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国家高技术研究发展计划(2006AA02Z312)

作品数:16 被引量:42H指数:4
相关作者:李志良杨善彬梁桂兆舒茂梅虎更多>>
相关机构:重庆大学宜宾学院湖南大学更多>>
发文基金:国家高技术研究发展计划高等学校学科创新引智计划重庆市应用基础研究项目更多>>
相关领域:理学医药卫生化学工程更多>>

文献类型

  • 16篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 9篇理学
  • 8篇医药卫生
  • 2篇化学工程

主题

  • 10篇定量构效关系
  • 4篇QSAR
  • 2篇抑制剂
  • 2篇原子
  • 2篇制剂
  • 2篇三维全息原子...
  • 2篇手性
  • 2篇偏最小二乘
  • 2篇偏最小二乘回...
  • 2篇全息
  • 2篇描述子
  • 2篇激素
  • 2篇构效
  • 2篇构效关系
  • 2篇构效关系研究
  • 2篇氨基酸
  • 2篇场作用
  • 1篇电性
  • 1篇定量构效关系...
  • 1篇定量结构-保...

机构

  • 13篇重庆大学
  • 5篇宜宾学院
  • 2篇湖南大学
  • 2篇四川理工学院
  • 1篇第三军医大学...
  • 1篇湖南工程学院
  • 1篇内江师范学院
  • 1篇陕西科技大学

作者

  • 9篇李志良
  • 8篇杨善彬
  • 5篇舒茂
  • 5篇梁桂兆
  • 4篇杨青林
  • 3篇夏之宁
  • 3篇梅虎
  • 3篇廖立敏
  • 3篇潘元
  • 2篇刘丽
  • 2篇朱万平
  • 2篇杨力
  • 2篇李建
  • 2篇杨娟
  • 2篇陈国华
  • 2篇陆瑶
  • 1篇仝建波
  • 1篇刘玉婷
  • 1篇孙家英
  • 1篇陈萍

传媒

  • 2篇分析化学
  • 2篇化学学报
  • 2篇Chines...
  • 1篇分子科学学报
  • 1篇中华医院感染...
  • 1篇中国抗生素杂...
  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇中国科学(B...
  • 1篇林产化学与工...
  • 1篇华西药学杂志
  • 1篇计算机与应用...
  • 1篇物理化学学报
  • 1篇精细化工
  • 1篇加快转变医药...

