博士科研启动基金(2006D005)
- 作品数：3 被引量：10H指数：2
- 相关作者：杜立新张传生耿立英陈红菊付志新更多>>
- 相关机构：河北科技师范学院中国农业科学院北京畜牧兽医研究所山东农业大学更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 鸡cvh启动子调控的绿色荧光蛋白报告载体的构建及鉴定
- 2009年
- 探索建立一种用绿色荧光蛋白对鸡原始生殖细胞进行标记分离的方法。克隆并测序鸡原始生殖细胞特异表达基因cvh1.6kb启动子序列。序列分析表明它含有类似于TATAbox和CAATbox的元件,在其远端上游区域还有多个GC富含区。将cvh基因启动子亚克隆到绿色荧光蛋白表达载体pegfp-1的多克隆位点,成功构建表达载体pcvh-egfp。重组质粒在脂质体LipofectamineTM2000介导下分别转染鸡Ⅹ期胚盘细胞和鸡胚成纤维细胞,并于转染后12h在荧光显微镜下观察转染效果。实验结果显示:在胚盘细胞转染后12h可观测到绿色荧光表达,转染后24h荧光细胞增多,细胞形态均呈圆形、体积较大;在鸡胚成纤维细胞未检测到gfp表达。实验结果说明,由cvh基因启动子控制下的gfp可在Ⅹ期胚盘细胞特异表达,为利用流式分离技术PGCs标记分离、纯化研究奠定基础。
- 耿立英张传生杜立新陈红菊沈萍付志新
- 关键词：启动子绿色荧光蛋白胚盘细胞
- 家鸡基因组pre-microRNA SNP多态性分析与研究
- ＜正＞引言本研究对鸡pre-microRNA及其侧翼区SNP位点进行了鉴定,利用生物信息技术估计SNP对pre-microRNA二级结构稳定性和microRNA靶基因选择的影响,分析不同区域SNP潜在的功能重要性,为鸡m...
- 张传生耿立英刘铮铸冯敏山杜立新
- 关键词：单核苷酸多态性
- 文献传递
- 鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测被引量：4
- 2008年
- GDF-8、IGF-I、IGF-III、IGF2R、IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因。利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3′UTR潜在的microRNA靶标,并发掘靶标区域SNP位点。结果表明:在6个基因的26个microRNA靶标区域,共检测到125个SNP位点,在靶标及其5′和3′邻接等长侧翼区分别检测到47个、44个和35个SNPs位点,其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区。种子序列互补区及其3′侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控,导致家禽的表型变异。
- 耿立英张传生杜立新
- 关键词：非翻译区小RNA生物信息学单核苷酸多态性
- 鸡基因组pre-microRNA SNP多态性被引量：8
- 2009年
- 为探讨鸡pre-microRNA SNP的多态性及其可能的功能意义,对鸡471个pre-microRNA区域的SNP位点进行了鉴定和生物信息学分析。结果表明:pre-microRNA的SNP多态性显著地低于其侧翼区(P<0.01=,其种子区SNP变异对pre-microRNA二级结构稳定性的影响高于其他各区;microRNA成熟体SNP可能影响microRNA对靶基因的选择。研究结果提示:pre-microRNA相对于其侧翼区在分子进化过程中受到更大的选择压力;成熟体SNP可通过影响microRNA加工和靶基因的选择,改变多种生理过程,导致鸡种间表型变异。研究结果将为鸡microRNA的进化模式研究及其功能性SNP的鉴定提供参考信息。
- 耿立英张传生杜立新
- 关键词：小RNA生物信息学单核苷酸多态
