江苏省水产三项工程项目(PJ2010-58) 作品数:18 被引量:89 H指数:7 相关作者: 张晓君 毕可然 阎斌伦 秦蕾 秦国民 更多>> 相关机构: 淮海工学院 中国矿业大学 江苏省海洋资源开发研究院 更多>> 发文基金: 江苏省水产三项工程项目 江苏省自然科学基金 江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
基于toxR基因病原哈氏弧菌PCR检测方法的建立 被引量:8 2011年 基于toxR基因序列设计检测哈氏弧菌的1对特异性引物,通过PCR反应条件优化、PCR反应特异性及敏感性检测,建立一种哈氏弧菌的特异性分子检测方法。试验结果表明,该引物可使哈氏弧菌扩增出大小为390 bp的toxR基因片段,3种水产动物病原弧菌未扩增出任何条带,敏感性检测结果为该PCR反应最低能检测出0.375 ng/μl的哈氏弧菌基因组DNA。该试验建立的基于toxR基因的哈氏弧菌的PCR检测方法可用于哈氏弧菌引起的水产动物疾病的快速诊断及海产品安全检测。 姚东瑞 朱明 陈丽 毕可然 史爱琴 张晓君关键词:哈氏弧菌 PCR检测 三疣梭子蟹病原副溶血弧菌的分离与鉴定 被引量:23 2010年 从养殖病死三疣梭子蟹肝胰脏及心脏血淋巴液中分离到大量优势生长的细菌,人工感染试验证明分离菌对三疣梭子蟹有较强的致病性;对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶及溶血素活性等表型生物学性状及16S rRNA和gyrB两种基因的分子鉴定。菌株(JGX080708-1)所扩增的16S rRNA基因序列长度为1453bp(GenBank登录号:FJ824663),所扩增的gyrB基因序列长度为1191bp(GenBank登录号:GQ372985);两种基因序列在NCBI通过blast检索,结果均与弧菌属细菌的基因序列自然聚类;根据分离菌的表型及分子特征,判定分离菌为弧菌属(Vibrio Pacini1954)的副溶血弧菌[Vibrio parahaemolyticus(Fujino et al1951)Sakazaki Nakamura and Takizawa1963]。分离菌的药敏试验结果显示,对供试49种抗菌药物中的安曲南等42种药物高度敏感,对林可霉素敏感,对青霉素G等6种药物耐药。 阎斌伦 秦国民 暴增海 张晓君 毕可然 秦蕾关键词:三疣梭子蟹 副溶血弧菌 16SRRNA基因 副溶血弧菌的SYBR Green Ⅰ实时定量PCR检测方法建立 被引量:5 2012年 基于副溶血弧菌gyrB基因保守序列设计1对特异性引物,建立SYBR GreenⅠ实时定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测副溶血弧菌的方法。SYBR GreenⅠ实时定量PCR的Tm为90℃,扩增产物的熔解曲线只出现1个单特异峰,无引物二聚体,表明该引物具有较好的特异性;所制作的实时定量PCR扩增标准曲线在2.06×108~2.06×103拷贝数之间有较好的线性关系,相关系数为0.992,能对副溶血弧进行准确的定量分析。该方法检测时间从核酸抽提到结果分析仅需4~5h,且较传统方法敏感、操作简单,可用于针对副溶血弧菌的进出口检验检疫、食品安全检测及该菌引起的水产动物疾病的诊断与分子流行病学调查。 张晓君 陈丽 毕可然 秦蕾 秦国民关键词:副溶血弧菌 SYBR 水产动物致病性副溶血弧菌双重PCR检测方法的研究 被引量:11 2010年 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是多种水产养殖动物的主要病原菌,尤其是可引起凡纳滨对虾幼虾呈毁灭性死亡。本研究基于gyrB和toxR两种基因序列设计2对特异性引物,建立一种副溶血弧菌快速、准确的双重PCR检测方法,扩增目的片段大小分别为285 bp和368 bp。结果表明在同一PCR反应体系中副溶血弧菌可同时扩增大小分别为285 bp和368 bp的2种基因片段,两种引物对4种其他水产动物病原菌无交叉反应;敏感性检测结果显示,该双重PCR最低能检测8.867 2×103 CFU/mL菌体浓度的副溶血弧菌,对副溶血弧菌模板DNA的检出极限为0.029 3 mg/L;对发病中国对虾糠虾幼体、水产品及虾池养殖用水进行双重PCR检测,呈阳性反应的样品可分离出优势生长的副溶血弧菌。该实验所建立的基于gyrB和toxR两种基因的双重PCR检测方法可用于副溶血弧菌引起的水产动物疾病的快速诊断及分子流行病学的调查研究。 张晓君 梁利国 阎斌伦 秦蕾 戚耀之关键词:双重PCR 基于tlh和toxR基因的副溶血弧菌双重PCR检测方法 被引量:2 2012年 为了研究副溶血弧菌双重PCR检测方法,试验采用tlh和toxR基因序列设计2对特异性引物进行双重PCR检测,扩增出450 bp和368 bp目的片段。