广东省海洋渔业科技推广专项项目(A200908F01)
- 作品数：5 被引量：20H指数：3
- 相关作者：刘楚吾刘丽李晓娜李文娟陈育盛更多>>
- 相关机构：广东海洋大学更多>>
- 发文基金：国家海洋公益性行业科研专项广东省海洋渔业科技推广专项项目广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 利用ITS基因研究徐闻滨珊瑚的系统发生关系被引量：3
- 2012年
- 分别研究了徐闻3种滨珊瑚的ITS1和ITS2基因的碱基组成和G+C含量,并和已上传至Genbank上的其他9种滨珊瑚的ITS序列进行比较,研究了徐闻3种滨珊瑚的系统发生关系。序列分析结果显示,3种滨珊瑚的ITS1的长度为205 bp～209 bp,G+C含量为37.6%～45.5%,ITS2的长度为192 bp～226 bp,G+C含量为45.1%～50.7%,利用MEGA4.1软件计算滨珊瑚属基于ITS1和ITS2基因的平均遗传距离分别为0.097和0.200。基于ITS1和ITS2的NJ系统进化树都显示出,灰黑滨珊瑚位于进化树的基部,是原始的类群,普格滨珊瑚是进化类群,澄黄滨珊瑚是过渡类群。
- 李文娟刘楚吾刘丽廖宝林
- 关键词：滨珊瑚ITS基因系统发生关系
- 徐闻珊瑚礁的研究现状与前景展望被引量：8
- 2011年
- 珊瑚礁生态系统是地球上最复杂、生物种类最丰富,与陆地的热带雨林齐名的海洋生物物种资源宝库,对维持生物多样性和资源生产力具有特殊价值。全世界珊瑚虫纲物种多达6 100多种[1],我国从台湾岛开始,直到南海一带均有珊瑚分布,
- 廖宝林刘丽刘楚吾
- 关键词：珊瑚礁
- 运用线粒体COⅠ基因分析8种石珊瑚系统发育关系被引量：4
- 2012年
- 通过COⅠ基因特异扩增测序,对徐闻地区的8种石珊瑚COⅠ基因片段序列进行了比较分析。结果表明,该片段的平均G+C含量为41.60%。其中,第1密码子位点的含量最高(42.26%～44.05%,平均为43.45%);转换和颠换多发生在第3密码子位点,比例高达70.30%和72.70%。采用临位连接(NJ)、最小进化(ME)和最大似然(ML)法对本研究中徐闻的8种及引自GenBank的20种石珊瑚COⅠ基因片段构建了系统发育树。结果显示,分子系统分类与传统分类略有差异,暗示珊瑚表型可塑性可能对传统分类存在影响。
- 李晓娜刘丽刘楚吾
- 关键词：石珊瑚
- 基于线粒体Cytb基因的10种石珊瑚的系统发育关系被引量：8
- 2011年
- 通过PCR扩增直接测序得到10种徐闻石珊瑚线粒体Cyt b基因部分序列,分析其碱基组成和变异频率,并采用Neighbor-Joining和Maximum Parsimony法构建系统发育树。结果显示:序列中A+T比例为61.0%,G+C比例为39.0%,前者明显高于后者,碱基替换主要发生在密码子第3位;滨珊瑚科分类与传统分类存在一定差异,揭示传统形态学分类可能受珊瑚骨骼生长可塑性限制,造成分类不准确;刺柄珊瑚属与蜂巢珊瑚科各属亲缘关系较近。
- 刘丽陈育盛李晓娜申玉春刘楚吾
- 关键词：石珊瑚CYTB基因系统发育树
- 徐闻角孔珊瑚系统发育关系被引量：2
- 2011年
- 本文以徐闻4种角孔珊瑚为研究对象,研究了其ITS基因各区段的长度,碱基组成及(G+C)含量,计算了4种角孔珊瑚间的遗传距离并构建了其系统发育树。结果显示,4种角孔珊瑚的ITS基因长度在592～599bp之间,4种角孔珊瑚ITS区的(G+C)平均含量在48.5%,二异角孔珊瑚的ITS基因各个区段的(G+C)的含量与其他3种珊瑚差异较大,ITS1为47.1%,ITS2为49.2%。碱基组成分析结果显示4种角孔珊瑚的ITS区在碱基使用上没有偏向性。二异角孔珊瑚与其他三种角孔珊瑚的遗传距离分别为0.235、0.242、和0.235,远远高于平均遗传距离0.123,UPGMA聚类分析也显示二异角孔珊瑚在进化树上成为单独的一支。
- 刘丽李文娟刘楚吾廖宝林
- 关键词：ITS基因系统发生关系
