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湖北省教育厅青年基金(Q20082201)
作品数:
1
被引量:14
H指数:1
相关作者:
陈国庆
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相关机构:
湖北师范学院
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陈国庆
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2011
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番红花EST资源的SSR信息分析
被引量:14
2011年
从NCBI公共数据库下载得到6745条番红花EST,通过前处理得到全长为612.01kb的无冗余EST1431条。在这些序列中搜索出108个SSR,分布于103条EST中,出现频率为7.55%。这些EST-SSR的平均分布距离是5.67kb。二核苷酸重复和三核苷酸重复是番红花主要的重复类型,分别占总EST-SSR的30.56%和37.96%。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸重复中的优势基元,分别占二、三核苷酸重复的66.67%和29.27%。本研究为番红花EST-SSR标记的建立和进一步应用奠定了基础。
陈国庆
关键词:
番红花
药用植物
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EST-SSR
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