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江苏省博士后科研资助计划项目(1101037C)
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
相关作者:
刘海军
陈克平
邱旭华
杨艳华
朱克明
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相关机构:
江苏大学
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发文基金:
转基因生物新品种培育专项
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1篇
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基于Make2D-DB Ⅱ构建水稻二维电泳-质谱联动数据库
2013年
基于Make2D-DB Ⅱ软件包构建了一个水稻二维电泳-质谱联动数据库Rice2DDB,介绍了该数据库的构建方法和步骤,为快速发展的水稻蛋白质组学研究提供了数据管理和交流的平台,对其他物种的蛋白质组学研究也具有参考价值。
刘海军
朱克明
杨艳华
邱旭华
陈克平
关键词:
水稻
二维电泳
数据库
II
利用EST序列构建Mascot本地数据库
被引量:1
2012年
对蛋白质质谱数据进行数据库比对和鉴定是蛋白质组学研究技术中的一个重要步骤。由于公共数据库蛋白质数据信息不全,有些蛋白质质谱数据无法得到有效的鉴定。而利用相关物种的EST序列构建专门的质谱数据库则可以增加鉴定未知蛋白的几率。本文介绍了利用EST序列构建Mascot本地数据库的具体方法和步骤,扩展了Mascot检索引擎对蛋白质质谱数据的鉴定范围,从数据库层面提高了对未知蛋白的鉴别几率,为蛋白质组学研究提供了一种较为实用的生物信息学分析技术。
刘海军
陈克平
关键词:
蛋白质组学
EST序列
MASCOT
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