国家自然科学基金(30871918)
- 作品数：3 被引量：10H指数：2
- 相关作者：陈松林王磊田永胜廖小林王磊更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所上海海洋大学华中农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划山东省“泰山学者”建设工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 牙鲆回交、全同胞近交及其亲本家系的微卫星研究被引量：3
- 2011年
- 应用10对微卫星引物对2007年建立的抗病家系之一（将其定义为亲本家系）及其回交家系和全同胞近交家系进行分析,结果发现10个位点的等位基因数为1.7~3.0,平均等位基因数为2.3,有效等位基因数为1.553 2~2.887 8,平均有效等位基因数为2.054 1,杂合度观测值为0.307 0~0.664 8,平均杂合度观测值为0.487 0,无偏期望杂合度值为0.200 0~0.606 8,平均无偏期望杂合度值为0.606 8,多态信息含量为0.233 4~0.579 4,平均多态信息含量为0.399 5,3个家系均为中度多态,多态信息含量从大到小依次为：亲本家系、回交家系、全同胞近交家系,其中Poli194TUF位点在全同胞近交家系中发生纯合。家系间的遗传分化系数为0.067 1,表明遗传变异有6.71%来自于家系间,家系间分化较低。根据家系间的遗传距离,利用UPGMA法进行聚类,亲本家系和全同胞近交家系聚为一类。全同胞近交家系纯化基因速率较快,适合牙鲆品系的快速建立。
- 王磊王磊陈松林田永胜
- 关键词：牙鲆家系回交近交微卫星
- 牙鲆微卫星标记的开发及多态性分析
- 2011年
- 将牙鲆基因组DNA经限制性内切酶RsaⅠ和Bst UI双酶切后采用FIASCO法构建酶切片段基因组文库。共挑取269个克隆,177个为阳性克隆,阳性克隆率为65.79%。经测序后获得191条微卫星序列,其中完美型占74.35%;非完美型占14.66%;混合型占10.99%。用引物设计软件Primer Premier 5.0设计引物153对,挑选其中的50对合成并在32个野生牙鲆个体中进行扩增,共31个位点具有多态性,统计结果后使用POPGENE软件进行分析,平均等位基因个数为3.939 4,平均有效等位基因数为3.052 2,平均观测杂合度为0.650 1,平均期望杂合度为0.586 6,各引物的Hardy-Weinberg平衡指数在0.012 587～0.984 917变动。这些筛选出的多态性微卫星标记可应用于进一步的牙鲆遗传多样性分析、家系分析及遗传图谱的构建等工作中。
- 张潇珺徐亘博廖小林张家波陈松林
- 关键词：牙鲆微卫星FIASCO多态性
