中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(CAFRIFEEP201007)
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 相关作者：李国宏魏建荣尚娜赵同海更多>>
- 相关机构：中国林业科学研究院河北大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 萧氏松茎象线粒体基因组全序列测定与分析被引量：2
- 2012年
- 象甲是鞘翅目中物种最丰富的类群,目前关于其线粒体基因组全序列的研究还未见报道。本研究利用长距PCR和引物步移法对萧氏松茎象Hylobitelus xiaoi Zhang线粒体基因组全序列进行了测定。结果显示:萧氏松茎象线粒体基因组序列全长16123bp(GenBank登录号为JX847496),共编码37个基因和1个非编码的控制区,基因次序与典型的六足动物线粒体基因排列一致,未发现基因重排现象。在基因组中两个值得注意的发现分别是:1)N链上存在1个额外的trnV-like序列,反密码子为GAC,长度为69bp,其中65bp与J链上的trnD重叠;2)trnSUCN和nad1之间存在1个长度为232bp的基因间隔区。全部13个蛋白质编码基因的起始密码子均为ATN,9个蛋白质编码基因的终止密码子为TAA,其余4个蛋白质编码基因中,nad1和cox2的终止密码子为TAG,nad4和nad5则以不完整的终止密码子T作为终止信号。除trnSAGN外,其余的tRNAs均可形成典型的三叶草结构。而trnSAGN的反密码子由TCT替代GCT,反密码子臂延长形成9bp(中间含1个碱基突起),TΨC臂由正常的5bp变为6bp,DHU臂缩短仅1bp,各个臂之间没有连接碱基。线粒体控制区中包括10处长度不少于5bp的poly-T(最长poly-T长度为14bp)和2处微卫星样重复序列(TA)6和(TA)9。本研究结果为探讨象甲总科在鞘翅目中的系统学地位及其与其他总科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据。
- 李国宏尚娜魏建荣
- 关键词：鞘翅目萧氏松茎象线粒体基因组
- 不同地区萧氏松茎象遗传多样性的RAPD分析被引量：1
- 2012年
- 以萧氏松茎象7个地理种群的基因组DNA为材料,对其进行随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,从80个引物中筛选出39个稳定性好、多态性高的引物。7个地理种群共扩增出489条扩增条带,每条引物平均可以得到12.5条扩增条带,其长度从250～2 000 bp不等,其中443条(90.6%)扩增条带为多态性条带,平均每条引物可得到11.4条多态性条带。通过公式计算多态性位点、遗传距离、及Nei's遗传距离,结果表明:萧氏松茎7个地理种群之间的遗传距离指数的变异范围为0.403 7～0.484 4,遗传相似性指数为0.515 6～0.596 3,平均遗传距离指数为0.444 1;其Shannon's信息指数为0.588 6～0.625 7,Nei's遗传距离为0.009 0～0.030 2;表明萧氏松茎象种群间存在一定的遗传多样性。通过UPGMA聚类分析,将7个萧氏松茎象地理种群划分为4个聚类簇。分析表明,萧氏松茎象7个地理种群存在丰富的遗传多样性,其遗传分化与地理位置有一定的相关性。
- 李国宏王伟赵同海
- 关键词：萧氏松茎象地理种群随机扩增多态性DNA