年份

  • 1篇2011
  • 8篇2009
  • 7篇2008
  • 1篇2007
16 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
3D-HoVAIF用于环己烯类神经氨酸酶抑制剂的QSAR研究
采用本实验室提出的三维原子场全息作用矢量对37个环己烯类神经氨酸酶抑制剂进行结构参数化表征,采用逐步回归对变量进行筛选后运用偏最小二乘回归建立QSAR模型.模型的复相关系数(R2)、交互校验复相关系数(Q2cum)和模型...
杨善彬杨青林梁桂兆潘元李雷光
关键词:定量构效关系偏最小二乘回归
文献传递
New Descriptors of Amino Acids and Its Applications to Peptide Quantitative Structure-activity Relationship被引量:2
2008年
A new set of descriptors, HSEHPCSV (component score vector of hydrophobic, steric, and electronic properties together with hydrogen bonding contributions), were derived from principal component analyses of 95 physicochemical variables of 20 natural amino acids separately according to different kinds of properties described, namely, hydrophobic, steric, and electronic properties as well as hydrogen bonding contributions. HSEHPCSV scales were then employed to express structures of angiotensin-converting enzyme inhibitors, bitter tasting thresholds and bactericidal 18 peptide, and to construct QSAR models based on partial least square (PLS). The results obtained are as follows: the multiple correlation coefficient (R2cum) of 0.846, 0.917 and 0.993, leave-one-out cross validated Q2cm of 0.835, 0.865 and 0.899, and root-mean-square error for estimated error (RMSEE) of 0.396, 0.187and 0.22, respectively. Satisfactory results showed that, as new amino acid scales, data of HSEHPCSV may be a useful structural expression methodology'for the studies on peptide QSAR (quantitative structure-activity relationship) due to many advantages such as plentiful structural information, definite physical and chemical meaning and easy interpretation.
舒茂霍丹群梅虎梁桂兆张梅李志良
关键词:PEPTIDE
一种新型手性分子电性矩边矢量(Vmedc)的设计及其应用被引量:5
2008年
根据分子中不同类型原子间电相互作用的不同,文中提出了一种手性分子电矩边矢量(Vmedc),进一步拓展分子电矩边性矢量(Vmed)使用范围.为检测该手性描述矢量的结构表达特性和模型预测能力,分别对32个培哚普利拉类血管紧张素转化酶(ACE)抑制剂的对映结构体和7对苯基哌啶类σ-受体抑制剂进行考察.32个ACE抑制剂多元逐步回归系数R=0.913(R2=0.834,SD=0.768,F=33.875),留一法交互检验为Rcv=0.877(Rcv2=0.769,SDcv=0.906,Fcv=22.473),具有较强预测能力;继而用BP神经网络,对60组随机样本(23:9)进行留分法分析取得较好结果,训练集平均为:RTraining=0.931(RTraining2=0.967),预测集为:Rcv=0.918(Rcv2=0.842);而对14个σ-受体抑制剂多元回归(R=0.955,Rcv2=0.849)获得与文献一致结果.再用Fisher线性判别方法和BP神经网络对ACE抑制剂进行判别分析,其活性分类88.89%正确(仅9号错误),非活性分类100.0%正确,总分类正确率为96.87%.两个数据集测试证明该方法与其它文献方法相当,这为定量构效关系(QSAR)研究提供一种新选择,扩充了Vmed描述矢量应用范围。
陈国华夏之宁陆瑶廖立敏舒茂孙家英李志良
关键词:ACE抑制剂手性反传神经网络FISHER判别分析
皮质激素类手性药物的三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF)研究被引量:1
2009年
针对仅包含原子间拓扑连接信息而不包含原子间空间位置信息的2D拓扑描述子无法直接编码手性化合物的缺陷,本文采用本实验室基于受配体原子间弱相互作用而提出的三维原子场全息作用矢量(3D-HoVAIF)编码11对皮质激素类手性化合物。其多元线性逐步回归发现,由手性原子的手性变化而导致的分子空间结构变化,能够很好地被3D-HoVAIF描述子所描述,留一法交互检验得到最佳回归模型为:R^2=0.882,q^2=0.707。这充分说明3D-HoVAIF具备了比较好的对手性化合物的编码能力,为手性化合物的定量构效关系研究提供了一种新的研究方法选择。
陆瑶陈国华李志良
关键词:皮质激素QSAR手性
