博士科研启动基金(09001377)
- 作品数:4 被引量:25H指数:3
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- 珍稀濒危植物珙桐与其变种光叶珙桐的差异初探被引量:5
- 2012年
- 为系统鉴定珙桐与其变种光叶珙桐的差别,从形态学观察的层面,结合ISSR、AFLP2种分子标记技术,综合分析珙桐和光叶珙桐的差别。结果表明,在形态学层面,该种与其变种的叶片存在一定的形态差异,但花、果等器官未见不同;以52个珙桐个体和60个光叶珙桐个体为材料,10条ISSR引物、7组EcoRI/MseI引物的AFLP检测未筛选到两者的差异标记,UPGMA聚类分析亦不能将其彼此分离;本研究显示珙桐与光叶珙桐的差别仅在其叶片的形态特征方面,分子层面是否存在差异还有待进一步研究确定。
- 李雪萍朱文琰贺春玲高水平李在留
- 关键词:光叶珙桐叶片ISSRAFLP
- 珙桐遗传多样性的AFLP分析被引量:14
- 2012年
- 采用7对AFLP引物对中国珍稀濒危植物珙桐(Davidia involucrata Baill.)的6个天然居群和2个人工居群的229份材料进行扩增,共检测到100~500bp的位点506个,其中多态性位点488个,多态性位点百分率96.44%;各居群多态位点百分率为52.77%~79.25%,平均为67.00%。在物种水平上,珙桐的Nei’s基因多样性Hs=0.3429,Shannon’s遗传多样性信息指数I=0.5107。而居群水平上,各居群的Nei’s基因多样性介于0.2229~0.3389,各居群的平均Nei’s基因多样性Hs=0.2748,各居群Shannon’s遗传多样性信息指数(I)介于0.3219~0.4877,平均Shannon’s遗传多样性信息指数I=0.3995。居群间基因间分化度(Gst)为21.60%,基因流Nm为1.8。说明珙桐的遗传多样性较高,这8个居群间存在一定的遗传分化和基因流动,但遗传分化主要存在于居群内。在珙桐与其变种光叶珙桐之间未找到差异标记。
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- 关键词:AFLP居群遗传分化
- 濒危植物珙桐AFLP反应体系的建立及引物筛选被引量:2
- 2012年
- 为研究不同生境下珙桐(Davidia involucrata Baill.)的遗传多样性,以珙桐叶片为材料优化建立珙桐的AFLP反应体系。对酶切与连接中DNA的浓度、预扩增的引物、选择扩增中Mg2+和dNTPs的浓度进行梯度比较分析。结果显示,酶切与连接过程中DNA的浓度变化对结果影响不大,预扩增的引物是否带有选择碱基对结果影响明显,选择扩增中dNTPs浓度的变化对最终谱带影响不大,而Mg2+浓度变化会对最终谱带产生影响,以1.75 mmol/L为宜。采用优化后的体系,从12对Mse I、EcoR I引物的144组AFLP选择扩增引物组合中筛选出能够得到清晰扩增谱带的7组引物组合,为今后的研究奠定了基础。
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- 关键词:INVOLUCRATAAFLP引物筛选
- 濒危植物珙桐遗传多样性与遗传结构的ISSR分析被引量:6
- 2012年
- 采用10条ISSR引物对我国珍稀濒危植物珙桐的6个天然居群和2个人工居群的229份材料进行分析,共检测到127个分子量在200~2 000 bp之间的位点,其中多态性位点119个、多态位点百分率93.81%;各居群多态位点百分率在40.21%~76.29%之间,平均为58.64%。物种水平上,珙桐的Nei’s基因多样性Hs=0.3013,Shannon’s遗传多样性信息指数I=0.4566。居群水平上,各居群的Nei’s基因多样性介于0.1491~0.2690之间,各居群的平均Nei’s基因多样性Hs=0.2191,各居群的Shannon’s遗传多样性信息指数(I)介于0.2200~0.4028之间,平均Shannon’s遗传多样性信息指数I=0.3232。居群间基因间分化度(Gst)为26.27%,基因流Nm为1.4。结果显示珙桐的遗传多样性较高,8个居群间存在一定的遗传分化和基因流动,但遗传分化主要存在于居群内。
- 李雪萍郑雪朱文琰贺春玲高水平
- 关键词:ISSR居群遗传分化