国家自然科学基金(30471098) 作品数:10 被引量:65 H指数:5 相关作者: 刘忠松 严明理 官春云 刘显军 陈社员 更多>> 相关机构: 湖南农业大学 湖南科技大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 教育部科学技术研究重点项目 湖南省教育厅重点项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 理学 更多>>
用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的快速提取 被引量:3 2008年 通过对所提DNA质量、效率和PCR检测,建立和优化了可用于PCR分析的芥菜型油菜总DNA的提取方法,这一方法快速,所提的DNA质量好,可在芥菜型油菜生长发育早期进行。 严明理 刘忠松 官春云 刘丽莉关键词:芥菜型油菜 PCR分析 一种提取高质量油菜种子和种皮RNA的方法 被引量:5 2007年 提取高质量的RNA是从基因表达水平上研究油菜种子和种皮发育的必要条件。现有方法因为油菜种子脂肪、多酚和多糖,难以快速获得完整、高纯度的油菜种子总RNA。本试验针对油菜种子和种皮特点,利用苯酚-氯仿抽提后用无水乙醇沉淀RNA,建立了在油菜种子和种皮中快速提取高质量总RNA的提取方法,电泳分析表明28S rRNA亮度约为18S rRNA的2倍;紫外分光光度计检测A260/A280介于1.8~2.0之间。用该法分离的RNA,已成功用于RT-PCR、Northern blot分析和基因全长的克隆等分子生物学研究。 严明理 刘忠松 官春云 陈社员 刘显军关键词:RNA提取 油菜 种子 芥菜型油菜B03染色体黄籽基因区域BAC重叠群的构建及分析 被引量:1 2016年 在前人研究中,芥菜型黄籽基因被定位到B03连锁群的1.5 c M区域内。本试验利用与B03染色体控制黄籽基因区域紧密连锁的unigene(通过RNA_seq技术获得的芥菜型油菜种皮的非冗余基因)和BESs开发标记,并对芥菜型油菜作图群体亲本紫叶芥BAC文库(ZBju H BAC文库)进行筛选,由开发的320对引物共筛到BAC920个,对其中483个BACs进行了末端测序,返回序列860条。构建了6段芥菜型油菜B03染色体黄籽区域BAC重叠群,共计长约3.3 Mb;通过BES blast分析表明,在B03染色体黄籽区域与A03、A09染色体存在高度的重复序列。 徐海鹏 刘显军 陆赢 马鹏 胡庆一 刘忠松关键词:芥菜型油菜 芥菜型油菜黄籽性状的遗传、基因定位和起源探讨 被引量:24 2009年 油菜种皮颜色既是一个形态指示性状,又与种子休眠和品质有关。以芥菜型油菜种皮颜色分离的2个BC6F2群体为作图群体,用微卫星(SSR)等标记进行连锁定位,并用定位标记对22份材料进行关联分析,通过反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)分析12份材料种皮中4-二氢黄酮醇还原酶(DFR)、花色素合酶(ANS)和花色素还原酶(ANR)基因的表达,对6份黄籽材料的种皮颜色基因等位性进行测定,结果将芥菜型油菜控制种皮颜色的2个基因位点分别定位到A9和B3连锁群,并找到其两侧紧密连锁标记,发现黄籽材料种皮颜色基因位点附近0.9cM和1.5cM区域高度保守,所有黑色种皮中DFR、ANS和ANR基因均表达,所有黄色种皮中DFR和ANS均不表达,但ANR基因表达或不表达,黄籽材料的种皮颜色基因等位。根据这些结果结合前人研究,认为芥菜型油菜种皮颜色基因是调控基因,黄籽为单一起源。 刘显军 袁谋志 官春云 陈社员 刘淑艳 刘忠松关键词:芥菜型油菜 种皮颜色 基因定位 基因表达 甘蓝型油菜黄籽育种研究进展 被引量:5 2008年 综述了油菜种皮颜色的形成、种皮色泽的遗传、黄籽性状的分子标记和黄籽甘蓝型油菜选育等方面的研究进展。提出采用新的方法创造黄籽种质资源,同时加强油菜种皮色泽形成的生物合成途径的研究和分子生物学研究,把芥菜型油菜等的黄籽基因转入到农业性状伏良的甘蓝型油菜中,从而获得黄籽性状能稳定遗传的甘蓝型油菜新品种。 严明理 刘忠松 官春云 陈社员关键词:油菜 种皮 色素 分子标记 育种 芥菜型油菜黄黑种皮色泽特征的分析化学研究 被引量:3 2006年 以经多代自交选育的芥菜型油菜自交系黄黑籽种皮为材料,采用改进的方法测定了其中可能影响种皮色泽的化学成分的相对含量。