环己烯类神经氨酸酶抑制剂的定量构效关系研究被引量:2
2009年
研究了37个环已烯类神经氨酸酶抑制剂结构与其抗流感活性的定量构效关系。采用本实验室提出的三维原子场全息作用矢量对环已烯类神经氨酸酶抑制剂进行结构参数化表征,采用逐步回归对变量进行筛选后运用偏最小二乘回归建模。训练集模型的复相关系数(R^2)、交互校验复相关系数(Q_(cum)~2)和拟合均方根误差(RMSEE)分别为0.862,0.575和0.4864,预测集RMSEP为0.4435,模型具有良好稳定性和预测能力。结果表明三维原子场全息作用矢量能较好表征该类分子结构信息,值得进一步推广应用。
杨善彬杨云贵杨青林梁桂兆潘元舒茂李雷光李志良
关键词:定量构效关系偏最小二乘回归
三维全息原子场作用矢量用于猫爪草脂肪酸的构效关系研究被引量:2
2008年
运用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)对猫爪草中18种脂肪酸进行定量构效关系(QSAR)研究。采用逐步回归(stepwise multiple regression,SMR)进行变量筛选,偏最小二乘回归(partial least square regression,PLS)建立定量构效关系模型。所建模型复相关系数(R2cum)、留一法交互校验(CV)复相关系数(Qc2um)分别为0.977和0.946。结果表明,3D-HoVAIF能较好表征猫爪草中脂肪酸的结构信息,且所建模型具有较好稳定性和预测能力。
景举华肖尚友李志良
关键词:三维全息原子场作用矢量猫爪草脂肪酸定量构效关系
QSAR Study on Some N-[5-(2-Furanyl)-2-methyl-4-oxo-4H-thieno[2,3-d]pyrimidin-3-yl]-carboxamide and 3-Substituted-5-(2-furanyl)-2-methyl-3H-thieno-[2,3-d]pyrimidin-4-ones Using Three-dimensional Holographic Vector of Atomic Interaction Field被引量:1
2009年
Study on the quantitative structure-activity relationship (QSAR) of 26 compounds, N-[5-(2-furanyl)-2-methyl-4-oxo-4H-thieno[2,3-d]pyrimidin-3-yl]-carboxamide and 3-substituted- 5-(2-furanyl)-2-methyl-3H-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-ones, with three-dimensional holographic vector of atomic interaction field (3D-HoVAIF) was carried out. SMR-PLS QSAR models have been created and good correlation coefficients and cross-validated correlation coefficients were obtained. The result shows that the models have good prediction capability and favorable stability and the 3D-HoVAIF is applicable to the molecular structural characterization and biological activity prediction.
杨善彬夏之宁梅虎潘元杨青林许罗楠李志良
甲状腺激素受体配体化合物的三维定量构效关系研究被引量:1
2009年
目的研究68个甲状腺激素受体(TR)配体化合物的定量构效关系。方法采用三维原子场全息作用矢量对化合物进行了结构参数化表达,前55个样本为训练集,后13个样本为预测集,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关系模型。结果复相关系数和交互检验复相关系数R2=0.766,Q2=0.586(TRα);R2=0.754,Q2=0.593(TRβ)。结论模型具有良好的稳定性和预测能力,证明该三维原子场全息作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上的适用性,并可应用于潜在和新型的TR配体化合物的设计和开发。
潘元杨善彬梁桂兆舒茂许罗南杨青林夏之宁
关键词:定量构效关系
原子类型电拓扑指数在脂肪醇类化合物毒性预测研究中的应用被引量:6
2008年
采用原子类型电拓扑指数(ETSIAT)为结构描述子,对梨形四膜虫、番茄、红蜘蛛、发光细菌荧光素酶、呆鲦鱼以及鼠的脂肪醇毒性进行了定量构效关系(QSAR)研究.在偏最小二乘法建立QSAR模型的基础上,采用内部和外部两种验证方法对模型进行验证.研究结果表明:ETSIAT可以很好地表征脂肪醇与多种生物毒性相关的结构信息,所建模型具有良好的稳定性和外部预测能力.偏最小二乘模型分析结果显示:疏水性可能是影响脂肪醇毒性大小的主要因素,其毒性随C链长度的增加而增强,且相同C原子数的直链脂肪醇毒性明显高于支链脂肪醇;由于空间位阻效应,长链脂肪醇与短链脂肪醇可能存在不同的毒性作用机理。
刘丽梅虎皮喜田龙瑞才李建李志良
关键词:定量构效关系脂肪醇毒性
虚拟原子探针随机采样法用于氨基酸结构描述及其构效关系研究被引量:4
2007年
考虑药物与蛋白质受体的3类非键作用模式,利用8类虚拟原子探针和MonteCarlo随机采样技术,得到了一套新的氨基酸侧链表面静电、立体及疏水势能场(ASSPF)参数.在此基础上对苦味二肽和血管舒缓激五肽进行了结构表征和QSAR研究,所建模型复相关系数R2和留一法交互检验复相关系数Q2LOOCV分别为0·8457,0·851和0·7688,0·7952,同时分析了肽链不同位置上氨基酸侧链对活性的影响,取得较好的结果.
周原梅虎杨力周鹏杨善彬李志良
关键词:定量构效关系
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