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国家自然科学基金(31070070)

作品数:6 被引量:12H指数:2
相关作者:白林泉邓子新吴杭芦晨阳刘静更多>>
相关机构:上海交通大学安徽大学宁波大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:生物学轻工技术与工程化学工程医药卫生更多>>

文献类型

  • 6篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学
  • 2篇化学工程
  • 2篇轻工技术与工...
  • 1篇医药卫生

主题

  • 2篇蛋白
  • 2篇转运蛋白
  • 2篇井冈霉素
  • 2篇基因
  • 2篇ABC转运蛋...
  • 1篇代谢产物
  • 1篇盐霉素
  • 1篇药物
  • 1篇三磷酸
  • 1篇生物合成
  • 1篇生物合成基因
  • 1篇生物合成基因...
  • 1篇生物药
  • 1篇生物药物
  • 1篇酸酯
  • 1篇片段
  • 1篇片段缺失
  • 1篇前体
  • 1篇染色
  • 1篇染色体

机构

  • 5篇上海交通大学
  • 2篇安徽大学
  • 1篇宁波大学

作者

  • 5篇白林泉
  • 2篇吴杭
  • 2篇邓子新
  • 2篇芦晨阳
  • 1篇周秀芬
  • 1篇苏秀榕
  • 1篇姜春艳
  • 1篇张部昌
  • 1篇邱竞帆
  • 1篇彭瑶
  • 1篇刘静

