北京市自然科学基金(7132025)
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
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- 低氧预适应和大脑中动脉阻塞小鼠脑内差异microRNAs鉴定被引量：3
- 2013年
- 目的探讨低氧预适应(hypoxic preconditioning,HPC)和大脑中动脉阻塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)对小鼠脑内microRNAs表达的影响。方法借助已建小鼠整体HPC和脑MCAO模型,应用miRNA芯片方法观察HPC小鼠脑皮层和MCAO小鼠脑缺血半影区内miRNAs的差异表达。结果在656个miRNAs探针中,与Control组相比,HPC组小鼠脑皮层组织内鉴定出17个miRNAs的表达发生了明显改变。与Sham组相比,MCAO小鼠脑缺血半影区内鉴定出65个miRNAs的表达发生了显著变化(P<0.05,n=12)。与MCAO小鼠脑缺血半影区相比,HPC+MCAO组小鼠脑缺血半影区内有33个miRNAs的表达发生明显变化(P<0.05,n=12)。基于Diff Score=±13(P=0.05),得到19个特定的miRNAs。随后,选取4个miRNAs使用实时定量RT-PCR验证HPC和MCAO小鼠脑组织内的miRNAs差异表达。结论 19个miRNAs在HPC和MCAO致局部脑缺血小鼠脑内表达发生明显变化,提示其可能在HPC诱导的脑神经保护过程中发挥重要作用。
- 李冬果韩松刘翠英李俊发
- 关键词：低氧预适应大脑中动脉阻塞微小RNA微阵列
- 基于KEGG通路富集分析的缺血/低氧预适应鼠脑内PKC亚型特异性信号通路研究被引量：1
- 2013年
- 目的探讨参与脑缺血/低氧预适应(I/HPC)形成的cPKC!II,",nPKC#特异性信号网络和参与I/HPC脑神经保护作用的功能模块。方法在蛋白质组学技术鉴定出参与脑I/HPC形成机制的cPKC!II、"和nPKC#相互作用蛋白基础上,利用通路富集、网络构建等生物信息学方法,分析特异性信号通路。结论 PKC亚型共同调控代谢相关通路。
- 韩松李俊发李冬果
- 关键词：缺血低氧预适应蛋白激酶C基因本体论
- 蛋白激酶Cγ在低氧预适应脑保护中的作用及其缺血性卒中鼠脑半影区内相互作用蛋白鉴定被引量：4
- 2013年
- 目的验证经典型蛋白激酶C(conventional protein kinase C,cPKC)γ在低氧预适应(hypoxic preconditioning,HPC)诱导缺血脑保护中作用,同时利用HPC和cPKCγ阻断剂,鉴定脑缺血半影区内参与cPKCγ脑保护的信号蛋白。方法将健康成年雄性BALB/c小鼠,按数字表法随机分为常氧假手术(Sham)、常氧缺血(Ischemia,I)、二甲基亚砜溶剂处理后缺血(DMSO+I)、HPC预处理后缺血(HPC+I),以及cPKCγ抑制剂和HPC预处理后缺血(HPC+Go6983+I)等5组。应用小鼠整体HPC和脑中动脉阻塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)致缺血性脑卒中模型,借助蛋白印迹检测cPKCγ膜转位(激活)水平,2,3,5-氯化三苯基四氮唑(2,3,5-triph-enyltetrazolium chloride,TTC)染色观察脑梗死体积。采用cPKCγ免疫共沉淀、双向凝胶电泳和质谱等技术鉴定脑缺血半影区内cPKCγ相互作用蛋白结果。结果与常氧缺血I组相比,HPC+I组缺血核心区和半影区内cPKCγ膜转位水平明显增高,而cPKCγ抑制剂Go6983预处理则明显降低HPC+Go6983+I组缺血核心、半影区和对侧脑皮层内cPKCγ的膜转位水平(P<0.05,每组n=6)。cPKCγ抑制剂Go6983明显减弱HPC降低缺血性卒中小鼠脑梗死体积的保护作用(P<0.05,每组n=6)同时。Go6983明显抑制HPC+I组小鼠脑缺血半影区内cPKCγ与部分蛋白的相互作用,包括铜/锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn superoxide dismutase,SOD)、DJ-1、UMP-CMP激酶、腺苷酸激酶、泛素末端水解酶(ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1,UCHL1)、白介素-16(interleukin-16,IL-16)和热休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)。结论cPKCγ通过对缺血半影区内部分相互作用蛋白的调节,参与HPC对缺血性卒中小鼠脑的神经保护作用。
- 韩松张楠尹艳玲赵丽罗艳琳李俊发
- 关键词：低氧预适应蛋白组学
- 复杂疾病风险基因模块识别及其调控机制研究
- 2013年
- 类风湿性关节炎(RA)是一种自体免疫性复杂疾病,它由遗传因素和环境因素共同作用所决定。目前RA的发病及调控机制仍然不明确。本研究从系统层面提出了一个新的方法框架,利用已知的调控信息及功能关系来解释遗传因素。本研究基于全基因组关联研究(WTCCC)数据,结合SNPs基因型数据、通过UCSC基因组数据库,将风险SNP映射到各基因,并将基因映射到蛋白质互作网络进行风险基因定位与风险分析,发现大多数关键调控基因与RA有关。对每个风险基因模块,利用Transfac数据库探讨了这些基因与它们相应转录因子间调控机制,所获结果将为临床提供有益的借鉴。
- 李冬果华琳李林
- 关键词：SNP蛋白质互作网络
