云南省教育厅科学研究基金一般项目(2011Y234)
- 作品数:2 被引量:4H指数:2
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- 发文基金:云南省教育厅科学研究基金一般项目云南省应用基础研究基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 灰葡萄孢基因中微卫星序列分析被引量:2
- 2013年
- 微卫星(SSR)一般是指由单、双、三、四、五和六核苷酸重复单元串联排列的简单重复序列,它广泛分布于生物基因组内,在不同生物中,微卫星DNA的数目、类型及其分布情况存在很大的差异。本研究主要统计了已公布的灰葡萄孢基因序列中的SSR数量及类型,在灰葡萄孢的564个预测基因区域中发现669个微卫星序列,其中大多数基因(477个基因)只含有1个碱基SSR,占含SSR基因总数的71.3%;72个基因含有2个碱基SSR,13个基因含有3个碱基SSR,含4个和5个碱基SSR的基因则各只有1个。所有SSR序列中,出现数量最多的为3个碱基和6个碱基的SSR序列,分别达到了135次和330次,1个碱基、2个碱基、4个碱基和5个碱基的SSR则分别出现了7、41、64和92次。SSR碱基数越多,重复的次数越少,重复次数最少的SSR是6个碱基的AGAGGG重复。重复次数最高的SSR为122次,是3个碱基的AAT重复,这表明,在选择压力下,SSR趋向于密码子的整数倍,这与其他物种的分析结果一致。发现大多数含有SSR的基因并没有明确的功能描述,这可能是由于这些基因受到SSR的影响而在进化上变化较快所致。
- 张悦施唯李丹路沁陈子牛
- 关键词:灰葡萄孢微卫星序列基因组生物信息学
- 6种植物粗提物对海棠花灰霉菌的抑制效果被引量:2
- 2012年
- 采用生长速率法测定了6种常见植物的无水乙醇粗提物和水粗提物对海棠花灰霉菌的抑制效果。结果表明,6种植物的水和无水乙醇粗提物对灰霉菌的抑制效果差别较大,其中马褂木和紫茎泽兰的抑菌效果最明显,而其他材料也有一定的抑菌效果。6种植物材料中除紫茎泽兰外无水乙醇粗提物的提取率均低于水粗提物,在不同浓度时6种植物的无水乙醇、水粗提物对灰霉菌的抑制作用均不同,但基本上表现为无水乙醇粗提物大于水粗提物。
- 张悦陈子牛李丹侯思明
- 关键词:灰霉菌抑菌作用