中央高校基本科研业务费专项资金(SWJTU11CX114)
- 作品数：6 被引量：18H指数：2
- 相关作者：周嘉裕廖海王万军方袁梦梦宋涛更多>>
- 相关机构：西南交通大学中国科学院成都生物研究所更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学化学工程更多>>
- 决明子营养价值分析及蛋白提取工艺研究被引量：7
- 2014年
- 以大决明子为原材料,基于氨基酸比值系数法,对决明子的营养价值进行了分析;并以碱性缓冲液为提取剂,进行决明子蛋白提取工艺研究,探讨了缓冲液浓度及pH值、料液比、浸泡时间对蛋白提取率的影响,最后用正交试验确定大决明子蛋白的最佳提取工艺。结果表明决明子的营养价值高于大豆和紫花苜蓿,与南瓜接近略低于鸡蛋;提取工艺条件最佳为50 mmol/L、pH值=8.0的KH2PO4-NaOH缓冲液,料液比1 g:50 mL,浸泡提取时间12h。此条件下决明子蛋白的提取率为93.3%。
- 冯潜刘祖碧宋涛焦林涛陈胜华周嘉裕廖海
- 关键词：决明子营养价值蛋白提取正交试验
- 植物磷酸乙醇胺甲基转移酶的生物信息学分析被引量：2
- 2013年
- 运用生物信息学的方法,对已在Genbank数据库中注册的菠菜、甜菜、拟南芥、陆地棉和辽宁碱蓬等中磷酸胆碱合成的关键酶磷酸乙醇胺甲基转移酶(PEAMT)的氨基酸序列进行分析。结果显示:植物PEAMT属于稳定蛋白质,含有较丰富的赖氨酸和亮氨酸;不同植物PEAMT的氨基酸序列具有较高的同源性,含有与SAM结合的保守结合域及Tyr-His氨基酸对;植物PEAMT属于胞质酶,不与膜结合;分子进化研究表明PEAMT可作为植物遗传分化和分子进化研究的重要依据;氨基酸序列中不存在信号肽;分子中不存在跨膜结构域,可能受蛋白激酶C的磷酸化;无规则卷曲是多肽链中的主要结构元件;蛋白质保守区域包含两个AdoMet-MTase区域,属于典型的SAM依赖性甲基转移酶功能结构域。本研究还初步构建了菠菜PEAMT的三维模型,能够认识植物中PEAMT的特异性及催化分子机制,并为通过分子改造创造出具有更强抗逆效能的PEAMT提供理论参考。
- 冯斌俞继华张宝宋志磊陈劲松廖海周嘉裕
- 关键词：生物信息学磷酸胆碱S-腺苷甲硫氨酸
- 决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接被引量：1
- 2013年
- 查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中类黄酮生物合成途径的关键酶,其催化对-香豆酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A发生缩合反应。本研究以苜蓿CHS的晶体为模板,利用同源建模构建决明CHS的三维模型。经过动力学优化后,决明CHS的三维模型与苜蓿CHS的结构极为相似,主要由α-螺旋和β-折叠构成,其中有13个α螺旋,占32.82%,15个β折叠,占19.23%,无规则卷曲占47.95%。模型验证结果表明决明CHS的三维模型具有合理的立体化学性质与氨基酸相容性。决明CHS含有两个重要的结构域:对-香豆酰辅酶A结合域与丙二酸单酰辅酶A结合域。决明CHS与对-香豆酰辅酶A、丙二酸单酰辅酶A的结合主要通过氢键与范德华力。决明CHS中Cys164、His303与活性中心的H_2O能够形成电子传递体系,参与对-香豆酰辅酶A形成CHS-对-香豆酰基中间产物。本研究结果为利用此类CHS三维模型研究其催化机理和分子工程改造奠定基础。
- 李云双周虹钟德馨方袁梦梦王万军廖海周嘉裕
- 关键词：查尔酮合成酶同源模建分子对接决明类黄酮
- 棉铃虫类胰蛋白酶的生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 对棉铃虫(Helicoverpa armigera L.)肠道内7种类胰蛋白酶的氨基酸序列进行了生物信息学分析。结果表明,棉铃虫7种类胰蛋白酶理化性质相近,含有丰富的Ala、Cys、Gly与Thr,均为可溶性蛋白酶,不稳定性较高。类胰蛋白酶分子中不存在跨膜结构域,含有特定的磷酸化位点,主要分布在细胞外基质与内质网中。棉铃虫类胰蛋白酶属于胰蛋白酶超家族成员,具有较高的氨基酸序列同源性,分子中含有保守的必需氨基酸残基,参与维持蛋白酶的空间结构及行使催化功能。分子进化研究表明类胰蛋白酶Ⅲ与类胰蛋白酶Ⅵ进化关系较近,而类胰蛋白酶Ⅰ和类胰蛋白酶Ⅱ在进化关系上更为接近。无规卷曲结构是类胰蛋白酶二级结构中的主要结构元件。
- 龙婷雷洁萍宋涛和丽然周嘉裕廖海
- 关键词：ARMIGERA类胰蛋白酶生物信息学
- 决明查尔酮合成酶全长基因序列的克隆与分析被引量：7
- 2013年
- 从决明(Cassia tora)的新鲜子叶中提取基因组DNA作为模板,利用一对特异引物进行PCR扩增,然后克隆测序得到决明查尔酮合成酶(CHS)的基因全长。测序结果表明,决明CHS基因全长为1 766 bp,含有2个外显子和1个内含子。将其提交GenBank,登录号为(JX676773)。决明CHS基因的内含子位于188-765 bp之间,长度为578 bp,内含子的剪切符合GU-AG规律,含有多个酶切位点和顺式调控元件,可能与决明CHS基因的表达调控有关。CHS基因内含子具有多态性,可能是由不同植物存在多样性的生活史与生活环境导致的。决明CHS基因外显子2较为保守,编码几乎所有CHS的功能位点。构建外显子2编码氨基酸序列的NJ系统发育进化树,能够正确反映不同植物的亲缘关系,可用于不同植物的遗传分化和分子进化研究。
- 钟德馨方袁梦梦郭壮浩安红强董银松丁若凡王万军廖海周嘉裕
- 关键词：决明查尔酮合成酶内含子基因克隆
- 川芎甜菜碱醛脱氢酶cDNA的克隆及其植物表达载体的构建
- 2013年
- 以川芎为试材,从叶片中提取总RNA,经过RT-PCR获得甜菜碱醛脱氢酶(Betaine aldehyde dehydrogenase)基因的cDNA,纯化后与pMD18-T载体连接,转化大肠杆菌Top10,获得甜菜碱醛脱氢酶全长基因序列,以期构建植物表达载体。结果表明:甜菜碱醛脱氢酶全长核苷酸长度为1 527bp,编码508个氨基酸。与GenBank中已发表序列HM35276进行比较,核苷酸同源性为100%。将该基因片段克隆到植物表达载体pBI121中,构建重组质粒pBI121/Betaine alde-hyde dehydrogenase,并将所获重组质粒经过双酶切和PCR处理后进行序列测定,证实表达载体上含有目的片段,且连接、构建正确,为BADH的进一步表达奠定了基础。
- 毛莹张艳军王万军陈劲松廖海周嘉裕
- 关键词：川芎甜菜碱醛脱氢酶克隆植物表达载体
