动化等优点;8批种子样品平均种子纯度为97.08%,与SSR鉴定结果(95.83%)基本相符。
兰青阔张桂华王永赵新朱珠杜胜利程奕
关键词：INDEL标记黄瓜种子纯度
基于EST-SSR标记的花椰菜种子品种鉴定被引量：4
2014年
利用EST-SSR分子标记技术对13份市售花椰菜(Brassica oleracea L.var.botrytis)种子进行品种鉴定研究。通过对GenBank数据库上公布的花椰菜EST序列信息的分析,合成EST-SSR核心引物36对,其中20对可得到有效扩增,11对具有较高的多态性,并结合3对十字花科芸薹属EST-SSR引物对13份花椰菜的鉴定结果及扩增条带的相互位置差异进行分析,应用其中5对EST-SSR引物即可表达不同花椰菜品种间的多态性,高效准确地对13份市售花椰菜进行品种鉴定。
王永刘娜李梅赵新刘莉莉兰青阔王超楠陈锐朱珠李欧静郭永泽
关键词：花椰菜种子EST-SSR
应用正交设计对大白菜纯度鉴定中EST-SSR反应体系的优化被引量：1
2013年
以3份大白菜杂交种及其亲本为试验材料,利用改良CTAB法提取基因组DNA,采用正交设计对Mg2+、dNTPs、引物、模板DNA和Taq酶5因素4水平进行优化,结果表明,适用于大白菜纯度鉴定EST-SSR检测体系为:在10μL反应体系中包含3.0mmol·L-1MgCl2、400μmol·L-1dNTPs、0.20μmol·L-1SSR引物、4ng模板DNA和0.05UTaq酶。利用该优化的体系,对3份大白菜杂交种进行单株育苗试验,每份杂交种取单株140株进行纯度鉴定。结果显示,扩增带型清晰、稳定,纯度检测结果与田间试验结果基本吻合,可用于大白菜种子纯度分子标记的进一步研究。
赵新贺长征兰青阔陈锐齐志伟李欧静朱珠王永郭永泽
关键词：大白菜纯度鉴定正交设计EST-SSR
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