结果表明:在同一PCR反应体系中仅副溶血弧菌可同时扩增出2种基因片段,4株对照菌无任何扩增条带;该双重PCR检测方法最低能检测1.660 7×103cfu/mL菌体浓度的副溶血弧菌。说明试验所建立的双重PCR检测方法特异性强、敏感性高、方法简单、用时短,可用于副溶血弧菌引起的水产动物疾病的诊断与分子流行病学调查。 白雪松 秦国民 阎斌伦 毕可然 秦蕾 高雨 张晓君关键词:副溶血弧菌 双重PCR 1株假交替单胞菌的分离与鉴定 被引量:2 2013年 2012年5月江苏连云港某育苗场日本对虾(Penaeus japonicus)蚤状幼体发生群体死亡,自幼体中分离到优势菌株XS-1。对菌株XS-1进行了形态特征、理化特性等表观生物学特性检验,并进行了16S rRNA基因的同源性检索与系统发育学分析。结果表明菌株XS-1具有假交替单胞菌属的特征,在系统发育树中与Pseudoalteromonas lipolytica聚为一个分支,自举值达100%。毒力试验表明,该菌对日本对虾蚤状幼体和仔虾的半数致死量(LD50)分别为1.3×106CFU/mL和2.0×106CFU/mL。综合菌株XS-1的形态特征、理化特性及16S rRNA基因的同源性检索与系统发育学分析,鉴定XS-1为P.lipolytica,且对日本对虾蚤状幼体及仔虾均具有毒力。药敏试验表明,该菌对阿奇霉素、环丙氟哌酸、头孢曲松、复方新诺明等11种药物敏感(S),对卡那霉素、苯唑青霉素、新生霉素耐药。 白雪松 张晓君 毕可然 樊星 阎斌伦 秦国民关键词:PSEUDOALTEROMONAS RRNA 基于toxR基因的SYBR GreenⅠ实时定量PCR检测病原副溶血弧菌方法的建立 被引量:8 2012年 基于副溶血弧菌toxR基因保守序列设计1对特异性引物,建立了SYBR GreenⅠ实时定量PCR检测副溶血弧菌的方法。常规PCR检测,副溶血弧菌扩增出大小为368bp的目的片段,其他4种病原细菌均为阴性;SYBRGreenⅠ实时定量PCR扩增曲线反映了PCR的指数增长阶段和平台阶段;在Tm为85℃,扩增产物的熔解曲线分析只出现1个单特异峰,无引物二聚体;所制作的标准曲线在2.7×108~2.7×102拷贝数之间有较好的线性关系,相关系数为0.998,能对副溶血弧菌进行准确的定量分析;该方法检测时间从核酸抽提到结果分析仅需4~5h,较传统方法敏感、操作简单,耗时短,是副溶血弧菌引起的水产动物疾病的快速诊断及食品中针对副溶血弧菌安全检测的有效手段。 张晓君 梁利国 阎斌伦 毕可然 秦国民关键词:副溶血弧菌 SYBR REAL-TIME 矛尾复虾虎鱼溃疡病病原创伤弧菌的鉴定 被引量:8 2011年 2009年8月江苏连云港赣榆县多家虾蟹养殖塘混养的矛尾复虾虎鱼(Synechogobius hasta)大量死亡,从病鱼深层溃烂组织及肝脏中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明分离菌对虾虎鱼的半数致死量(LD50)为1.63×106 cfu/g。对分离菌进行了形态特征、理化特性和分子生物学等方面的分析。一方面,分离菌株16S rRNA和gyrB基因序列的BLAST搜索及最大简约法分析均表明其与创伤弧菌(Vibrio vulnificus)亲缘关系最近;另一方面,分离菌革兰氏阴性,氧化酶阳性,葡萄糖发酵型。因此,引起江苏连云港赣榆县矛尾复虾虎鱼溃疡病病原菌是弧菌属的创伤弧菌。 毕可然 张晓君 梁利国 阎斌伦关键词:RRNA基因 基于lolB和toxR基因的水产品中霍乱弧菌双重PCR检测方法 被引量:4 2011年 选择lolB和toxR两种基因序列设计2对特异性引物,建立一种针对霍乱弧菌所有生物型菌株的双重PCR检测方法,扩增目的片段大小分别为519bp和779bp。结果表明:在同步扩增中,仅霍乱弧菌模板可同时扩增出2种基因片段,4株对照菌模板无任何扩增条带;敏感性检测结果显示,该双重PCR最低能检测3.42×103CFU/mL菌落数的霍乱弧菌。所建立的基于lolB和toxR两种基因的双重PCR检测方法特异性强、敏感性高、方法简单、用时短,可用于霍乱弧菌检测。 秦国民 张晓君 毕可然 阎斌伦 秦蕾关键词:霍乱弧菌 双重PCR 条斑紫菜褐斑病病原嗜冷杆菌的生物学特性 被引量:4 2012年 2010年2—3月,江苏北部一海区养殖的紫菜出现褐斑病,主要症状为紫菜叶片表面出现大量褐色斑点。紫菜叶片经清洗匀浆后接种于选择性培养基,从2216E培养基及褐藻酸钠固体培养基中分离出大量的优势生长细菌,人工感染试验结果证明分离菌能够使紫菜叶状体出现褐斑并分解藻体。对分离菌进行形态特征、生理生化特性及16S rRNA基因序列的系统发育学分析等鉴定,结果表明该菌为革兰氏染色阴性球杆菌,氧化酶阳性,接触酶阳性,其中,16S rRNA基因序列通过Blast检索,结果表明与嗜冷杆菌属细菌具有99%的同源性。综合分离菌的形态、生理生化特性及16S rRNA基因的系统发育学分析结果表明分离菌为嗜冷杆菌。 陈丽 白雪松 张晓君 秦蕾 毕可然关键词:紫菜 褐斑病 褐藻酸降解菌