结果表明,黑/黄种皮花色素、黑色素和木质素含量之比依次为3.26/1、3.73/1、3.02/1,该3种成分均是种皮色泽差异的特征成分;芥菜型黄种皮多酚含量约是甘蓝型的8倍,表明种皮多酚含量相当高是芥菜型黄籽油菜的显著特征。黑/黄种皮多酚含量之比为1.16/1,但黑皮样对香草醛变红色而黄种皮没有变色,表明黑/黄种皮多酚的分子结构存在差异。 曾盔 刘忠松 严明理 曾笑关键词:芥菜型油菜 种皮色泽 花色素 黑色素 芥菜型油菜TT1基因的克隆和SNP分析 被引量:10 2010年 拟南芥的TT1基因(编码含有WIP结构域的锌指蛋白)对种皮的发育和颜色的形成具有重要的调控作用。本研究利用同源克隆和RACE技术分离了芥菜型油菜TT1基因,在芥菜型油菜黄黑籽材料的种皮中进行转录水平的分析,比较了黑籽油菜与黄籽油菜基因序列的差异,并采用等位基因特异(allele-specific)PCR技术对可能存在的单核苷酸多态位点进行验证。结果表明,芥菜型油菜TT1基因的DNA序列全长为2197bp,包含1个内含子,与甘蓝型油菜TT1-1基因的DNA序列的相似性为99%,与拟南芥的TT1基因DNA序列的相似性为85%;推导的TT1蛋白序列为300氨基酸残基,理论分子量为33.97kD,等电点为6.99;TT1在所有材料的种皮中均检测到表达;比较紫叶芥、四川黄籽、NILA和NILB的TT1基因序列,共发现8个核苷酸变异位点,均在基因的外显子区域,其中紫叶芥和NILA的序列相同,四川黄籽和黒籽近等基因系NILB的序列相同。与紫叶芥相比,黒籽近等基因系NILB有8个核苷酸差异,但种皮颜色与紫叶芥一样,均为黑色,TT1基因这些位点的突变并不影响芥菜型油菜种皮的颜色。通过等位特异PCR可以区分来自四川黄籽与紫叶芥的TT1基因。 严明理 刘显军 官春云 刘丽莉 陆赢 刘忠松关键词:芥菜型油菜 克隆 单核苷酸多态性 芥菜型油菜黄黑种皮多酚差异的紫外-可见光谱研究 被引量:11 2007年 以芥菜型自交系黄黑油菜种皮为材料,研究了其多酚提取液的紫外-可见吸收光谱,测定了芥菜型油菜黄黑种皮样以没食子酸和茶叶儿茶素标准计的多酚含量,发现黄种皮的多酚含量约为黑种皮的90%,显著区别于甘蓝型油菜的10%,因此多酚含量高可能是芥菜型黄籽油菜性状稳定的根本内因。基于香草醛试验,推测黑种皮中含有3-OH的黄烷醇类多酚,而黄种皮中没有。基于加入位移试剂后特征吸收谱带Ⅰ与Ⅱ的位移方向与大小,推测黄酮醇类多酚A环在黄种皮中可能主要为单酚羟基,而在黑种皮中可能主要为邻二酚羟基结构。这种多酚分子的结构差异可能是形成芥菜型油菜黄黑种皮色泽差异的主要原因。 曾盔 刘忠松 龙桑 严明理关键词:芥菜型油菜 种皮色泽 多酚 紫外-可见光谱 芥菜型油菜种皮颜色的遗传和SCAR标记 为探明芥菜型油菜种皮颜色遗传,以芥菜型油菜黄色种皮四川黄籽自交系和棕色种皮紫叶芥自交系为亲本杂交,观察了杂种 F,F和与四川黄籽回交的 BC和 BC代种皮颜色的分离,结果表明芥菜型油菜种皮棕色对黄色为显性,种皮颜色由2独... 严明理 刘忠松 官春云 陈社员关键词:芥菜型油菜 种皮颜色 分子标记 文献传递 芥菜型油菜类黄酮合成相关基因的克隆和序列分析 被引量:8 2007年 【目的】分离和克隆芥菜型油菜类黄酮合成相关基因。【方法】采用同源克隆基因的方法,参照拟南芥等植物控制类黄酮合成的基因保守序列设计引物,对扩增片段进行测序并进行BLAST分析。【结果】有13对引物扩增的17个基因拷贝与参考基因序列相符,这些克隆属于13个已知功能基因,其中查尔酮合成酶基因有3个不同的基因拷贝,花色素形成(Production of anthocyanin pigment)基因和查尔酮异构酶基因分别有2个不同的基因拷贝,其余引物的扩增只获得一个拷贝。在GenBank数据库中进行检索表明,所克隆的基因拷贝中的DNA结合/转录因子基因(TT2、TT8、TTG2)、花色素形成基因(PAP)和黄烷酮-3-羟化酶基因(TT6),在芸薹属植物中未见报道。【结论】克隆芥菜型油菜类黄酮合成相关基因拷贝为阐明油菜种皮颜色形成的遗传调节奠定了基础。 严明理 刘忠松 官春云 陈社员 刘显军 袁谋志关键词:芥菜型油菜 类黄酮 基因