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天津市自然科学基金(06YFJMJC09900)
作品数:
1
被引量:13
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陈蕾
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2008
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染矽尘大鼠早期肺组织差异基因表达谱的研究
被引量:13
2008年
目的研究染矽尘大鼠早期肺组织与正常肺组织的差异基因表达谱。方法应用气管暴露法建立雄性Wistar大鼠染矽尘模型和对照组,每组3只,应用Illumina激光共聚焦光纤微珠基因芯片技术,研究建模后14d时的大鼠肺组织差异基因表达谱,并采用DAVID生物信息学分析工具,进行Fisher精确概率检验,对差异基因的基因功能和生物学通路进行富集统计学分析。结果检测出的有效基因共22107个,筛选出染矽尘组与对照组的差异基因共1567个,其中上调基因为765个,下调基因为802个。在KEGG生物学通路数据库中,共406个差异基因获得注释,上调基因为204个,其中11个生物学通路相关基因显著上调;下调的基因有202个,其中3个生物学通路相关基因显著下调。Real-timePCR实验验证了血红素加氧酶1(HMOX1)、超氧化物歧化酶2(SOD2)基因上调的趋势和基因芯片结果是一致的。结论本次实验筛选出了染矽尘早期大鼠肺组织差异基因,提示矽尘致肺纤维化过程中可能存在相互作用的基因簇。
陈蕾
王世鑫
刘萍
魏茂提
栾大伟
何瑞波
涂植光
关键词:
矽肺
寡核苷酸序列分析
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