传媒

  • 3篇微生物学报
  • 1篇中国抗生素杂...
  • 1篇微生物学通报
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2017
  • 1篇2016
  • 1篇2014
  • 2篇2013
  • 1篇2012
6 条 记 录,以下是 1-6
排序方式:
Asm8, a specific LAL-type activator of 3-amino-5-hydroxy-benzoate biosynthesis in ansamitocin production被引量:4
2013年
The highly potent antitumor agent ansamitocin P3 is a macrolactam isolated from Actinosynnema pretiosum ATCC 31565. A 120-kb DNA fragment was previously identified as the ansamitocin biosynthetic gene cluster, and contains genes for polyketide assembly, precursor synthesis, post-polyketide synthesis modification, and regulation. Within the biosynthetic gene cluster, asm8 encodes an 1117-amino-acid protein with a high degree of similarity to the large ATP-binding LuxR family-type regulators. In the current study, we determined that inactivation of asm8 by gene replacement in ATCC 31565 resulted in the complete loss of ansamitocin production, and that complementation with a cloned asm8 gene restored ansamitocin biosynthesis. Interestingly, the disruption of asm8 decreased the transcription of genes responsible for 3-amino-5-hydroxybenzoate (AHBA) formation, the starter unit required for ansamitocin biosynthesis. Subsequently, feeding of exogenous AHBA to the asm8 mutant restored ansamitocin biosynthesis, which showed that Asm8 is a specific positive regulator in AHBA biosynthesis. In addition, investigation of asm8 homologs identified two new ansamitocin producers, and inactivation of the asm8 homolog in A. pretiosum ATCC 31280 abolished ansamitocin production in this strain. Characterization of the positive regulator Asm8 and discovery of the two new ansamitocin producers paves the way for further improving production of this important antitumor agent.
PAN WenQinKANG QianJinWANG LeiBAI LinQuanDENG ZiXin
关键词:生物合成基因簇苯甲酸酯
基于转录组分析的染色体大片段缺失及其对井冈霉素高产菌株的影响
2017年
【目的】测试大片段删减低转录区域对菌体生长和井冈霉素产量的影响。【方法】通过转录组分析,选择染色体上连续的基因低转录区域进行大片段缺失,通过Cre-loxP位点特异性重组得到1.2 Mb片段缺失突变株LCY-4。HPLC检测缺失株井冈霉素产量的变化,并测定干重绘制生长曲线。【结果】通过转录组分析,我们在井冈霉素高产菌株TL01染色体左侧末端发现了1.9 Mb的连续基因低转录区,使用Cre-loxP系统对其中的1.2 Mb区域进行大片段缺失,成功得到了1.2 Mb缺失突变株LCY-4。和出发菌株TL01相比,缺失突变株LCY-4中井冈霉素发酵产量基本保持不变,生物量有显著提高,最高增幅达到44%。【结论】1.2 Mb区域的成功缺失,意味着基于转录组分析寻找连续的基因低转录区域并加以缺失的策略的可行性。1.2 Mb片段缺失对菌体生物量积累具有明显促进作用,为后续将其开发成氨基环醇类药物异源表达的通用高产宿主奠定了基础。
芦晨阳吴杭苏秀榕白林泉
关键词:井冈霉素转录组
吸水链霉菌井冈变种的色素合成基因缺失对井冈霉素产量的影响被引量:1
2016年
【目的】通过缺失井冈霉素高产菌株TL01中4个典型的色素合成基因簇来考察其对井冈霉素产量、菌体生长和发酵液颜色的影响。【方法】通过同源重组双交换对4个色素合成基因簇进行逐个同框缺失,HPLC检测突变株井冈霉素产量的变化,q RT-PCR检测突变株中井冈霉素合成基因转录变化,通过称量菌丝体干重来绘制其生长曲线。【结果】和出发菌株TL01相比,多巴类黑色素基因簇缺失株PY06中井冈霉素的发酵产量由原来的20.6 g/L上升至23.1 g/L,提高了12%;III型聚酮合酶编码的黑色素基因簇缺失株PY07产量无明显变化;II型聚酮合酶编码的孢子色素基因簇缺失和褐黄素基因簇缺失分别导致井冈霉素产量下降11.7%和17.2%。所有缺失突变株中井冈霉素基因簇转录水平和发酵液颜色均没有明显变化。【结论】不同色素基因的缺失对井冈霉素产量和菌株生物量积累具有不同的影响。多巴类黑色素与井冈霉素的生物合成过程竞争共同前体,将其中断后使前体流向井冈霉素生物合成,达到了进一步提高产量的目的。
彭瑶芦晨阳白林泉
关键词:井冈霉素黑色素酪氨酸
微生物药物产生菌功能基因组学研究进展被引量:2
2013年
微生物药物是一类化学结构和生物活性多样的次级代谢产物,近年来其多个产生菌基因组序列已经被测定完成,在此基础上开展的功能基因组研究方兴未艾,并在抗生素生物合成、形态分化、调控、系统发育与进化以及次级代谢产物挖掘等方面有着新的发现,展现出广阔的研究前景。本文重点阐述了四种重要抗生素产生菌功能基因组学的研究现状,集中于青霉素高产的遗传机制、红霉素产生菌红色糖多孢菌基因组与转录组分析、链霉素产生菌灰色链霉菌中A因子调控网络、阿维菌素产生菌作为次级代谢物异源表达的通用宿主与超高产菌株构建以及新型天然产物的挖掘等研究内容,同时简要介绍了当前我国微生物药物产生菌基因组学的研究概况,并从基础与应用两个角度对其未来发展趋势进行了展望。
吴杭白林泉周秀芬邓子新
关键词:红霉素链霉素阿维菌素功能基因组学
放线菌中腺苷三磷酸结合盒转运蛋白的研究进展
2012年
放线菌由于能产生多种结构新颖、活性独特的次级代谢产物,在医药工业、农业和环境保护上具有重要作用。全基因组测序的数据显示,放线菌中含有数目众多的腺苷三磷酸结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白基因,在营养摄入、次级代谢产物转运、外源毒素解毒等一系列过程中发挥着重要的作用。本文概述了ABC转运蛋白的结构和作用机制,并结合本实验室的研究工作,对近年来放线菌中ABC转运蛋白的研究进展进行了比较全面的综述,着重介绍了负责次级代谢产物跨膜转运的ABC外排蛋白,并展望了放线菌ABC转运蛋白的研究热点和应用前景。
邱竞帆邓子新白林泉
关键词:放线菌ABC转运蛋白次级代谢产物抗生素
ABC转运蛋白基因slnTI和slnTII与盐霉素生物合成的相关性被引量:5
2014年
【目的】slnTI和slnTII是盐霉素生物合成基因簇中可能的两个转运蛋白基因,根据生物信息学的分析推测它们属于ABC转运蛋白家族。其中,slnTI编码ABC转运蛋白的ATP结合亚基,slnTII编码ABC转运蛋白的跨膜亚基,推测它们可能与盐霉素的外排有关。通过slnTI和slnTII的基因中断与超量表达研究它们对盐霉素生物合成产量和抗性的影响。【方法】利用REDIRECT?技术,在盐霉素产生菌白色链霉菌XM211中分别构建了slnTI和slnTII的基因置换突变株LJ01和LJ02,并通过基因回补对突变株进行了验证。利用整合型表达载体pPM927在白色链霉菌XM211中对slnTI和slnTII进行串联超量表达。将slnTI和slnTII导入变铅青链霉菌1326中进行异源表达,通过液体培养实验检测衍生菌株对盐霉素的抗性。【结果】相比出发菌株XM211,突变株LJ01中盐霉素的产量下降了27.2%,LJ02下降了45.4%,LJ01和LJ02中结构基因slnA3和调控基因slnR的转录水平都有明显降低。超量表达菌株LJ03中盐霉素的产量提高了14.6%,转录结果显示LJ03中不仅slnTI和slnTII自身转录水平有大幅提高,而且slnA3和slnR转录水平也显著升高。抗性检测结果表明,异源表达菌株变铅青链霉菌LJ04对盐霉素的抗性水平略有提高。【结论】slnTI和slnTII是与盐霉素生物合成和外排有关的ABC转运蛋白基因,但并不是白色链霉菌XM211对盐霉素的主要抗性基因。
刘静姜春艳张部昌白林泉
关键词:盐霉素ABC转运蛋白基因置换抗性
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