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国家自然科学基金(30471096)

作品数:4 被引量:46H指数:3
相关作者:李英慧邱丽娟常汝镇刘章雄关荣霞更多>>
相关机构:中国农业科学院作物科学研究所河南省农业科学院中国农业科学院油料作物研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇大豆
  • 1篇新种质
  • 1篇遗传多样性分...
  • 1篇育成
  • 1篇育成品种
  • 1篇种质
  • 1篇线虫
  • 1篇线虫病
  • 1篇抗性
  • 1篇抗性候选基因
  • 1篇基因
  • 1篇候选基因
  • 1篇胞囊
  • 1篇胞囊线虫
  • 1篇胞囊线虫病
  • 1篇SNP
  • 1篇SNP分型
  • 1篇SSR
  • 1篇SSRS
  • 1篇SSR标记

机构

  • 3篇中国农业科学...
  • 1篇河南省农业科...
  • 1篇吉林省农业科...
  • 1篇南京农业大学
  • 1篇山东省农业科...
  • 1篇山西省农业科...
  • 1篇浙江省农业科...
  • 1篇黑龙江省农业...
  • 1篇中国科学院遗...
  • 1篇中国农业科学...

作者

  • 3篇常汝镇
  • 3篇邱丽娟
  • 3篇李英慧
  • 2篇关荣霞
  • 2篇刘章雄
  • 1篇杨光宇
  • 1篇袁翠平
  • 1篇朱保葛
  • 1篇周新安
  • 1篇李卫东
  • 1篇南海洋
  • 1篇孙君明
  • 1篇徐冉
  • 1篇刘学义
  • 1篇朱申龙
  • 1篇赵团结
  • 1篇刘燕
  • 1篇魏淑红

传媒

  • 2篇作物学报
  • 1篇大豆科学
  • 1篇Agricu...

年份

  • 1篇2010
  • 1篇2009
  • 2篇2007
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
基于大豆胞囊线虫病抗性候选基因rhg1的InDel标记开发与鉴定被引量:24
2009年
大豆胞囊线虫病是严重危害大豆生产的重要病害之一,根据抗病候选基因开发标记可为分子标记辅助选择抗病材料提供标记资源。本研究通过对大豆胞囊线虫抗性候选基因rhg1的序列比对分析,发现4个插入/删除位点,针对其中3个多碱基插入/缺失位点开发了InDel标记。应用开发的3个InDel标记对33份栽培大豆进行基因型鉴定,共检测到等位变异11个,平均每个位点3.67个。其中rhg1-I1位点有等位变异5个,rhg1-I2位点有等位变异2个;rhg1-I4位点有等位变异4个。各等位变异发生频率范围为0.8%~77.3%。InDel标记与大豆胞囊线虫抗性间的关联分析表明,rhg1-I4为抗性相关标记,对抗病资源的检出效率为88.2%,对感病资源的检出效率为100%。该标记的288bp等位变异和294bp等位变异为抗病相关等位变异,269bp等位变异和272bp等位变异为感病相关等位变异。此标记与常用于标记辅助选择的Satt309配合鉴定可以提高SCN抗病资源的检测效率。
南海洋李英慧常汝镇邱丽娟
关键词:大豆胞囊线虫病INDEL标记
“十五”大豆创新种质和1963—1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析被引量:11
2007年
对22份"十五"攻关培育的创新种质和22份大豆育成品种进行了24个SSR标记的分析比较,目的是在分子水平上阐明创新种质的遗传结构特点,为拓宽我国大豆育成品种遗传基础及亲本选择提供理论依据。本研究在24个SSR位点共检测出231个等位变异,其中15.8%(36个等位变异)为创新种质所特有,特别是在与大豆胞囊线虫紧密连锁的Satt309位点上验证了一个我国独有的等位变异。结合UPGMA和Model-based聚类结果,将创新种质和育成品种分为4组,第Ⅰ组由13份来自东北和山西的创新种质组成;第Ⅱ组由8份来自东北的育成品种组成;第Ⅲ组由8份来自黄淮海和南方的大豆种质组成,其中创新种质和育成品种各为4份;第Ⅳ组由4份育成品种组成,分别来自吉林、黑龙江、河南和山西。遗传多样性分析结果表明,利用国外种质和野生大豆创造的创新种质丰富了东北地区育成品种的遗传多样性。因此,应加强利用国外种质、我国栽培大豆地方品种和野生大豆等优异资源,在创造优异大豆新种质的同时,拓宽我国大豆的遗传基础。
李英慧刘燕关荣霞魏淑红杨光宇周新安张孟臣杨春燕朱保葛李卫东刘学义徐冉孙君明朱申龙赵团结刘章雄常汝镇邱丽娟
关键词:创新种质育成品种SSR标记
Analysis of SSRs Uncovers Hierarchical Structure and Genetic Diversity in Chinese Soybean Landraces被引量:2
2010年
For clarifying the hierarchical patterns of population structure of soybean landraces in China, the seven clusters previously identified using Bayesian clustering of 1 504 soybean landraces based on SSR markers genotyping data were further analyzed. Using the largest value of AK, these landraces could be split into 20 sub-clusters, which was supported by highly significant pairwise Fst-values and generally in accordance with the geographic origin and sowing types. The autumn-sowing types ended up in one distinct sub-cluster from the otherwise summer-sowing type, where the autumn- sowing types are most likely derived from. The division into 20 sub-clusters explained 7.3% of the genetic variation, next to 9.7% present among the seven clusters, 81.1% residing among landraces within sub-clusters, and 1.9% within the landraces. The distribution pattern of genetic diversity among the sub-clusters of each cluster was uneven, with two HSuM sub-clusters (Central China) and some South China sub-clusters showing significantly higher level of genetic diversity.
LI Ying-huiMarinus J M SmuldersCHANG Ru-zhenQIU Li-juan
关键词:SOYBEANLANDRACEDIVERSITY
一种大豆SNP分型新方法被引量:10
2007年
单核苷酸多态性(SNP)在大豆基因组中分布广泛,SNP分型是大豆SNP遗传作图,关联分析、分子标记辅助选择等研究的重要技术。本文以Rhg4基因开发的5个SNP为例,介绍了一种大豆SNP分型的新方法-片段长度差异等位基因特异性PCR(FLDAS-PCR)。采用AS-PCR原理,针对某个SNP位点设计2条相差4-5bp的特异引物和1个公用引物,PCR产物约100bp或150bp,2种等位基因型PCR产物相差4-5bp,在2个特异引物3′端第3和4碱基位置分别人为引入错配碱基来提高PCR特异性,通过6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳可将纯合和杂合基因型检测出来。探讨了特异引物浓度和退火温度对Rhg4-1592扩增效果的影响,研究表明,可通过调整特异引物浓度和退火温度优化扩增效果。FLDAS-PCR对18份种质分型结果与PCR产物克隆测序法一致,表明本研究建立的FLDAS-PCR法是一种简便、快捷、新型的大豆SNP分型方法。
袁翠平李英慧刘章雄关荣霞常汝镇邱丽娟
关键词:大豆SNP
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